- Transcript 'KH2012:KH.C2.236.v1....' >
- Transcript 'Boleac.CG.SB_v3.S555...' >
- Transcript 'Cisavi.CG.ENS81.R77....' >
- Transcript 'Boleac.CG.SB_v3.S428...' >
- Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S49...'
Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S496719.g18698.01.t
Possible name(s)
HMCN1; HMCN2; ROBO3
Gene model
Location
S496719 [12,286 / 19,485]
Amino acid sequence
Length: 573
>Moocci.CG.ELv1_2.S496719.g18698.01.p
MVGLINLFNNRFKFRIKSSSNIVVMGKILFLLFGCLISVCRSQDDFTINLDNVPDITVLE
GRTAEFRCPYTLTDSNKNEVVIDDIPKIFWEVNLNNVYTHFATIDLADGSNSEIMTNVTN
IDFKLNGDSLTAVADVKHNDMYQNMRCGVIFVASRRTKTLVYTVVAFPNEGDQSFTLSLM
DGESGFAESDTPVNVATCKSGYGYPPPVISFKKNGKLIEVGNTTFGSFLDSSTQEKNEVT
SKVQTMRDLFINVEAEDDKAEFVCVVSTSHGSLTKTYEVPAPTYRVKHPTNKVTLKADQE
NAFLGSTVTLKCEANGFPDPTYEIADEYTNTASIEITKEINGNTYTCTARNSLNDDDIDP
PTVSEFTQPSVDEEFTVTCSSSGNPAPSVSWYNQEGAQVSTTGTLAFSLAVLEDSGEYVC
KAENGYDDLAIQTTQSIQVKGMSMDGSGTTENVLGDADDIVEIECQVKSNPEAIITWTDT
SDISAGGSSVAGIIIGILVAILLVAIILAVLYNKGVICKKGEKGDETANDITPVPNEGNQ
EADVEAGNDKVNGTNEEKEKLMSDQQQVEAEHE
Nucleotide sequence
Length: 3,337
>Moocci.CG.ELv1_2.S496719.g18698.01.t
ATGGTCGGTCTTATTAATTTATTTAACAATAGATTTAAATTTCGCATCAAAAGTTCATCC
AACATCGTTGTAATGGGGAAGATATTGTTTCTGCTTTTTGGTTGCTTAATATCAGTATGC
CGCTCACAAGATGATTTCACTATAAATTTGGACAATGTCCCTGATATCACCGTTCTTGAG
GGGAGAACAGCTGAGTTTCGTTGCCCATACACGCTCACCGACTCAAACAAAAATGAAGTA
GTAATTGATGATATTCCGAAAATATTTTGGGAAGTAAATTTAAATAATGTGTATACCCAC
TTTGCTACCATTGACCTTGCTGATGGAAGTAATTCCGAGATAATGACCAATGTCACAAAC
ATAGATTTCAAACTAAATGGGGACTCATTGACTGCTGTAGCAGATGTCAAACACAATGAT
ATGTATCAAAATATGCGTTGTGGAGTGATTTTTGTAGCTTCAAGAAGAACTAAAACTCTA
GTCTATACTGTAGTTGCTTTTCCAAATGAAGGGGATCAATCTTTTACTCTTTCACTGATG
GACGGTGAAAGTGGTTTTGCTGAATCGGATACACCAGTGAATGTTGCCACATGCAAAAGT
GGTTATGGATATCCACCACCCGTAATTTCATTCAAAAAAAATGGAAAACTAATTGAAGTC
GGTAATACTACATTTGGATCATTTTTGGACTCAAGTACACAAGAAAAAAATGAAGTAACT
TCTAAAGTACAAACCATGAGGGATTTGTTCATTAATGTTGAAGCAGAAGATGATAAGGCA
GAATTTGTATGTGTGGTCTCAACAAGCCACGGCAGCTTAACTAAAACTTATGAGGTTCCT
GCGCCAACCTACAGAGTAAAACATCCAACCAACAAAGTTACTTTGAAAGCTGATCAAGAG
AATGCATTCCTTGGTTCGACTGTGACTTTGAAATGTGAGGCCAATGGTTTCCCTGATCCA
ACATATGAGATTGCAGATGAATACACAAATACAGCTTCTATCGAAATTACTAAGGAGATT
AATGGAAACACATACACATGTACAGCTAGAAACTCGTTAAATGATGATGATATTGATCCT
CCAACTGTTTCTGAATTTACCCAACCTTCTGTTGATGAAGAGTTTACTGTAACATGCTCT
TCAAGCGGAAACCCTGCTCCATCAGTGTCCTGGTACAACCAAGAGGGTGCTCAAGTTTCC
ACCACAGGTACTTTGGCATTTTCATTGGCAGTATTGGAAGATAGTGGTGAATATGTGTGC
AAAGCAGAGAATGGTTATGATGATTTAGCCATACAAACAACTCAAAGCATTCAAGTTAAA
GGTATGAGCATGGATGGAAGTGGAACAACAGAAAACGTACTGGGGGATGCTGATGACATT
