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  1. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S53...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S531155.g20257.01.t

Possible name(s)

TTC39A; TTC39B; TTC39C

Location

S531155 [16,647 / 18,390]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 580

>Moocci.CG.ELv1_2.S531155.g20257.01.p
MATAREPLSANGNDATVCFEDGILAAECMKLMLNNNFQEASEIFNKYKSLSPLMSAGSSF
RSFLEGVMTFENDNLEKAILDLKETQKMCKGDDIIDSIKLKIKSTNSRPPQVSIEQTLQN
KIIIADCHLYISVILFLQNEMTGYIKGSWALRKAWKSYERYYYKIKAMKLILENNSHVLG
IEELLKRNNVPLNKVSIKECCGHKMDINLINRIYGSVCFGFGLFNLFVSLMPQKLLKLVN
LIGFQGNRNTGIKALEDASTSTDMKAPLAMLSLLWYNTVAKPFFAVDGDGPNIGLDEAEV
ILCANEIKYPDSSLVLFFKGRILRCRREIKNAISTFMLAYEKGAGMKELQLLCSYEIGWC
CLVDLQWENALKSFTELKSLSKWSLSYYTYITALCLGITGNAIESLKLFNEVPMLMKRKN
NQLEIYVVRKSKIFAKTPVTHEFMILYLFELLYLWRALPNCTNEVLKTIICECEKITMYP
LIGLRNLILGAVYNVLGEGEKALNCFRITMDLSDNDFEDAHIAPYACFEIADIMLHHSDT
FEQGKKLLTFCKTNYAGYDFENRLQMRIHATEQRIYSNGI

Nucleotide sequence

Length: 1,743

>Moocci.CG.ELv1_2.S531155.g20257.01.t
ATGGCTACTGCTAGGGAACCTTTGTCGGCTAATGGCAATGACGCAACTGTTTGTTTTGAA
GATGGAATTTTAGCTGCAGAATGTATGAAGCTGATGCTGAATAACAATTTTCAGGAAGCT
AGTGAAATATTTAATAAATACAAATCACTCAGTCCTTTGATGAGTGCAGGTTCTAGTTTC
CGAAGCTTTTTGGAAGGTGTAATGACATTTGAAAATGATAACTTAGAAAAAGCCATTTTG
GATTTAAAAGAAACTCAGAAAATGTGTAAAGGTGATGATATAATTGACTCAATTAAGTTA
AAAATTAAGTCTACAAATTCCAGGCCACCACAAGTTAGCATAGAACAAACTCTTCAGAAT
AAAATAATTATTGCAGACTGTCATTTATACATATCTGTCATATTATTTCTTCAAAATGAA
ATGACTGGTTACATTAAAGGAAGCTGGGCATTAAGAAAAGCTTGGAAAAGTTACGAAAGA
TATTACTATAAAATAAAAGCAATGAAACTGATTCTTGAAAATAACTCACATGTTCTTGGC
ATTGAAGAGTTATTAAAAAGAAACAATGTTCCTTTGAATAAAGTAAGCATCAAAGAATGC
TGTGGCCATAAAATGGACATCAATTTAATAAATAGAATTTATGGTTCAGTTTGTTTTGGA
TTTGGTTTATTTAATCTCTTTGTATCGTTGATGCCGCAAAAACTTCTTAAACTTGTAAAT
TTGATTGGCTTCCAAGGTAACAGAAATACAGGTATAAAAGCCTTAGAAGATGCAAGTACA
AGTACCGATATGAAGGCACCACTAGCCATGCTTTCTTTACTTTGGTATAATACAGTAGCA
AAGCCTTTTTTCGCTGTTGATGGAGATGGTCCAAATATTGGCTTGGATGAAGCAGAAGTA
ATTTTGTGTGCAAACGAAATCAAATATCCAGATTCTTCATTGGTTTTATTTTTCAAGGGA
AGAATTTTAAGGTGTCGAAGAGAAATTAAAAATGCTATATCAACTTTTATGCTCGCATAT
GAAAAGGGCGCTGGTATGAAAGAATTACAACTTCTATGTAGTTATGAAATAGGGTGGTGT
TGCTTGGTTGATCTGCAGTGGGAAAATGCTCTTAAAAGTTTTACTGAACTGAAAAGTTTG
TCAAAATGGTCACTAAGTTATTATACATACATAACTGCATTATGCTTGGGTATTACTGGA
AATGCCATTGAAAGTTTAAAATTATTTAACGAAGTGCCTATGCTTATGAAGAGAAAAAAT
AATCAATTAGAAATTTATGTTGTTCGTAAATCAAAAATATTTGCAAAAACACCTGTAACA
CATGAATTCATGATTTTATATCTGTTTGAACTTTTATATTTATGGAGAGCATTGCCTAAT
TGTACAAATGAAGTTTTAAAAACCATTATTTGTGAATGTGAAAAAATTACCATGTATCCT
CTTATTGGGTTAAGAAATTTGATATTGGGAGCAGTGTATAACGTTCTTGGTGAGGGCGAG
AAAGCTTTAAACTGTTTTCGAATAACGATGGACCTTTCAGATAATGATTTTGAAGATGCA
CATATAGCACCATATGCCTGTTTTGAAATTGCAGACATAATGTTACACCATTCTGATACA
TTTGAGCAAGGTAAAAAATTATTAACATTTTGTAAAACAAATTATGCTGGATATGACTTT
GAGAACAGATTGCAAATGAGAATTCACGCGACAGAACAAAGAATTTATAGCAATGGCATT
TAA

InterProScan

PANTHER
Iml2/TPR_39 (IPR019412) - T[27-575] 2.1E-122
Pfam
Iml2/TPR_39 (IPR019412) - T[28-468] 4.2E-95
SUPERFAMILY
TPR-like_helical_dom_sf (IPR011990) - T[30-56] 1.64E-6 - T[315-426] 1.64E-6 - T[466-516] 1.64E-6

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
TT39C_HUMAN 41.727 % 455 1.1E-154
TT39B_HUMAN 23.643 % 143 3.27E-36
TT39A_HUMAN 25.945 % 135 7.67E-34