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Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S491166.g18113.01.t
Possible name(s)
CCT3; CCT4; CCT5
Gene model
Location
S491166 [46,528 / 55,853]
Amino acid sequence
Length: 72
>Moocci.CG.ELv1_2.S491166.g18113.01.p
MSAPVLVLSQNSKRESGKKVQIGNVNAAKAVADVIRTCLGPRSMFKMLMDPQGGIVMTND
GNAILREIQRAR
Nucleotide sequence
Length: 8,083
>Moocci.CG.ELv1_2.S491166.g18113.01.t
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GATTTTGGCCTTTAGTTATCTAAGATATCACTTGATTAATTGCTCTAATATATCTTTACT
TTATACTAGCTCAATAAATTAGCCGGAAATTTTGAGTACTGTATATTTTAAAAAATTTTT
CATTGGGATNNNNNNNNNNTCACAGTAAATGAAAAAAATAATAATAAAACATTTAAAGTA
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TCTATTTTCCCAAAGCAAGTAGGCTTAGTTAGTATGGTGAATGTACCACATAACAACACA
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TGATATTTTTTATGAAATTTACAGCCACTTCCANNNNNNNNNNATAAATTAGCCGGAAAT
TTTGAGTACTGTATATTTTAATAAATTTTTAATTGGGACGAAACTTAGGCTGCGTAGTTT
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AATAAATTTAGAGTATTGATTGAATATAAAAGAAATATTACAATTAACTCTTAAAAATTC
GTATTTTCAGACTGCAATGTTGTTGCTTCGTATCGACGACATAGTTTCTGGGGTAAAGAA
GCAGCAGGATGTAGCAGACAACTAACAACACTACGTGCATGTTTGTCTTGGCATGATATG
TTTGTTCATCTGCGTGACAGTTCCATTAGTTAAACAAGATTTTACACCTACTTTTCTACA
GTTAACACCTTTGGGTGTTCCCCTATTAAATTCATTTGTAGCTGTTTTGTCGTATAAAAT
AAAACCAACTGATTGTAAATTTATTCGACTTAATTTAGGTTCGTAATAGAGCAGATGCGT
TAGGAATGTATATGTAATATATATTGTTAAATTATTATACATATTATATACATTGTAAGT
ATGTTTGGCTTGCTTGTTGAGGTAATAAGCACCAGCTTTACTGCCTTTTAAAGTAAAATA
AACAAGCTAACTAACAAATCAATAAAAAACAATTGTATGTTACCATGTGAAGAATCCAAT
GTATTAGTTCAGTTATACGTAAAGTTTTAAATACAGCCAAACGCTGTCTCATTTTAGCTG
GCTGGCTACGAAAGTGAAAGCTCTAGAAATATTGGTCTACAAGGATTGTCATAAAACAAC
CTTCGTTTGAAAAGAGATTGTATCACTATCTGTCTTGCTGCCGCCTGCATACAACCGTTG
TGAAGCATTCACTAGACAGATCTTGCATTTGTGTTTTAGGATACGGTCTTGATTTTTAAA
TATAGTTATGTTTGAAAAATAAATTAGACTTTGTGATNNNNNNNNNNAGCATTCACTAGA
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| Gene3D |
GROEL-like_equatorial_sf (IPR027413) - T[1-72] 5.0E-22 |
| PANTHER |
Cpn60/TCP-1 (IPR002423) - T[6-69] 3.7E-31 |
| SUPERFAMILY |
GROEL-like_equatorial_sf (IPR027413) - T[11-69] 1.22E-18 |
| Pfam |
Cpn60/TCP-1 (IPR002423) - T[31-69] 1.2E-11 |
| ProSitePatterns |
Chaperonin_TCP-1_CS (IPR002194) - T[36-48] . |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| TCPG_HUMAN | 83.333 % | 121 | 2.16E-34 |