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  1. Transcript 'KH2012:KH.L99.5.v1.A...'
  2. Transcript 'KH2012:KH.C2.140.v1....'
  3. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S46...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S465121.g15546.01.t

Possible name(s)

PDCD6IP; PTPN23; RHPN1

Location

S465121 [34,177 / 46,390]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 901

>Moocci.CG.ELv1_2.S465121.g15546.01.p
MSTSIEVGRFVTIPLKKTVDLDISKPLETFIKNTFNKVDDDLKRHIKELNSLRKSAVCKA
LDKSAGSLSVVAQYYDQFASLNRKVPFRETGGVHVSFSWKDSLEKGSLFSGTTKITSSNG
EFECLMVIFNMAALKSQIASESNFSSDDGLKSAAKHFMDAAGMFDYIKDNVMSAINQNPS
QDLTPEVLSAFKAIMVAQAQECFYEKANADKMKPDILAKVANQASALYSDAYDAIREVGQ
SFPSSVGAMCNAKKAMYEIYAHFQQASVAHNNKKFGEEIARLKKIEPSLKPLGKSSDLLQ
SFNAKDFATRVSVQLKEAEKENNFIYHDPIPRDLAVIGKAAIAKPKTFNDKEIQGAKFTD
VFVNLLPLAVHDAMESYENRRKEIIDRETNRLREQNTLINGVMSSLNLPAALEDVSGTGN
ALPPSILEKSQTVISKGGMQTLEGLLHELPESLTRNQQLLNECLRMLNEEQTSDDELRQK
FGDKWKRTPSATLTTAFRQEAQKYQTIIQNAQKADGIIQEKVNTHREGIEMLSLPEPQLK
SKIPSASPIAALKDNPVVLELRKLCEQVESLKAEREVIEVELKDAKSDMTEKFTSALASD
GVLNEESISIEELDRVYEPLIAQVTDSVHRQESVLANIQRASEQFSVLKSQSGGTNVREE
LLKKIAAAFDGFQELVANLQEGSKFYNDLTELLLKLQGKCGDLIFARKTEKEELLKDLQQ
NIVSQKPADAQVPVYQQVNRNTPPSRPPPPKAKSPAPQPPQAAEVKPPVAAPRKSATAPA
PPTAAAAPANTPAVGPPANAPYPGQQQPYGGAPYGYGYPPGGMPGYAPPGPGGYAPYPGQ
PQQPYAGYPTQPGVNPGYPQQGYPGQPAPYPPQPGAQYPGYPPQPGQQPYPHQPGYYYPP
Q

