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  1. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S54...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S543251.g20862.01.t

Possible name(s)

CHSY1; CHSY3; CSGALNACT1

Location

S543251 [21,155 / 24,329]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 551

>Moocci.CG.ELv1_2.S543251.g20862.01.p
MYDYHIDDYEWFVQLSDDIYIDYDQLNILLRTLNSTKPILLVSPGFNLNDNDGNNSDGRN
NIDSFIMVLNRILLIQLRPHLRHCIRNMFTANQNIEIIRCISKYTNAIISNLPKNNVLTE
FDVNSNEPIILGNKSSESVYPTITRISATETWMYFTNFYFYQPLDNLLPFRNDMLNIRSG
QSKAERALFSMLLQELKEKVTDDYCLNTAARTFKYEGVRFVVVYQTEDFKHCTIMCEMSY
SVTQLLEENKLPSINQMISYYYNNNNKTNFAFNLFQSDLLINSEFSEDKGKVVFIIPLQG
RYKTLENFLKNYEKQYLQSLKSNDNVKVKLAVIVMLNDATDESGINRASIHLLENYQIKY
GSDAVFYHVVSMGDKPFSRGAGLQLGSLVAESNDILFFMDIDMIVTRNLVQQCYKNAVKG
KYAWYPIPYSQYDPNFMCSKTDNNENHVTWVKDIESESLNKQTKYKISKLINEEKGFWRD
FGFGLACIYKSDFLSSGGYDLSIKGLNIFRSNQEDLVHIFHRKDCSPDLEKIQADACKRT
RASHYASQRYW

Nucleotide sequence

Length: 1,656

>Moocci.CG.ELv1_2.S543251.g20862.01.t
ATGTATGACTATCATATTGATGATTATGAATGGTTTGTACAATTATCTGATGATATCTAT
ATCGACTATGATCAACTCAACATACTTTTAAGGACTTTAAACAGCACCAAGCCTATATTG
CTTGTTAGTCCAGGATTTAACTTAAATGATAATGATGGGAATAATTCAGATGGAAGAAAC
AATATTGATTCGTTTATTATGGTTTTGAACAGAATTTTGCTGATACAGTTGCGACCACAC
TTGAGGCATTGTATAAGGAATATGTTCACTGCAAACCAAAATATTGAGATTATTAGATGT
ATTAGTAAATACACCAACGCAATAATTTCTAATTTACCCAAGAATAATGTGCTAACAGAG
TTTGATGTGAATTCTAACGAACCAATTATACTGGGCAACAAATCGAGTGAGAGTGTTTAT
CCTACAATTACTAGAATATCAGCTACAGAAACATGGATGTATTTTACAAATTTTTATTTT
TATCAACCACTTGATAACTTGTTACCATTTCGAAATGACATGTTAAATATTCGTTCAGGT
CAGTCTAAAGCAGAGCGGGCACTTTTCTCAATGCTTTTGCAAGAACTAAAGGAAAAAGTC
ACTGATGATTACTGTTTAAACACTGCTGCCAGAACTTTTAAATACGAAGGTGTTCGTTTT
GTTGTCGTATATCAGACTGAAGATTTTAAACATTGCACAATAATGTGTGAAATGTCATAC
AGCGTAACACAACTATTGGAAGAAAATAAATTACCTTCTATTAACCAGATGATTTCTTAT
TATTATAATAACAACAACAAAACCAATTTCGCCTTTAATTTATTCCAAAGTGATTTATTA
ATCAATTCTGAATTTTCTGAAGATAAAGGAAAAGTTGTATTTATTATCCCATTGCAAGGA
AGATATAAAACACTGGAAAACTTTTTGAAAAATTATGAAAAACAATATTTACAGTCATTG
AAGTCAAATGATAATGTTAAAGTAAAATTGGCTGTTATTGTGATGCTGAATGATGCTACA
GATGAATCTGGGATAAACAGAGCTTCAATTCATTTACTTGAAAATTACCAAATCAAGTAT
GGCTCAGATGCTGTGTTTTACCATGTTGTATCCATGGGGGATAAACCTTTTTCTCGGGGT
GCAGGCCTGCAACTTGGTTCACTGGTAGCTGAATCAAATGACATTTTATTTTTCATGGAC
ATTGATATGATAGTTACAAGGAATCTTGTTCAGCAATGTTATAAAAATGCTGTTAAAGGA
AAATATGCTTGGTATCCTATTCCTTACAGTCAGTATGACCCTAATTTTATGTGCTCTAAA
ACGGATAACAATGAAAATCATGTTACTTGGGTAAAAGATATTGAATCGGAAAGTTTAAAT
AAACAAACAAAGTATAAAATTTCAAAATTAATAAATGAAGAGAAAGGATTTTGGAGGGAT
TTTGGATTTGGTTTAGCTTGTATTTACAAGTCTGATTTTCTTTCATCTGGAGGCTATGAT
CTATCAATAAAAGGGTTGAATATATTCAGATCGAACCAAGAAGATTTAGTTCACATTTTC
CATAGAAAAGATTGCAGCCCAGATCTTGAGAAAATACAAGCAGATGCTTGCAAGCGAACA
AGAGCAAGTCATTACGCTAGCCAAAGATATTGGTAA

InterProScan

Pfam
Chond_GalNAc (IPR008428) - T[233-549] 1.4E-57
SUPERFAMILY
Nucleotide-diphossugar_trans (IPR029044) - T[289-338] 3.71E-14 - T[372-432] 3.71E-14 - T[475-542] 3.71E-14

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
CHSS3_HUMAN 26.121 % 192 1.01E-52
CHSS1_HUMAN 24.699 % 186 9.04E-51
CGAT1_HUMAN 30.147 % 112 1.94E-26