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  1. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S3...'
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  5. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S43...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S438705.g13744.01.t

Possible name(s)

ATG2A; ATG2B; VPS13B

Location

S438705 [13,718 / 31,033]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 1,909

>Moocci.CG.ELv1_2.S438705.g13744.01.p
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SKSSQASVESFKTGSPTFSSIPVQISKTVSTDDQNKEDKDSDDGSDINRNPVIIARCHGE
QELKLRIKQVEMAQGPTVDAECYLGSCSVFLAPHQVHLLTEFAKGFINTPVSHTILPDVQ
AGDTQSGEEQAKSPESLSLSPNMENDISNKWNQGKSWDRENIANTDQFYSLRESPLTLNT
ALPPLGDPPNIPLYFPMDDNDSEITDYSHQSYSSSRLTSTVSPSLLSSPIREPHSFPLRK
DHKFAENTGMKTNYSKYQLKLSSLAITMLHINPLPCHEESKTNKDYLSSSVDRDEDFTST
GSSLLTMSESYFRKCGTCLGQMNNENLAALRKPLAEVCCPHDHIRLLAMHLHVNCEQKCR
KSRENQTLSATNITNVSLGKMELTESLFSDVSKIKTYSHLQQQRFEIINNSNYGILHSEL
LGFSIETSTGVSNAKSLYHSTYPSSNITTPNVVIKLNHQRQRDSKSTVISVNLSDCRSEI
DISIIDRLSTLFNMPDTSKTYTSTTSSLFMQPKTKQNLHPILNQQEMFTAALDDKNEADN
DKVDLLVAATMLKIKFLFPIPDLRPDVERRPWYVRSVRDEYLAFELQQAALETTLISSKS
GDSLQWHSNHIQKPVKEVMFKIHDFHALYADKADNPPQSFLRISTGINSPEMANVSLVEN
MNLECPFIKVSVTPQVNTTSQLQLHENSLFQAGNEMSSMHGTKFNKKEDKLDDADFPMLN
SYTSNDGDNEPSPFSKRKVIYDNEEIVLPGTASEMQTFADEAMSSSQIAITLNLPAVNIV
LVSPQFFDSLYNRINNDLLLWEPTAPQPRNCKSGSIDRNVLIESAYLTTVNHLGIGSQLN
NTNPNNSNEDSDSDDISFQEQSNYKHKAWKINSSYAPKQLSFISVSTNVSHGCVSLRCKD
TKSSNGKGSLEHGEISAMIENLSIFNVAAFHGNPLLDYVCIQASSCSFYHNAHIPSFAHT
ISSTVEPLTSTKPPAHLKAILVRSEEGILSAKNSKIETQSDGKSMLLIAIKITTEDDRPL
KQCLIAATLANATVYHTFAKPGYHWLEQAIDFFDVADDEVLGYTPPAFLTELHIHLNDAA
IVYKPLFINPPLKVCATIGSFSLSSNLVAGAPLSVLQIIIDDAALHISNRCETDQINLTQ
DFVTVVFIDWFEVCLKLRNLEDKNLSDLTYPRIDLQASNNTVKITTCADSCTALAALLTY
LSEDENELHDLMADAILENGLKKTTNAITESLYVPPDTNGLNLDRMYQSVSFPNPIKKKG
SLSDDDFCIIDEDINEMAADEIVPEIKQLPIDGMDNYTIQIHENHFRPSLGKVDELRAPE
NFPAPVFKYMLKELSCIWIMYGGNDFVPDNNANKTSPLRSQKSETCSNQGSERDYGTSME
LHLNKVRFQHEQYPLDTFEAARTVLILSEFEFRDRLKASCINKFLYRFHTSSSPKQAHAK
TLVIKALQIRPEGPYTCPECKLRISLQPLRFNIDQDALTFLTKFFSSISNSAGEVNNEEN
GTFSFYETADGTSVDGVSSSPKSHRVYSNPVMSRPTGSFVGDSTSSVSSSNKTKANNTSS
HMQEPLFFKEVIFSPDVPIRLDYHGKRIDTEQGTFAGLLMGLGQLNCSQLKLKRVTNRHG
LLGVDRVLMFLLSEWASDIRSNQLPSILGGVGPMHSVVQLFQGVKDLVWLPVEQYRKDGR
IVRGLQKGATSFVISIRQGTSTAMALLEVTNKAVCLVQTAAETTYEVVSPAELHRRDRSL
QRNWRTLGTQAARKQPADLREGLSNAVTVMKDGVNDTALAIVKLTQKEHERKGVPGAVGG
ILRQIPPTLVRPVIMASEATSNVLSGMRNQIQPDARKEDEDKWRDPLED

