- Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S53...'
Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S539863.g20652.01.t
Possible name(s)
AC009690.3; CELF3; CELF6
Gene model
Location
S539863 [21,474 / 27,899]
Amino acid sequence
Length: 399
>Moocci.CG.ELv1_2.S539863.g20652.01.p
MYAFLDSSPIDSMNHPMQVKPADTVNKGEDRKLFIGMLGKRQTEEDVRKLFEPFGKIEEC
TILRLPDGQSKGCSFVKLASAEEAKNAIAALHGSQTMPGASSSLVVKLADTDKERAVRKM
QQMANNYGIVSPVALQLGTYPTHSIVAGPSMVPSAGWSPVATALSSGQFGHVAATGLGQS
SIVQSNGPSTTPGIPSTPQSPVASITALNLVPPTVVSQSNGISTGVSPQEIYSLPTYPAQ
TPPAVDMLQHPVYAQHPPYTVVYVPSQSYGGGQISTPGLTPTATPLGPPLTAPQAAAMLS
TSPTAPQKEGPEGCNLFIYHLPQEFTDADLANVFQPFGSVISAKVFIDRATNQSKCFGFV
SYDNPLSAQTAIQTMNGFQIGMKRLKVQLKRPKEQARPY
Nucleotide sequence
Length: 2,692
>Moocci.CG.ELv1_2.S539863.g20652.01.t
ATGTACGCATTTTTAGATAGTTCACCTATTGATAGTATGAACCACCCAATGCAAGTAAAG
CCAGCCGATACAGTTAACAAAGGAGAAGATCGAAAATTATTTATTGGTATGCTTGGGAAA
AGACAAACTGAAGAAGATGTTAGAAAACTTTTTGAGCCATTTGGAAAAATAGAAGAATGC
ACAATTTTAAGATTGCCAGATGGTCAAAGCAAAGGTTGTTCATTTGTGAAACTAGCAAGT
GCAGAAGAAGCTAAGAATGCAATTGCAGCATTACATGGAAGTCAAACTATGCCTGGAGCC
TCTTCAAGTTTGGTAGTAAAACTGGCTGACACAGACAAAGAGCGAGCAGTTCGAAAAATG
CAGCAGATGGCTAACAACTATGGTATAGTTAGTCCAGTGGCTCTACAACTGGGAACTTAC
CCAACACATTCTATTGTGGCTGGACCAAGCATGGTACCTTCGGCAGGTTGGTCACCAGTA
GCAACAGCATTATCATCAGGGCAATTTGGTCACGTTGCAGCAACAGGCTTAGGGCAAAGT
TCGATTGTTCAGTCAAATGGTCCTAGTACAACTCCAGGTATACCAAGTACTCCACAAAGT
CCAGTTGCTTCTATCACAGCATTAAATTTGGTTCCACCAACTGTAGTTTCGCAATCTAAT
GGAATTTCAACTGGAGTATCGCCACAAGAAATTTACTCACTTCCTACATATCCAGCTCAA
ACTCCACCGGCTGTAGATATGCTCCAACATCCTGTGTACGCACAACATCCACCATACACT
GTTGTATATGTTCCATCACAATCATATGGCGGAGGTCAAATTTCAACACCAGGTTTAACC
CCAACTGCCACGCCCTTGGGGCCACCACTTACTGCACCACAAGCTGCTGCTATGCTGAGC
ACAAGTCCAACTGCTCCACAAAAAGAAGGTCCAGAAGGATGCAATTTATTTATTTATCAT
CTACCACAAGAATTTACTGATGCAGATTTAGCAAATGTTTTCCAACCATTTGGATCCGTA
ATTTCAGCAAAAGTGTTTATTGATCGCGCTACAAATCAAAGCAAATGTTTTGGTTTTGTT
AGTTATGATAACCCATTAAGCGCGCAGACAGCGATTCAAACTATGAACGGTTTTCAAATT
GGAATGAAACGCCTCAAAGTTCAGCTGAAACGTCCAAAAGAACAAGCTAGACCTTACTAA
AGAGTTACACAGACTTCAAGCAGATTCCAAATAGAGTTCTAGATCATGATTTGAAAAGGC
