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Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S490120.g18013.01.t
Possible name(s)
HSPG2; NECTIN3; NECTIN4
Gene model
Location
S490120 [7,295 / 22,450]
Amino acid sequence
Length: 592
>Moocci.CG.ELv1_2.S490120.g18013.01.p
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Nucleotide sequence
Length: 4,026
>Moocci.CG.ELv1_2.S490120.g18013.01.t
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GAGACTATATCTTTTACTGTGACGATGTACGAATCACCTACAGTAACTGTGGTTAAGGAT
ATTGACCCTTTAGTGGCCGGGACCAGTGAAGTTGTGGCTGCAAGATGCATGGCAAATGGC
GGAAAGCCACAAGTAACATCAATATCCTGGTCGACAAATGCAAATATGGCATATGATGAA
ACAATAACCAACTCAACAAACACCAACATTGGCGTTGTTCGATACGACGCGGAAGCGAGC
TTGTTGATTCAGCCAACGGAGTTCTATAACAACTTGAAGTTCACGTGCACCGTGAAACAT
CCTGCATACACTCTCAAAACAGGATCGGACAGGACTGAAACGGTGATAACACTGAATGTT
AATTTTCCGCCAAGTTCCACCCATATTGATGTTGTGGAGGCGGGTACTAAACTTACATGT
TTGGCGAACGGCAACCCTGCACCTTCGTTTCGGTGGCAGATGCCTCCTATTTCAACCACT
CCTACCGTATACGGCGATACAGTCGAAATAATAGACCCCAGTAACCCCGATCGTCAAAAC
GACACGTATATTTGCATAGCGTATAACGACATCCAGCCAGACGGGAGCGCTAACATCACT
ACGCACGGAGCTGGTGTTATTGTAACTATGGTGGCGAAGTCGAACACTGGTATAATAGTT
GGGGCAATATTCGGAGGCCTTCTTCTGCTTGCTCTAATTGCATTTGGGATTTACTGGTTC
CTTATTCGCAAAACGGAGGATGATGAAGGACCTTACACCAAGGGGAAGGCTTCATCCAGT
ACTCGACCTACTATCGAACGTTACGGTGAAAGTTCGGAAGTGCAACGACCAACCATAACC
CACGCTAATGATAGTATAAATAAGAACCGCCCACCCAGCCCCAATGACCCGCCCCCTGAT
GAGGAGGAGCCACAATCCAGCCAATCAGAAGAGGAAGATGAAGGCGATGATGTTGAAATT
ATTCCGAGGGCGTCGACAAGAGGAATAACGTCTCAAGCTTCTATCAACTTCCAGAAAGAT
CGAAAGCGTCCTTCAACCTCCCCCAGAGCAAAAGCGAGACCAAAGTATGACTCACCTCCA
GGATATACGGACCCACGTTACGAAGTTCCCCCAGGCGATTATGATGATGACGACCGACAG
AACCTAACGCACGACCAACATGGCTACAACGAGGACCCAGATTCGCATCTGTATGACTTA
CCCCAAGATCGCTACCCTGGGTACTTCCAAGATCAGCCCCAAGGATACCCCGATGAATAC
ACGGACGACCGGGAATATCAGGACGATTACAATGACCACAATGAACCGGTAACCTACGCT
AGACTCGACAATCGATATCTTGGCGACCCAAACAATCGACATGCTCCTCGAGAAGAGCAA
GTTGAATACGCGCACATTCGTCCTGCCTACGTGGTGTGAAGCGCCATCTGGAGGTTGAAT
ATTCCAACTGTTCGTGGCCAATTTGAACCGGACCAATCAATTATGCCATAGTTAGTCACG
ATATTGCCACATTTATATCCCATGATAACATTTTGTGCCACAACACTAGGTTGCATGTTA
AAGAATGACACGATTTCTGGTTTTTGAATTATATTAAAAATTATATAAAAAAAAATTTAA
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ATATTTTGAATAATAAAAATGATTTTATAAATTAATTTTTTTTTAAATACCAAAATTTTA
TTACATTTTGAAAAATATATTTTGAATTTTAGAAAATGTGATAAAAAATATCATTATGTC
