- Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S47...'
Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S470684.g16001.01.t
Possible name(s)
ASPSCR1; NGLY1; UBXN6
Gene model
Location
S470684 [724 / 6,146]
Amino acid sequence
Length: 416
>Moocci.CG.ELv1_2.S470684.g16001.01.p
MCPFWWIKIKNPVRETAETSQATHSRQGPVREKTMSESQMQAAAAAISRYENSNAPQSKK
KIPQQTARVIEQTAENQENARTSSPDSKEVVLDAAPVLSVRGVQFVSPFNGDVLARSELK
DHYREQLILKLAEDGLTASSQMIHTLNKDKEKVTVAIETLRKYIDNILKSPNEEKFKRIR
KSNKAFSERVSQIEGCEEFLTALGFKLTMLPNNENKEEMYYVLSNEISEEYLKKAKEVLT
TTKKLTSKLFRNPNVFKPTKRKMKFLLPDEFYNVTSGELKKEQQSKTEEVERNQQLRTKA
MREREAQNIIRKYNFTLIRVRFPDGWILQGTFRVTEKLLDLQQFIRDCINQDWVPFDLRT
AVGKVITGEDETLASINLVPAAMINLSWNDEIKAQIAQQNLNLSLKKELLMKAQEL
Nucleotide sequence
Length: 2,019
>Moocci.CG.ELv1_2.S470684.g16001.01.t
ATGTGCCCATTTTGGTGGATCAAAATAAAAAATCCAGTCCGCGAGACAGCTGAAACTTCT
CAGGCTACACATTCTCGACAGGGACCAGTTAGAGAAAAGACAATGTCAGAAAGTCAAATG
CAGGCAGCTGCTGCTGCTATTTCACGTTATGAAAATTCAAATGCACCACAAAGTAAGAAA
AAAATTCCACAACAGACAGCGAGAGTCATAGAGCAAACGGCTGAGAATCAAGAAAATGCA
AGAACATCTTCACCAGATAGCAAAGAAGTTGTCCTGGATGCCGCCCCTGTGTTATCAGTA
AGAGGTGTTCAATTTGTTTCACCCTTTAATGGAGATGTTCTTGCCCGATCAGAGCTTAAG
GATCATTACAGAGAACAATTGATATTGAAACTTGCAGAAGATGGATTAACAGCCTCCAGT
CAAATGATTCATACTTTAAATAAGGACAAAGAAAAAGTTACGGTGGCAATTGAAACATTA
CGCAAATACATTGATAACATTTTAAAATCACCTAATGAAGAAAAATTTAAAAGAATACGA
AAATCAAATAAAGCATTTAGTGAAAGAGTATCTCAAATTGAAGGTTGTGAGGAATTTTTA
ACAGCTTTAGGTTTTAAATTGACCATGTTACCTAATAATGAAAATAAAGAAGAAATGTAC
TACGTTTTATCAAATGAAATTTCTGAAGAATATTTAAAAAAAGCAAAAGAAGTATTAACT
ACAACTAAAAAATTAACGTCAAAACTATTTCGAAATCCTAATGTTTTTAAGCCAACAAAA
CGAAAAATGAAATTTTTGTTACCAGATGAATTTTATAATGTTACCTCAGGAGAACTGAAA
AAAGAGCAACAGTCTAAGACTGAAGAGGTTGAGAGAAATCAGCAATTACGAACGAAAGCA
ATGAGGGAAAGAGAAGCCCAGAATATTATCAGAAAATATAATTTCACATTAATTAGAGTT
CGCTTTCCTGATGGATGGATACTTCAAGGGACGTTTAGAGTAACAGAAAAGTTATTGGAT
TTACAGCAATTTATACGTGACTGTATCAATCAAGATTGGGTGCCGTTTGACTTACGAACA
GCTGTTGGAAAAGTTATTACAGGAGAGGATGAAACGCTAGCTTCTATTAACTTGGTTCCT
GCTGCTATGATTAACCTAAGCTGGAACGATGAAATAAAAGCCCAGATTGCACAGCAGAAC
TTGAACTTATCACTTAAGAAAGAACTGTTAATGAAAGCACAGGAGTTATGAGAATGATTT
ACTTATTTTTTTTATTTATACAACTTTCAATAACTTTAAGCCATTTGGATAATATGCGGT
GACGAGTTTTAATAAGCGCTTGTTCTTTTGCCATTCATCGTTTTTCATCATCGATTCAGT
TTTTTCTTGAATTTCTAAAAATTATAAATGACATCATATTACAATTCTGTATTTTTATTT
TTTATTAAATAAAACAAAATTTAAACATGAGCCTCAGCAGAGACTGAGAGAAGTACTTGG
CAAAATCATAAATTTTATGATTTTTCGAGAGGATAATTAACCTCTTTCCATGTCCACTGG
CCCGGGGCCAAATTTTTTAAAATTCTCTCATATATATATAAATTCTCTCAATTTTGCTTA
TTGGCTCGGTTAGCTTTAAGGCCAATTGGCCCAAGTATATTTTAGGGTCAACTGGCCATG
GCATGGACCGTGAACATGAAAAGATGTTAAATCTTTATCAATTTTAATGAAAATCAATAG
ACTTCTTAGAGAGCCGTTATCTAACTGCATGGAAAATTAGATGGTAGCTTAAAAATTGTG
GATGCTATCAAGTGTACAGACAAACAAAGTGATCAATATACTTAATAAAATTATGATTTT
GCCAAGTAAAAATGTATCCTAATCCCTAAGTATGGGGAGAGTGGTGTTGTACTTGTTTTT
TTTTTGTGTGTACATGTGCAGTGATAATGAAATTAAGTATTATTTTTATATAAAAAATGT
GCATGAATTTGACAAGTTTTATTTATTTAGATTAGTGCA
| SUPERFAMILY |
PUB-like_dom_sf (IPR036339) - T[135-250] 6.67E-27 |
| Pfam |
PUB_domain (IPR018997) - T[150-234] 7.0E-24 |
| SMART |
PUB_domain (IPR018997) - T[155-224] 1.2E-16 |
| SUPERFAMILY |
Ubiquitin-like_domsf (IPR029071) - T[278-386] 5.68E-18 |
| ProSiteProfiles |
UBX_dom (IPR001012) - T[311-386] 11.917 |
| Pfam |
UBX_dom (IPR001012) - T[314-383] 8.5E-6 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| UBXN6_HUMAN | 39.634 % | 243 | 3.56E-76 |
