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  1. Transcript 'KH2012:KH.C8.353.v2....'
  2. Transcript 'Harore.CG.MTP2014.S4...'
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  4. EST 'AHC0AAA224YH12_RM1'
  5. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S51...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S519887.g19647.01.t

Possible name(s)

MEX3B; MEX3C; MEX3D

Location

S519887 [12,888 / 17,220]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 578

>Moocci.CG.ELv1_2.S519887.g19647.01.p
MIDAIMRISPSIETNQTYSEMESPPPDSNNHEDQRALQIALELSNLGLLGAGDDDSSTSS
YDEITKSKKSQNMTECVPVPSSEHVAEIVGRQGCKIKALRAKTNTYIKTPVRGEEPVFVV
TGRKEDVAMARREIQSAAEHFTQIRATRNKGVVSTTPGNPVLNNMTHMPGTPTAAELSAP
GMITLQVRVPYRVVGLVVGPKGATIKRIQQQTHTYIVTPSREKEPVFEVTGLPENVEKAK
EEIEAHIATRTGCQQLNIEEDFANNGILVGSPAQQMAQKNMNFMSQQFFNKQPNPQASAF
TRYNGNMLTQNQRQSSLEGSEFGNYIINNPESGFINPAMYNNQNSMQEHDNPALMMREQI
ESGMDILRMSRKYSNESGTMAPAWSTNMDYPNDSTAYSSVLSNAVNNGFNVDNSGFQSRS
SSSTSPPLSNILTHRLSPTLSDPEYVTAPAMLPPSNTQSPPIPTSLPMRNNFNTDGMITT
KTVSSGINIESGYSSGGTSDSQTSGSPVDSLTSTGSNNSGLSQSTRSCVLCHHNSVMAAL
VPCGHNLFCYSCAKHAADTSSACPHCSQTATMALLIKT