GTGGAAATTGAGTGCCAGGTTAAATCAAATCCTGAGGCTATTATTACTTGGACAGATACA
TCAGATATAAGTGCTGGTGGGTCTTCTGTTGCTGGTATTATTATCGGAATTCTTGTCGCA
ATTCTTCTGGTTGCTATAATCTTGGCTGTATTATACAACAAAGGAGTTATATGCAAAAAA
GGTGAAAAGGGAGATGAAACAGCAAACGACATTACACCAGTCCCCAATGAAGGGAATCAA
GAAGCTGATGTTGAAGCAGGAAATGACAAAGTAAATGGCACCAATGAAGAAAAAGAGAAA
TTGATGTCAGACCAACAGCAAGTTGAAGCCGAACATGAATGAATTTTTATTGGAAAGAAC
AAAAGAAGCTATAAAATACGATGAACTTAATCAATTAAATGCAATAAAACTGCAATAAAA
ATCTGAGCCACATTCAAAATTCATTACACATATTACTTTGAATTTAAGCTTGTGCAAAAA
TACAAAAATAAGGAGTAACTCAACCTTTCAATAGGTTTGTTTTTACTAACATAACTAAAA
TTAATTGGCAGACCGCTTCCCACCACCAGTTTGAGAATGTGAAAGTGTGTTTTGGTTTTA
CTTCTAACACAATTATTGTTTAAAGTTGGAGAATGTTACTGAAGATTTCAAGTGGATTGA
ATGTTGTTTTATAAGTAAAAGTTTGAATGTTTATATATTTATAGTTTTGTATTAACTTAG
TACTGATTGTTTTATTTTTTATTACCCTTTTTTTATTTTTAATGATGCCTATTTTATTTT
GGGGTTCTAAATTTTTTTAGATAATTTTTTTTCTGCAAAAATTTTAAACTTGATTAGTTA
ATATTGGGACTAATTACTTATTAGGCGATTCACTTCCGAATTTTGACTATTGAAATATGC
TTTATTAATGATAAGCATTCCATAGTATTTTATGATTTATTTGTTTCACTTTGTTATTAC
ATGTTTGCTCATTCATATGTTCTATACTTGGAATTTTAAGTATTATTTAACTGCTATTAT
CTTACATATTTTTACTAGGGTGAATTTTACTTTATCATGTATGTTTAACTGCGCTGATCC
TGTACATATTTTTAGTGTATTTAAATTAAATTTACCAAGTACAATCTTTTGTATAGCTTG
CCACAAAATAAAACTTAAATCATACAATATATCTGTATGTTTGTAAATAGGCTTAATATT
TCATACCTTAGCACACTGAATTCTGTATCTCACAATTTTCTGTAAAACATTGCATACTAC
ACATAATCATACAGCATTTATTACTTGTTTCACTTTTGTATATATTTGTCTCTTTACATT
TGTATGTTTTAGGTCCTATTTTTATTTTTATGCATATTTTAATTTTACACAAAATCTGTG
CAAACCTAATATGTGACTTTGTGTTGTGCTAACATCGCACCAATTTTACTGCAAACATTT
TAGACTGATAAAAAATTCAAAAATAATAATGTTTTCGAACTACTGTTTTTTTATTACTTA
CTGTACTTAAACCATGTAATATTGTGCCTTTGTATAGTTATTGCTACCAAAAATAAACAT
TTACAATAAAGTTTTAACTCCTATAAAATTTTTATGTTATGACCAATAGAGAATAATTCA
TATCATTAAAATATATGTAGCATATTGGGAAAATTCATTTAACTGTGTAAAGTTTGTCTT
GCATCCTTTTGAAAAAACATTTAGTGCATACCAATTTTATATTTACTACATACTTTTTAA
AGGTAAACATGCCTCTTAATATATAGAGTTGTTGGAACTGTTGGTAAAATATCTATCAGT
GTATTTATTTTTATTGTTTCAGCACAATCATCAAGGCGGTTAAATTTACTAATGTGACTC
TAAATTTGTATTTCCACATTGCTACCCACATAAATGCAAGACCAATAATTGAGTTCAAGG
AGAAATCTTACTCAAAATAAAGTTTTGAATTTTAAAA
| SMART |
Ig_sub (IPR003599) - T[53-280] 2.6 - T[364-440] 3.9E-4 |
| ProSiteProfiles |
Ig-like_dom (IPR007110) - T[168-274] 6.705 - T[289-359] 7.395 - T[361-438] 12.241 |
| Gene3D |
Ig-like_fold (IPR013783) - T[183-279] 6.0E-10 - T[280-359] 2.5E-7 - T[364-432] 8.2E-12 |
| SMART |
Ig_sub2 (IPR003598) - T[188-271] 1.0 - T[303-354] 1.3 - T[370-427] 9.4E-11 |
| Pfam |
CD80_C2-set (IPR013162) - T[190-269] 1.8E-7 |
| SUPERFAMILY |
Ig-like_dom_sf (IPR036179) - T[197-279] 4.36E-6 - T[293-347] 1.03E-11 - T[379-429] 1.03E-11 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|