Nucleotide sequence

Length: 3,288

>Moocci.CG.ELv1_2.S465121.g15546.01.t
TGTTTGAATTTACAGGAAAATATACAGTATTCTAGCAAATATAATATTTAAATAAAATGT
CAACTTCCATAGAAGTTGGTCGATTTGTAACAATTCCACTAAAGAAAACTGTTGATTTAG
ACATTTCTAAACCGTTGGAAACATTTATAAAAAATACGTTTAACAAAGTTGATGATGATC
TTAAAAGACACATTAAAGAACTCAATTCCCTTCGAAAATCTGCTGTTTGCAAAGCTCTGG
ATAAAAGTGCAGGTTCCTTAAGTGTAGTTGCGCAATACTATGATCAATTTGCATCGTTAA
ATCGTAAAGTTCCTTTCCGTGAAACTGGTGGTGTTCATGTATCATTCTCATGGAAAGATT
CCTTAGAGAAAGGTTCACTTTTTAGTGGCACAACTAAAATCACATCAAGCAATGGAGAAT
TTGAATGTCTCATGGTAATTTTTAACATGGCGGCACTGAAGTCACAGATTGCAAGCGAGT
CAAATTTTAGTAGCGATGATGGCTTAAAAAGTGCGGCGAAACATTTTATGGATGCTGCAG
GAATGTTTGATTATATTAAAGACAACGTTATGTCAGCAATAAACCAAAATCCATCTCAAG
ATTTAACGCCGGAGGTTTTGTCTGCATTCAAAGCGATTATGGTGGCGCAAGCTCAGGAAT
GTTTCTATGAAAAAGCCAATGCAGACAAAATGAAACCTGACATCTTAGCAAAGGTGGCGA
ATCAAGCTTCTGCGTTGTACAGTGATGCTTATGATGCTATTAGAGAAGTTGGCCAAAGTT
TTCCCAGTAGTGTAGGAGCTATGTGCAACGCTAAAAAGGCCATGTATGAGATTTATGCCC
ATTTTCAACAAGCAAGTGTAGCACACAATAACAAGAAATTTGGAGAAGAAATTGCGCGAT
TAAAGAAAATTGAGCCATCTCTAAAACCACTTGGAAAAAGTTCTGATCTACTACAGAGTT
TTAACGCCAAGGACTTTGCTACTAGGGTCAGTGTTCAATTAAAGGAAGCTGAAAAAGAAA
ATAATTTTATTTATCACGATCCTATTCCAAGGGATCTTGCAGTTATTGGTAAAGCTGCAA
TCGCAAAGCCAAAAACTTTTAATGACAAAGAAATTCAAGGAGCAAAGTTTACAGATGTCT
TTGTTAACTTATTACCTTTGGCTGTCCATGATGCGATGGAGTCTTACGAGAACCGCAGAA
AAGAAATCATTGATCGTGAAACAAATCGTCTAAGGGAGCAAAATACTTTAATTAATGGCG
TGATGTCATCTTTGAACCTACCGGCTGCATTGGAAGATGTGTCCGGTACCGGCAACGCTC
TTCCTCCTTCTATATTGGAAAAATCACAGACAGTAATTTCTAAAGGAGGTATGCAAACTT
TGGAAGGATTGCTACATGAGCTGCCAGAATCATTGACCAGAAATCAACAGTTATTGAACG
AGTGTTTACGAATGCTTAATGAAGAGCAAACTTCTGATGACGAGCTTAGACAAAAGTTTG
GGGACAAATGGAAGCGAACCCCATCCGCTACCCTTACTACTGCATTCCGACAAGAGGCTC
AGAAATATCAAACAATAATCCAGAATGCTCAAAAAGCGGATGGTATTATTCAAGAAAAGG
TCAACACTCACAGAGAGGGAATTGAAATGTTAAGTTTGCCAGAACCACAATTAAAATCTA
AAATACCCTCTGCTAGCCCAATTGCCGCACTGAAAGACAACCCAGTGGTGCTTGAACTGC
GTAAATTATGTGAACAAGTTGAATCGCTAAAAGCGGAGCGAGAGGTTATTGAAGTTGAAT
TAAAAGATGCAAAATCAGATATGACTGAAAAATTTACTAGTGCCCTAGCTTCAGATGGAG
TTTTAAATGAAGAAAGTATTTCCATCGAAGAGCTTGACCGAGTTTATGAACCACTCATAG
CACAAGTCACAGATTCTGTGCACAGACAGGAGTCTGTACTTGCTAATATTCAGAGAGCAA
GTGAGCAGTTCTCTGTATTGAAATCCCAAAGCGGTGGAACCAATGTAAGGGAGGAACTAT
TGAAGAAAATTGCAGCTGCTTTTGATGGATTTCAAGAACTTGTTGCAAATTTACAAGAGG
GGAGCAAATTTTACAATGATCTCACCGAACTGTTGTTGAAACTACAAGGAAAGTGCGGTG
ATCTAATCTTTGCAAGAAAAACAGAGAAAGAAGAGCTCCTAAAGGATTTGCAGCAGAATA
TAGTTTCACAAAAACCAGCTGATGCGCAAGTGCCAGTTTACCAGCAAGTAAATCGCAACA
CGCCTCCCTCACGCCCCCCACCGCCCAAAGCAAAATCTCCAGCTCCACAGCCCCCCCAAG
CTGCTGAAGTCAAGCCACCTGTCGCAGCACCTAGGAAATCCGCAACGGCGCCTGCTCCCC
CAACTGCCGCTGCTGCTCCAGCAAATACACCAGCAGTTGGTCCTCCCGCTAATGCTCCAT
ATCCCGGCCAGCAGCAGCCTTATGGTGGAGCTCCGTACGGCTATGGGTACCCTCCAGGAG
GGATGCCAGGATACGCCCCACCAGGGCCAGGGGGTTATGCACCATATCCAGGCCAGCCCC
AACAACCATATGCTGGATACCCCACTCAGCCCGGTGTCAATCCTGGTTATCCGCAACAAG
GTTACCCTGGCCAACCAGCACCTTACCCTCCCCAACCAGGAGCCCAATACCCAGGATATC
CCCCTCAACCAGGCCAACAGCCGTACCCACATCAACCCGGATACTATTACCCACCACAAT
AGATTTGTATGGGACAATATTACCAACTAATATTTCTATTTGATATTATATTTCAACATG
AGGCCACCATGGAATGTATTTTACTGTATTCTCACCAGATACATTATAAGATTATTTTAA
TTATAATCTAAATTGCGGTATTTATTACAAGGTTGTACTGTACAGTGATAGCAAGTAATA
TTATCATTTTGAACATTGTTTGTATTTTTAATTAGATTTATTCTATGTAGCTGACACAAC
CACATTTAATGGTATATATCTGCTGGTTACTTTATAATTTTGCAAGAATCGATATTAAAT
TTTATATTGGTCGATTTGCTTAGCCTGTTTGTAATCTTAAACTTTGATATTTTGTATTAT
ATCCGCTCCTGTCTTGTGAATACTTCTGACTATGTAATATGCAATAAAAGTAATTTTAAA
TTTTCCTATTATATTTCAACATGGAAGTGGAACTATGTATCTTATATTTGCTTCAAACAC
CCAATGCAGTTTTACACATAAATAAAAGTAATTTTATAAACCTTGAAA

InterProScan

Gene3D
BRO1_sf (IPR038499) - T[9-366] 4.1E-105
ProSiteProfiles
BRO1_dom (IPR004328) - T[9-399] 55.182
SMART
BRO1_dom (IPR004328) - T[9-389] 2.4E-115
Pfam
BRO1_dom (IPR004328) - T[11-385] 2.2E-99
Pfam
ALIX_V_dom (IPR025304) - T[422-710] 9.2E-89

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
PDC6I_HUMAN 41.512 % 641 0
PTN23_HUMAN 23.035 % 197 1.25E-51