Nucleotide sequence

Length: 3,947

>Moocci.CG.ELv1_2.S519887.g19647.01.t
AGACTTAAAACTTTTATAAATCGAATAATACAAAATTATCAAATGATTGATGCAATAATG
AGGATAAGTCCATCAATAGAAACAAACCAAACATACAGCGAAATGGAGTCGCCTCCCCCA
GATTCAAATAACCATGAAGATCAAAGAGCTTTACAAATTGCTTTGGAATTATCAAACCTT
GGACTTCTTGGTGCAGGAGATGATGACAGTTCTACCTCAAGTTATGATGAAATAACAAAA
AGCAAGAAAAGTCAAAATATGACAGAATGTGTTCCTGTTCCAAGCTCTGAACATGTTGCT
GAAATAGTTGGAAGACAAGGTTGTAAAATAAAAGCTCTTCGTGCAAAAACAAATACCTAC
ATCAAAACACCAGTGAGGGGTGAAGAACCAGTATTTGTTGTTACTGGTAGAAAAGAGGAT
GTAGCTATGGCAAGAAGGGAAATTCAGTCTGCAGCAGAACACTTTACACAAATTAGAGCA
ACCAGGAATAAGGGAGTAGTATCCACTACACCAGGAAATCCAGTTTTAAATAACATGACA
CATATGCCAGGGACACCTACAGCAGCAGAGCTTTCTGCCCCCGGAATGATAACATTACAA
GTCCGTGTTCCTTACAGAGTTGTAGGACTTGTTGTAGGACCAAAAGGAGCCACAATTAAA
AGAATTCAACAGCAGACCCACACATATATTGTTACCCCAAGTAGAGAAAAAGAACCGGTC
TTTGAAGTAACTGGATTACCAGAGAACGTGGAAAAAGCAAAGGAAGAAATTGAAGCACAT
ATTGCCACAAGAACTGGATGTCAACAGTTAAATATTGAAGAGGATTTTGCAAATAATGGA
ATATTAGTTGGAAGTCCTGCTCAACAAATGGCACAGAAAAATATGAACTTCATGTCACAA
CAATTTTTTAATAAACAACCAAACCCTCAAGCTTCTGCATTTACAAGATACAATGGCAAT
ATGCTAACACAAAATCAAAGGCAGTCTTCATTAGAAGGTTCTGAATTTGGAAATTACATT
ATAAACAACCCGGAAAGTGGTTTTATCAATCCAGCAATGTACAACAACCAGAATTCAATG
CAAGAGCATGATAATCCAGCACTGATGATGCGAGAACAAATTGAAAGTGGAATGGATATT
TTACGAATGTCAAGAAAGTACAGCAATGAATCTGGTACCATGGCACCAGCTTGGTCAACA
AATATGGACTATCCAAATGACTCCACAGCCTATTCTTCAGTATTGTCAAATGCAGTAAAT
AATGGATTCAACGTTGATAATTCTGGTTTTCAATCGCGTTCCAGTAGCAGCACCTCTCCA
CCTTTGTCTAACATTTTAACACATCGTCTATCCCCCACATTGTCTGATCCTGAATATGTT
ACTGCCCCAGCTATGCTCCCACCTTCAAACACTCAATCTCCACCAATACCCACAAGCTTG
CCAATGAGAAATAACTTCAATACTGATGGTATGATAACAACTAAAACTGTGTCAAGTGGT
ATTAATATCGAGAGTGGATATTCCTCTGGTGGAACATCTGATAGTCAAACTTCAGGATCA
CCTGTGGATTCATTGACCAGTACTGGATCCAACAACTCTGGATTATCGCAGTCCACAAGG
TCATGTGTGCTGTGCCACCATAACAGTGTTATGGCTGCCCTTGTTCCCTGTGGCCATAAT
CTTTTCTGCTACTCTTGTGCAAAACATGCTGCAGATACATCAAGTGCTTGTCCTCATTGC
AGCCAGACTGCAACCATGGCATTGCTGATCAAGACCTAAGCAAAGAAATATCCCCATTAA
AAGTGCCTTTATAGTGCACATTTGTAAAATATATTTAGGTGAGTTTGAATTTTTTAATAA
TTTTCTTTATTTGTTAATGTACTAAGCGGATAGAGTGATCTTATCTTCCACATCCAGAAT
ATTTTTATTACATTATGTTTTGTACCAATTCCTTATAAATTAAAGATGTTTGGATTGGTT
CTTTCATTTGATTTTGTATTATCAAAAATTTGCTTATTTTTGTTATGTGATTTTCACATT
CTAATTTTTTTAATTGCTTTCAATTTTTGTTTATTATTATTTGTTCCTTTTTAATGCCCT
ATTCTTATCTTTTTTTTTTAACAATCATTATTATCCAAGCTATAATGCTATAATCTGCAT
ATTTAATCCCTTTATGGATGAACAAAAAACAATCATTGTTTTTACTTATTCTATGAACAG
ACTGCCATTTCTCTAAAAAAGTGAAGTTTACTTTGTAGATTTCCATAACCTTATTTTTCA
GAGGAAAGATAGGCTCCTTGTATGCTTTATATTATTATATTTTCATTACCATAAAAATAG
ATATATATTTTGTAATTTTCTACTAAGTACTTTATTTTATACTTTAAATTTTTTTGAATA
TATTCTTATTATATATATATTAAATATGTATAATCTTGTATATACTTTTTTGGCGTTTTG
TGCACTGAGTGATCTCACTTTTTCTAGCCACTGCTTGTTAAACATTAAAGTTCACAAATT
ACACTTTTAATTCCTAAATAAATAAGTACCCTTTCAATCATGATAAATTTGCATTAAATC
ATTTATGTATACTTTACCTTGAAAAACATTTCTATTTTCTTGATGTCATATAGCCTAGCA
CACTGCCAATCAATAGTTGATTTTTATAGCTGTTTACAGCAGTTTAATTTCTTGCCAATC
TGTTCTAAATCATAAATGGTGCTACTATTTCCTATTTATCCAAGAAATTTTATTTTGGCA
GCTAGCCAATTGTTTGCAACCCTGTCCTTGTTAAATTTGATAAATGTCTTTTGTATTGAA
TACTGTTAATGACAGTGATAACTTAGGTGCTTTATAGATTTTGTTAATTCTTGAGTAAAA
AATATTTTCTTAGTTCATGAACGATTATAGTAATTACTTTGTTTCAACAACTTAATAATA
GTTCTTACATTGGTTATAATAAAATCCATTGTCAAGCCTTAAATATCAAATCATTGCTGG
CAATTGTTACTGTGTTATTAAACGTTAAGGCTAGAACTTTAAAATGACAGATTAAGTGTA
TTGAGAACTGTGATATAATTCATAGTCGTTACGAACTTGTACTGGCGTCTATTTTATTTG
GTAATTATAGTCAAACCGACCGCCTTAACTTTTCCTTCCACTGTTTTTGAGTTATGATTT
TTTTGTTGATTTGAATAGCTTAAGTGTTAACTTTTAATTTTTGTTGTTTGTTTAGATATG
TTGTGTGTCTTTAATTGTCTGTTGCATCCAAAGGTACTTATAATGCTGCCAAAATAGTAT
AACATATTTTATTTAACTATATAAATAAATATATTATTGCTTTTTATAGTATTTTAATAT
AAATAATATTAAAAAATGAATATCCCAAGTTGAACTAAATACACTATAAATTCATTCAAA
ATGTAATATATGTATCATGTATGTGTTTATATATCTATATATAACAAAAATAAGATTATA
AAGCTGATTTAGGTATTTTTATTACAAATTCCATTTATTTATTGTATTACTAGCCTTTGT
CAAAAAGGCAATAGAATAATGCAGATCATTTTCGTTATATTTTCAAAAGAACTTTCTTTG
CTGCTAACATTAATTGTGTTTTTCTTTCTTTAGTTTATTGGTTTTAATCTTGTTAAAATT
GCCACTATAGTCAGCTTTTTTATTATTTCTTTTGGATTTTAGTCATGTTGTGTTTTATAT
TTTTTTTCTATTACATATATTACTTGAAGCCCACTGGTAACATCAAGGGCAATTCATGCA
ACTTTCTTTTTTACTGTATTTGAGCAAGACTAAATATATATTCATAAATTTTATTTTATT
CTTAGTTATAATGTAATTTCATAAATATATTCACAGTAATTCGTGTTATTAATTGAGATT
TGTCTTAAAGAGTTTTATTTTTGGCATTAAAAATTTCTTTATATATA

InterProScan

SMART
KH_dom (IPR004087) - T[71-139] 2.1E-9 - T[181-248] 4.0E-16
SUPERFAMILY
KH_dom_type_1_sf (IPR036612) - T[72-144] 4.38E-11 - T[177-250] 1.42E-18
Gene3D
KH_dom_type_1_sf (IPR036612) - T[73-137] 1.0E-13 - T[182-248] 3.7E-21
Pfam
KH_dom_type_1 (IPR004088) - T[75-135] 3.8E-10 - T[184-244] 6.2E-15
Gene3D
Znf_RING/FYVE/PHD (IPR013083) - T[509-576] 5.4E-10
ProSiteProfiles
Znf_RING (IPR001841) - T[528-567] 10.557
SMART
Znf_RING (IPR001841) - T[528-566] 0.0054

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
MEX3D_HUMAN 56.028 % 282 5.13E-87
MEX3B_HUMAN 72.199 % 320 4.08E-102
MEX3C_HUMAN 72.906 % 289 1.42E-89