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  1. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S49...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S493383.g18335.01.t

Possible name(s)

YTHDF1; YTHDF2; YTHDF3

Location

S493383 [26,156 / 28,965]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 560

>Moocci.CG.ELv1_2.S493383.g18335.01.p
MKSARKYQKGLLSMYLFQAGYGLPHSDQYMPSYYGGGGQVPFPYMGEWSAGDSVPFLSGY
SGVPSTEPQHHQPFIPDTMFAQPTTNLGNGHQYFNQQPMFPHSNEFTAWGPSSGGHNNVL
DPGINQQNAYNADFYQHMNSMSVMPPSYLSGELLSNSTTNGTDLMRYNNSGGVQVGNEIS
GKLPSESPQAINVNNLEQNLQSMKLDMSSGSETEKFSNKAETSNSINIGIVQNGINDNHD
GSTIKTTSIEAQSSKPISWAAIASKPAKPQPKPKTKPAAGPGLPPPIKHNMDIGTWELGR
PPNKANNSSNMPQRWNGQRQNGRNFEDKQDGDHRDNYQVSKVKNSNNPQNSSPVLEKLIN
QNDYNPKRLTIDLRSARFFVIKSYSEDDIHRSIKYNIWCSTEHGNKRLDSAFYAQANRGP
VLLLYSVNGSGHFCGVAEMKSAIDYNTTAGVWSQDKWKGSFQVKWIYVKDVPNNQLRHIR
LENNDNKPVTNSRDTQEVPAEKGRQVLKIIANFKHQTSIFDDFGHYERRQLVEEDQKVKS
SQARKNDASHPSGTNNKARK

Nucleotide sequence

Length: 1,683

>Moocci.CG.ELv1_2.S493383.g18335.01.t
ATGAAATCAGCAAGAAAATACCAAAAAGGTTTACTTTCAATGTATTTGTTTCAGGCTGGT
TATGGGTTGCCTCATTCAGATCAATATATGCCAAGTTATTATGGTGGGGGTGGTCAAGTT
CCGTTTCCGTATATGGGTGAATGGTCTGCCGGTGATTCTGTTCCTTTTTTATCCGGTTAC
AGTGGGGTGCCCAGTACAGAACCTCAACATCATCAACCTTTTATTCCAGACACTATGTTT
GCACAGCCAACAACAAATCTTGGAAATGGACATCAGTATTTTAATCAACAACCAATGTTT
CCACACAGTAATGAATTTACTGCATGGGGACCATCAAGTGGTGGTCATAATAATGTTCTG
GACCCTGGTATAAATCAGCAAAATGCTTATAATGCAGATTTTTATCAACATATGAATTCT
ATGTCTGTCATGCCACCAAGTTATTTAAGTGGTGAATTGTTATCTAATTCAACAACTAAT
GGGACTGATTTAATGCGATATAACAATTCTGGCGGTGTACAAGTTGGTAATGAGATTTCT
GGAAAACTACCTTCAGAATCACCTCAAGCAATTAATGTTAATAATCTGGAACAAAATCTT
CAGAGTATGAAATTAGACATGTCTTCTGGTTCTGAAACCGAAAAATTTTCCAACAAAGCG
GAAACATCTAATTCTATTAATATTGGTATTGTGCAAAATGGGATAAATGATAACCATGAT
GGAAGTACTATAAAAACAACTAGTATTGAAGCACAGTCTTCAAAACCAATTTCATGGGCA
GCTATAGCATCTAAGCCTGCTAAGCCACAGCCTAAACCTAAAACAAAACCTGCTGCTGGC
CCTGGACTTCCTCCGCCAATTAAGCACAATATGGACATAGGTACTTGGGAGTTAGGGAGA
CCTCCAAATAAAGCAAATAATAGTTCAAATATGCCACAGCGATGGAATGGGCAGAGACAA
AATGGAAGAAACTTTGAAGATAAACAAGATGGAGATCATCGTGATAACTATCAAGTTTCA
AAAGTTAAGAACAGTAACAATCCTCAAAACAGTAGTCCGGTTCTTGAAAAACTAATCAAT
CAAAATGATTATAATCCAAAGCGTTTAACTATTGATCTGAGGTCTGCAAGATTTTTTGTA
ATCAAGTCTTACTCAGAAGATGACATTCATCGTTCAATTAAGTATAATATTTGGTGCTCT
ACTGAACATGGTAATAAAAGACTGGATTCTGCTTTTTATGCTCAAGCTAATCGCGGCCCG
GTTTTATTGCTTTATTCTGTAAATGGCTCTGGTCATTTTTGTGGAGTAGCAGAAATGAAG
TCTGCAATAGACTACAATACAACTGCAGGGGTATGGTCACAGGACAAGTGGAAAGGTTCT
TTTCAAGTTAAATGGATTTATGTAAAGGATGTTCCTAACAATCAACTTAGGCACATTCGA
TTGGAAAATAATGATAATAAGCCTGTTACTAACTCGCGTGATACTCAAGAAGTGCCAGCA
GAAAAAGGCAGACAAGTTCTTAAGATAATTGCAAACTTTAAACATCAAACAAGTATATTT
GATGACTTTGGACACTATGAGCGTAGACAGTTGGTGGAGGAAGACCAGAAAGTGAAATCA
TCGCAAGCGCGCAAGAATGATGCTTCTCATCCTTCAGGGACCAATAACAAAGCAAGAAAA
TAG

InterProScan

Pfam
YTH_domain (IPR007275) - T[376-510] 3.8E-43
ProSiteProfiles
YTH_domain (IPR007275) - T[376-510] 47.414

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
YTHD1_HUMAN 45.091 % 391 4.02E-130
YTHD2_HUMAN 43.793 % 390 2.12E-129
YTHD3_HUMAN 67.281 % 309 3.26E-98