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  1. Molecular Tool 'En>Ngn (Stolfi 2011)' > 
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  4. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S54...' > 
  5. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S53...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S536730.g20468.01.t

Possible name(s)

RAB10; RAB1A; RAB1B

Gene model

Moocci.CG.ELv1_2.S536730.g20468

Location

S536730 [247 / 3,362]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 143

>Moocci.CG.ELv1_2.S536730.g20468.01.p
MDWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESFTNVKQWLQEIDRYASENVNKLLV
GNKCDLTTKKVVDYTTAKEYADSLKIPFLETSAKNATNVEQAFMTMAAEIKNRMGPGTAT
SPGQANKVDITSTPVDSNKGGCC

Nucleotide sequence

Length: 1,374

>Moocci.CG.ELv1_2.S536730.g20468.01.t
ATGGATTGGGACACAGCAGGACAGGAACGGTTTCGAACTATAACATCAAGCTACTACAGA
GGGGCGCATGGTATTATTGTTGTTTACGATGTCACAGACCAAGAATCTTTTACAAATGTC
AAGCAATGGCTACAAGAAATTGACAGATATGCAAGCGAAAATGTAAATAAATTGCTTGTG
GGAAACAAATGTGATTTAACAACCAAAAAAGTGGTTGATTATACAACAGCAAAGGAGTAT
GCAGACAGTTTAAAAATACCATTCCTTGAAACTAGTGCAAAGAATGCAACCAATGTCGAG
CAAGCATTTATGACGATGGCTGCAGAAATTAAAAATAGAATGGGACCTGGAACAGCAACA
TCTCCTGGGCAAGCTAATAAAGTGGATATTACCAGTACGCCAGTTGACTCAAATAAAGGT
GGCTGCTGCTGAAAAATGAAGCTTTTTTAGGAACAACAAAATTACGATTTACAAACAGGA
CCTATTGCCATAGCGTTGCAATATTTTCTCTTCTTGTTTGTGTATATTTGATTCCAATAT
CCAAATCTTACATTTTTGTTCTTTTCTAGCTAATTAAATTTTATGCTTTTTCATGGGAAT
ACAATTTATCACATCGTATTTAAGCTTTCATTATTTAAGGTTACTATATCATATTCATTT
TGCGTATTACCAATGTTTTGCTTCATAAACAACTGAACGCACGCACAAAGTGTTTCAACT
TCTTTTAGATTATAGCAATAAAGTATAACTTGGCTGTGTTTTATATAAGGTCTATGTATC
ATTGTATTTTCCTAACTTTTCATCATCTTATATTTTTGGACTGATTTTAAAGAAAGTATG
TGTTCCTGATAGGTGCTTTGTTTAATTTATTATAAATCAGTGTAGATTAATGCTGATTAA
AATTATACTTATTTAAATGCATCGGTTAATTATTAACTTAACTTAAATTTAATCTTTAAA
TCTTCCTTTAATCAAAAATTAAAAAGGTAATCTTGATTAGAATTGCAATTATTTGCATAT
TGTAGTATTTTTTCTGAGTATCTGGCTAGTGCAACATGACAACGTTGTAAATAATTTTTA
ATGCAAATATATGTCCGTAAAATGTTACATAATTTTTAAACAAAAACCATTATCAATACT
ATTTTAACTATTGCTTATGAGTGAGTGTATGATGTATTATATACCCTAGTTATTATAGAT
TACAAATTGTCTAACTGCTAATACTTAAAAATAAGTCCTATTTTAATAATATATGGATTT
TTAATTAAAACAAATTATTTAGTAAAATTGGCTTTTTAAAATATATATTATTGTAAGTGT
ACATATTGTCAATATTATAATGAATTAATATAATAAAATAAATCGTATTAAATA

InterProScan

Pfam
Small_GTPase (IPR001806) - T[3-111] 2.3E-42
TIGRFAM
Small_GTP-bd_dom (IPR005225) - T[3-106] 4.3E-19
SUPERFAMILY
P-loop_NTPase (IPR027417) - T[3-128] 3.36E-41

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
RAB1A_HUMAN 85.106 % 253 1.15E-87
RAB1B_HUMAN 85.106 % 243 1.78E-83
RAB1C_HUMAN 81.56 % 232 3.4E-79