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  1. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S52...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S524990.g19873.01.t

Possible name(s)

FSCN1; FSCN2; FSCN3

Location

S524990 [30,668 / 35,543]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 487

>Moocci.CG.ELv1_2.S524990.g19873.01.p
MTESGNELKFTFGLVNSANKYLTAEKFGFGVTANATAMKTKQIWNLEQKEDGRAVFFKSS
FGRYLGTDKNGKVSCDSETPGPDHSFQVEATADGRWAIKNESSGYYFGGSGDQLDGFSTC
IDNSRLWIVHLAMHPQINLFSVSRSRYAFLSNDELQVTKSTPWGVETLITLVYKQRGYGL
MTFDNKYLNYDGKLSGKYDVATTAFTLEFYAGSIAFKSKTGKYLSPQGPHGVLKVWKNKV
TRDEKFTMRDSHPQVTLFSVEREKYVSTRQGVQVRCSSAMDKSDVEEQETFQMEIDPEKG
RWSFKDSNEKYWTISNGAVMVVSQRNSDSWFDVEWLNGKIRLRCDQGNIGVKPGGNLVIR
KDEEPTDFVFSLINRPLVVFRGEYGFVGNRATKLEGNRANYDIYEMKEHENNGTYAFKGS
QGKYWKTEDDGTLTMGGETPEYFSIELKKHTLMAIKSLKSGGYVKSDHVGIMTATGKIGE
KATLWEY