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ATCTTCGGATTCATGGTTTTATAAAGTGTAGTTTTATTATAGCTTTCTTTTAATTATATC
CAGTGACATAGCTTTTTAATTAATCTTGCAAACGTAGACGTAGACAATTGTTTTTCCTTT
CTACTTTTTTATCATCTGTATTAGCTGTAAAGATTTAATTAGGTACTTATTTTTATTGTT
TCGCAATTTTTGATGCTACTTTTTAACAAACGCTTAATCAAAATTTTGAGTAAAGACTAG
CAGTAAAGTTGACATGCTTAAAATCATTTATTTGTTTGGTAATAATAGCTTTACAATATC
AAACAGTTTGTATTATTTCAGCATAATCGTTTTTATGTTGATGATATCACAAAAATTTTT
ATGTTTTTTCTAATTATTGAAAATGGTCCATTTTTTTTAAGGAAAAAATATTTCGATACA
AAAATTTTGAAAGCATATATCTATTATATACGGTACTTAGCAAAAACTGTCTCCTTCGTA
TTTTTCAGCTAATTTTTTTATAAAAAATTTTTCGGTGCTTTTATTTCAATCTGTAGTTGC
CCAGCAATTAATTGTACTGTGATGTGATAATTGCTAGCAATAGACAATTGTTATAATAAA
TAATTGCCCATTGTTATTTACGTTTTTACAACAATTATGTCCACTTTTACATTGTGTTCT
GTTACGGTATCTTATATATGTTCTAACGCACTTTTAATTCTGTATTTGTGATTACTCCAT
GGTGCTATTTTCAATCCACAACATTTATAAATCGCATAAAAAAAGTCATTGAAACTTATT
GAACTTTCAGATTGTATGTCTGATAATAATGTTAGTATAAGCAAGGGTTTGTCAATGCTC
TTGTTGTCAAGGATGGTTAAAACTTTGTTAGNCAAAATTAATGCAAACAGTTTCATTTGT
TATAAAAACCACTGCGATCAATATTTTGGACACTAAGAGACTAAAAGAGAAATCCATAAG
TTAACATGGGCCTTTCGGCTGTATTTTTTTATCGACACAAAATAAGTAACTGATATCGAC
AATGGTTGCACATCAATGAATGACGTGTGACATTGACCAATATTACTGTTGGTGAATTAT
CAATCTCAATCACATTCCATGTGTTCATTATTTTAAAAAAAAATAAACAAATCTACTAAA
AGCCTATACCTCGTTTCCATGGACTGCATTTCGGAACTGTCGGTACTACGTAAGTTCGTA
GCTACTGGCACAAATTGTACCTGTTTCAGTCTCAAAATTATGGTCTATTGCAACCATTAG
GTCTAGTTTGAGACCCATGATTTGGGCCCACGGTTCCATTCATTATATCGACGGTTCTAA
TAAAATGAGAAAAACGAAACCATTATTTTAAAAATTTTATAGTGAGACGATAGTTCCTGG
GGAAACGGGGTGTATGAGAAAAATAATTGTGGCATCAAATAAAAAAGGAAAATAAAAAAC
AGAAAAAATTTTTTAAATGTTAAATCTTTCCGCATATAATCATTGCAACAATATTTTTAT
TTTATGTACTTTACTTTTATTATTTTTATCGTACTTCGAGCAAATGTTTAGTCTTACATA
TATAGTTTCATTGGCTTATTCATGTACAAGCCTTGTTTTATCGCCTATATGCCTATATTA
TACGCTACAATATTATCTTAGTTTACATGTCTGAAAACTTTTGTTAATAAAAATTTTGTG
AAATTTGGATCTTCGAAAATACAGGACATATAACTGTTATTGATTTGTCTTTTTAACTGC
AAAAGTTTTTCTAGTTTATTTTTGTTATTTTTTTTTATTAAACTTGGTCGCGTAGCAAAC
TGTACA
| PANTHER |
Nectin-2 (IPR033318) - T[67-384] 6.1E-24 |
| SUPERFAMILY |
Ig-like_dom_sf (IPR036179) - T[130-224] 1.56E-7 - T[255-312] 8.31E-5 |
| ProSiteProfiles |
Ig-like_dom (IPR007110) - T[133-237] 10.971 - T[244-320] 8.103 |
| Gene3D |
Ig-like_fold (IPR013783) - T[137-247] 5.4E-12 - T[248-324] 4.5E-5 |
| Pfam |
CD80_C2-set (IPR013162) - T[145-222] 6.2E-7 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|