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Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S456095.g14867.01.t
Possible name(s)
GAA; MGAM; SI
Gene model
Location
S456095 [5,608 / 9,728]
Amino acid sequence
Length: 806
>Moocci.CG.ELv1_2.S456095.g14867.01.p
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TDHPGVLQITVGSKFMESISVKWSFD
Nucleotide sequence
Length: 3,196
>Moocci.CG.ELv1_2.S456095.g14867.01.t
ATGTTTTTACACTCCCACAGACTGGCCTATCGACAAGGATTTTCTGGAATACTTAATTTA
GCGAACACTTACAACTACCCTGCCAACAGCTTGCCAAAGCTTAAATTAAACATAACATTT
GAAACATCAACAATTGTTCGAATTAAAATCGAGGATACAACAAAACTTAGATATGAGGTA
CCGTTACCTCGACCAACATATACACCGGATAGTGCTTCCACTGAAAACACATATATGGTT
GAAGTTGGCCAAAAGAGATTTGGAATTTCTGTTACAAGGCGAAGTAATGGAGCTGTATTA
TTCAATTCGACTATAGCACCATTGTTATTTGGAGACCAGTTTTTACAGATGTCGACGACA
TTGGGTTCAAATTTTGTGTATGGCCTTGGCGAAAGACATGGCAACTTTCTTCTTGATGTA
AACTGGAATCGTTTTTCATTCTGGGCGCGAGACCAGATACCTACTAAAAACGGTAACCTA
TATGGTGACCACCCATTTTACATGGTAATGGAGCCAGCAGGTACAGCTTATGGTGTATTT
TTCCGCAACAGCAATGCAAAGGATGTAGAACTCCAACCCTTGCCTTCTTTGACTTGGAGG
AGTATTGGAGGTGTTTTGGATTTGTATGTTCTTACTGGCCCAACACCAGCTGATGTAGTC
CGTCAGTACATAGAAATTGTCGGCCACCCGTTTATGCCCCCTTTGTGGTCGCTTGGATTC
CACTTGTGCCGGTGGGGTTACGGGACATCTAATACAACACTGGATTACGTGAAGAAAATG
AGAAACGCAGCTATACCCCAGGATGTTCAGTGGAATGACATTGATTACATGGAAGACAAA
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TTACAGTCTCGAACTCTATGTCCTTCTTCCAAGCAACATTTATCCACACATTATAATATT
CACTCACTTTCTGGTACAATGGAAATGCAAGCAACAGCAGAGGCACTTATGGCCATAAGA
AATAAGCGTCCATTTGTTATTTCACGATCTACATTTTCAGGGGCCGGTAAACATGGTGGA
CATTGGTCAGGTGATGTTGTCAGTTCATGGGAATACCTTCGCTATAGCATTCAATCGGTG
CTTTCTTTTAATATGTTTGGTATACCCATGGTTGGCGCAGATATTTGTGGCTTTGGTAAA
TCCACTACAGAAGAGTTGTGTATACGCTGGAGTCAGTTAGGAGCATTTTATCCTTTTAGC
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TTATTTCACTATGCTAATGTAAATGGCACTACTGTTGCAAGACCTTTGTTTTTTGAATTT
CCAAATGATAGAAACACATACAGCATTGAAAGGCAATTTTTGTGGGGTTCAGCTCTTCTA
ATATCCCCTGTTCTTGAAGAACATGTTGAACACATTGACATGTATCTTCCTGCAGGCTTT
TGGTATAGCTTTTCTGGTTCGTTCGGGACTTTGACAGTCTCTGATGGAAAAATGATAAAA
CTTCCAGTTGATCTCAATTTTATCCCATTGCATGTGAGAGGTGGTTCAATATTACCTGGA
GTCTATTCTGAGACTGTCACCAGTGTTTCCTACCCTTATTGGCTCGCGGTAGCTCCAGAT
GAAGAGAATAAAGCTTGTGGCACATTATACTATGATGATGGCGATTCCTTGATGACTTAC
GAACATGGGGAATATGTTTTAGTTGACATGGTCCTCGATGGTAATTCTCTATTTATAAGT
TACAGCAAAGGCGATAAAAAATTATTGTCTTCTATGTATTTAACATCGATTTTTGTGTTT
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CGTAATATTTGATTTTGTTATTTTACTTTTCAACGCTGCAACTGCAACATAACATACCTG
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AATTGTATTGTATATAGTAGGTTTTAATGTATTTAATACAAGAAAATTAAAAAAAAATAT
GGTACTTACAGAATGTTGATGCTATGGTACTAAATTTAATCTTATTATTAACACTGTAAG
TTGTGTAAAGAAAATAAATACCAAGGACCATTTTATGTTAAATATTGTGTACAATTTTAT
TCCTTTTGCTTCATATTTTAAACAACAATTTTCTTTGCCATATTTAATATTGATAAATTG
TGATTTGCCATGCATGTATTCTTATATCAATATTATTTTTAATCACACTGTTTTTATGAT
TTTGCAGAAATATCAA
| Pfam |
Gal_mutarotase_N (IPR031727) - T[13-121] 6.7E-28 |
| SUPERFAMILY |
Gal_mutarotase_sf_dom (IPR011013) - T[23-216] 6.59E-41 |
| Pfam |
Glyco_hydro_31_N_dom (IPR025887) - T[126-185] 1.4E-10 |
| Pfam |
Glyco_hydro_31 (IPR000322) - T[209-678] 1.2E-157 |
| SUPERFAMILY |
Glycoside_hydrolase_SF (IPR017853) - T[218-391] 9.93E-78 - T[426-589] 9.93E-78 |
| ProSitePatterns |
Glyco_hydro_31_AS (IPR030458) - T[383-390] . |
| ProSitePatterns |
Glyco_hydro_31_CS (IPR030459) - T[512-542] . |
| Gene3D |
Glyco_hydro_b (IPR013780) - T[575-674] 2.7E-33 - T[675-806] 2.3E-16 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| MGA_HUMAN | 44.747 % | 644 | 0 |
| SUIS_HUMAN | 41.711 % | 587 | 0 |
| LYAG_HUMAN | 46.388 % | 748 | 0 |