Nucleotide sequence

Length: 2,672

>Moocci.CG.ELv1_2.S524990.g19873.01.t
ATTTGTGCAAATTGTAGCGAGCGTTAGTCATATAACTTAAATATAAAATGACTGAATCTG
GAAATGAACTGAAGTTTACTTTCGGTTTGGTTAATTCAGCTAACAAGTATTTGACTGCCG
AAAAGTTTGGATTTGGTGTCACTGCTAATGCAACTGCAATGAAAACCAAACAAATTTGGA
ATCTCGAACAGAAAGAGGACGGAAGAGCTGTCTTTTTTAAGAGTAGCTTTGGGCGTTACC
TTGGAACAGATAAAAATGGCAAGGTCAGCTGCGATAGTGAAACACCCGGACCAGACCACA
GCTTCCAAGTGGAAGCAACGGCAGATGGTAGATGGGCGATTAAGAATGAGTCATCTGGGT
ATTACTTCGGTGGTAGCGGTGATCAGTTAGACGGGTTTTCTACTTGTATTGACAATAGCC
GATTATGGATTGTTCACTTGGCCATGCATCCGCAAATTAATTTGTTCAGCGTCTCTCGAA
GCAGGTATGCCTTTTTAAGTAACGACGAACTGCAAGTAACAAAATCGACACCGTGGGGTG
TCGAAACTCTAATCACTCTTGTTTATAAACAACGGGGATATGGCCTGATGACGTTTGACA
ACAAATACTTAAATTACGACGGAAAATTAAGCGGAAAATATGACGTTGCAACAACGGCTT
TCACCTTGGAATTTTATGCCGGTTCTATTGCGTTTAAATCCAAAACTGGCAAGTATTTGT
CTCCACAAGGCCCACACGGGGTTCTTAAGGTTTGGAAAAATAAAGTAACCAGAGATGAAA
AATTTACTATGAGAGATTCTCACCCTCAAGTTACACTTTTTTCTGTGGAGCGAGAAAAAT
ACGTATCAACAAGACAAGGTGTACAAGTTCGATGCAGCAGTGCCATGGATAAAAGCGACG
TAGAAGAACAAGAGACATTCCAAATGGAAATAGATCCTGAAAAGGGACGATGGAGTTTTA
AAGATAGCAACGAAAAATATTGGACAATCAGCAATGGGGCTGTAATGGTTGTTTCACAAA
GAAATAGTGATTCATGGTTTGACGTTGAATGGTTGAATGGCAAAATTCGACTTCGATGTG
ACCAAGGCAATATTGGAGTAAAACCCGGTGGCAATCTGGTAATAAGAAAAGATGAAGAAC
CCACTGATTTTGTCTTCAGTCTCATTAATAGACCCTTGGTTGTATTCCGTGGTGAATACG
GTTTTGTAGGTAATCGTGCAACAAAACTTGAAGGCAATCGCGCCAACTATGATATATACG
AAATGAAAGAACATGAAAACAATGGAACGTACGCTTTTAAAGGGAGCCAAGGGAAATATT
GGAAGACTGAGGATGATGGAACTCTGACAATGGGTGGAGAGACGCCTGAATATTTCTCAA
TTGAGCTTAAGAAGCACACTTTAATGGCAATTAAATCCCTGAAATCTGGAGGTTATGTAA
AATCTGATCACGTGGGTATCATGACAGCTACAGGAAAAATAGGCGAAAAAGCTACTCTAT
GGGAATACTGAATATTGATTTTATTTTACTGCTCTATACTGCCACCTTATATTATACTTT
GCATATATTTTAACGTCAATTATATCTATGTTTTGTTATTATTTACTTAACTCCAGTATT
ACCAAACAAAATTAACTGGTACGACCATGTTTTCATTAAACTAATGAATTTTATGATCTC
CAAATGTATAAAAGAAAATACAATAAGTGTTTTATACAAACATTTTAATACTTATAAATG
TTGTATAAATTTGTCATGTTTTCTTTTAAATTATATGGAAATTTATTTTATATTATTAAT
GACTATTTTATTGCCCAAAACTTTCATAAAATAAAACTTTAAAGAATCACTTTTACAATA
AAATTATTCATTGCATATAAAAAAAGTAAAGCAGATGATCCTGTTCAGGTACTATTTATA
AAGAAACAATATAACTTATTCGTTATAAATTAAACAGAATAGTCAGTATCGGTAATTATG
TATTTTAATTTTCTGGTCGTTCATATCTTGCTGCTCTTTAAGTTGTCAATTAAAGAAATT
CATGTTAGTTTGTGATTTAATGTTTTTCAGTTGACAAATAAAAATCATTTATATGATACA
ATTAAATGTCTTCAAACAGATCCATAGAAGAATATTCAATGTCAGCTGGATCAGTTAAGT
CATTTTGCTTTATTGAATTGCATGTTGAAAGAATTTCAAAGTTAGCATTTTTTTCATATT
GTACTTTTTTAATTTTTGGTGTACTTGTCATCGCCGGATGAATATTGATACAGTTGTCGG
AGTATTTGTGACATTGAGTAGCCTTTTTGCTATCATAGTTAGTTTTGATCACACAGGAAT
TTGCTTCGCCAAATGACTTATTCATATCTTCAATAATTGAATTAGTCAACAATGCTTGCA
TGTTGTTATTACAATCTAAATTTTCTCTTTTGGTATTCATAATTTTAGCATTCTGCTCTA
GGTAAAATTGTTTCCTTAAATTGCAAGTCCGTCTTAGTGGTGGACAATCTTTCCAGTGCC
AACAAACACTTTTTCTTTTTGGTGTAAAAATGAAGTCATTATGCTCTATTGAATATAAAT
TGGGTAAGGTATCATCGAGTTTAAAAAAGCTTTCATCCCCACTTAAGACTTCAGTTTTTT
CCAATTGAGTACAAGCATTGTTACTGCCATGA

InterProScan

PIRSF
Fascin_metazoans (IPR024703) - T[1-487] 9.5E-145
PANTHER
Fascin (IPR010431) - T[8-487] 4.1E-147
SUPERFAMILY
Actin-crosslinking (IPR008999) - T[10-135] 1.96E-33 - T[136-237] 9.03E-20 - T[212-320] 1.53E-17 - T[368-487] 8.76E-20
CDD
Fascin-domain (IPR022768) - T[11-129] 9.32881E-22
Pfam
Fascin-domain (IPR022768) - T[18-129] 2.6E-25 - T[138-248] 1.5E-13 - T[263-359] 1.4E-10 - T[393-487] 7.8E-8

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
FSCN2_HUMAN 39.192 % 348 1.48E-115
FSCN1_HUMAN 41.352 % 397 1.37E-134
FSCN3_HUMAN 24.694 % 129 2.69E-32