TGAAACGGAGACAGACTGGTCTGTTTCAATGTCTACGTTGTTGCGTTACATGGGTTACTG
TTGTATTTGTGACTGGATTATTTAATTATGTTTACGTTGTTGTACTTTTAAATATTTTTG
TTTAAAATTTCCTAAATCTTTGAATTATTTTGACGATATTTTTTGTTGTCAACATCCACG
TTGTGTTTTTGTTGACCGTCATGTTAAGTAATTTGGTGAACTATTCTATTCTTTTAACCT
ACTTCGACCGGATTTTATAATCAACTTGCTGTGTTAAAAAATTTAAAGAAAAAATGACAA
TATTATGTATAAATATAGCACTTAATACCAATTATCGACTTTCAATCTCCAATGTAAATA
AACAAATTTTTTTCTTTCCTTTAATGCTATGAAAATTTCTGTTTGTTTTATTTACCAGGC
TATGTTTATACTGTTAAACTGTATGTATGTGGCAATGTATGTAATTGTCAAATAATATTT
TTGTTTTATTGAATTTTTGTTGTTAATTACATAAATCACAAAAAAAAACAGACAGCCTAA
CTTTGCTAGTGACTTTTAAACACAAATTAAAATCTTCCTAAATGTAAAATCCTTTTGTGA
TAGTAAAACAAAATTATTTTTTGGAAACGTTATTAAGTTCACTATGTAAAATTTTTTTGA
ACTATTTTCTGCAACCAAAAATGAAGGTGCTTGATAATGTTTTAATAGTACGATATTTTT
CTCATAAAATATTGCTTTATTTTACCTTATTAAACGGTTGTAGTATTATTGTTGACGCTA
TTTATTCAATATGATTTTAAATACACAACACAATGTATATATAAACCTATATAATCATGA
TCTGCTTTTTCTGCACCATTTTCATTATACACAAAGCATTTATTCATAAAATGCATATAC
CCTCTCACTTGCCGATATGTGATAAGCACAAAACTCTTACCACACCATCTTGAATTACTA
AAAAAAGAGTACATTTGCAACATAGAAATTCCCAAACTATGTATTTATTTTGTTAAAAAG
TATAACTTGTAAATATTTTGTAGCTTTAGCACTGTATATTATTAAATTTCTTTGTGTATT
TTGAGCACATCATAGCAGATTTATTACTATTGTTCCTGCTACTATAATTTCACTCGTGCA
ATTTTTAATATGCTTGCTACCTTCTCCATAGTTCTTTATTAGCAAAATTGACATGATTGG
TTAATAGCTAGTATTATTAAGGCTTTTTTATTACCATCGTATGACAGTGTTTTTTCTTTC
AATCATGTTTCTTGTGATATGATTCACGCGATATACTTCTAGTTATACATTCCTACTATT
ATTTTATAGATAATATTATAAAAATACTTGCTTACTACATTCCTTGTACATATATACGAC
TTCTTTTAATTTTAGTAATATTATGAATAAATATAATGCAAAATACAAATAA
| Gene3D |
Nucleotide-bd_a/b_plait_sf (IPR012677) - T[20-119] 5.2E-26 - T[288-391] 5.6E-29 |
| SUPERFAMILY |
RBD_domain_sf (IPR035979) - T[30-121] 2.38E-42 - T[311-394] 2.38E-42 |
| ProSiteProfiles |
RRM_dom (IPR000504) - T[31-111] 16.108 - T[314-392] 16.978 |
| SMART |
RRM_dom (IPR000504) - T[32-107] 6.3E-18 - T[315-388] 5.9E-23 |
| Pfam |
RRM_dom (IPR000504) - T[33-95] 4.1E-15 - T[316-386] 1.0E-18 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| CELF6_HUMAN | 48.804 % | 345 | 1.55E-115 |
| CELF5_HUMAN | 47.711 % | 334 | 2.74E-111 |
| CELF3_HUMAN | 51.566 % | 367 | 1.79E-124 |