Nucleotide sequence

Length: 8,032

>Moocci.CG.ELv1_2.S438705.g13744.01.t
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ATTAAAGATGCAAATAAATTTACCAAAGATAAGGATGGAACTTATCAGAGAGATGTTTTT
GCTTGCAAACATTTTCGTGCAGTTGGTGTTTCTCTTTCCATAGATGAATTTTCAGAGCGA
AGTAAATCTTCCCAAGCCTCTGTTGAGTCTTTTAAAACTGGAAGTCCAACATTTTCATCT
ATTCCAGTTCAAATATCTAAAACTGTGAGTACTGATGATCAAAACAAGGAAGATAAAGAT
AGTGATGATGGAAGTGACATAAACAGGAATCCTGTAATTATCGCTCGTTGTCATGGAGAA
CAAGAATTAAAGTTACGAATAAAGCAAGTAGAAATGGCCCAAGGACCAACAGTGGATGCA
GAATGTTATCTTGGTTCATGTAGTGTGTTTTTAGCTCCACACCAGGTTCACCTTTTGACT
GAGTTTGCAAAGGGTTTTATCAACACTCCTGTTTCCCATACAATTTTACCTGATGTTCAA
GCAGGTGACACTCAAAGTGGAGAGGAACAAGCTAAAAGTCCTGAGAGTCTATCGCTTTCT
CCGAATATGGAAAATGATATCAGCAATAAATGGAATCAAGGAAAATCTTGGGATCGTGAA
AATATTGCAAATACTGATCAATTTTATTCTTTGAGGGAATCCCCATTAACCCTTAATACT
GCACTTCCACCCTTAGGAGATCCCCCAAATATTCCACTATATTTTCCAATGGATGATAAT
GATTCTGAAATCACAGATTATAGTCATCAATCATACAGTTCATCAAGATTAACTTCAACA
GTTTCTCCATCATTATTAAGTAGCCCAATTAGAGAACCTCATTCTTTCCCTCTACGTAAA
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CTTAGTTCTCTAGCCATAACAATGCTACATATTAACCCTTTACCTTGCCATGAAGAAAGT
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CAACAACAGCGTTTTGAAATCATAAACAATTCAAATTATGGGATTTTGCATTCTGAGTTG
CTGGGGTTTTCGATTGAAACATCTACAGGTGTATCCAACGCAAAATCATTATATCACTCT
ACATATCCAAGTAGCAACATCACTACTCCAAATGTTGTAATTAAATTAAATCATCAGAGA
CAAAGAGATTCCAAGTCAACAGTTATTTCTGTTAATCTATCAGATTGTCGATCAGAAATT
GACATCAGTATAATTGATCGACTGTCAACTCTATTTAACATGCCGGATACAAGCAAAACT
TATACTTCTACAACATCAAGTTTATTTATGCAACCAAAAACCAAACAAAATCTTCATCCA
ATATTAAACCAGCAAGAAATGTTCACAGCAGCATTAGATGATAAAAACGAAGCTGATAAT
GATAAAGTTGATCTACTTGTTGCTGCTACAATGTTGAAGATAAAATTTCTCTTTCCCATC
CCTGATCTACGACCTGATGTTGAGCGTCGGCCTTGGTATGTTCGATCAGTTCGTGATGAG
TATCTTGCTTTTGAACTGCAACAAGCTGCACTTGAAACTACTTTGATTTCTTCTAAATCT
GGGGACAGTTTACAATGGCACAGCAACCACATTCAAAAACCGGTAAAAGAAGTAATGTTC
AAGATTCATGATTTTCATGCTCTTTATGCTGATAAGGCTGACAATCCACCCCAATCCTTT
CTTAGAATTAGCACTGGAATTAATTCACCAGAGATGGCAAATGTTAGTTTGGTAGAAAAT
ATGAATTTAGAGTGCCCTTTCATTAAAGTTTCCGTAACTCCCCAAGTAAACACAACAAGT
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GGGACTAAATTTAATAAAAAAGAGGACAAGCTTGATGATGCAGATTTTCCTATGCTTAAT
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TATGACAATGAAGAAATTGTTTTGCCAGGAACTGCAAGTGAAATGCAAACATTTGCAGAT
GAAGCAATGTCATCTTCACAGATTGCAATAACATTAAACTTACCTGCGGTTAACATTGTT
CTTGTTTCACCTCAATTTTTTGACAGTTTATACAACAGAATCAATAATGACTTGTTGCTT
TGGGAACCAACTGCACCACAGCCAAGAAATTGTAAAAGTGGTTCAATAGACCGAAATGTA
CTCATTGAAAGTGCTTATTTGACAACGGTTAATCACCTAGGTATTGGAAGTCAACTAAAC
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AGCTTTATATCAGTGTCGACAAACGTCAGCCATGGTTGCGTGTCATTAAGGTGCAAAGAT
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ATTCAAGCATCTTCTTGTAGTTTCTATCATAATGCTCATATTCCAAGTTTTGCTCATACC
ATTTCCAGCACTGTGGAGCCATTAACAAGCACCAAGCCGCCTGCTCACCTTAAAGCAATA
TTAGTTCGCAGTGAAGAAGGCATTTTATCTGCAAAAAACTCAAAAATAGAGACTCAATCA
GATGGTAAAAGTATGTTACTGATCGCAATCAAAATTACAACAGAAGATGATAGACCTTTA
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TTTTCTCTCTCATCAAACTTAGTTGCTGGTGCTCCATTGTCAGTTCTACAAATTATTATT
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GAAGATAAAAACCTTAGTGACTTAACATACCCTCGGATAGATCTGCAAGCATCAAATAAT
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CTTTCAGAAGATGAAAATGAACTTCATGACTTAATGGCCGATGCTATTTTGGAAAATGGT
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CTGAATTTAGATAGAATGTATCAAAGTGTTTCTTTTCCCAACCCTATAAAGAAAAAGGGA
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GAAATAGTACCAGAAATAAAACAACTTCCTATAGATGGAATGGATAATTATACTATTCAA
ATTCACGAAAACCATTTTCGACCATCTTTGGGTAAAGTAGATGAACTTAGAGCACCAGAA
AATTTTCCAGCACCTGTTTTTAAATACATGCTAAAAGAACTATCATGCATATGGATAATG
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CAAAAAAGTGAAACCTGTAGTAATCAAGGTAGTGAAAGAGATTATGGTACTTCTATGGAA
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GCGAGAACAGTTTTAATTTTATCAGAGTTTGAGTTCCGCGATCGCTTGAAGGCTTCATGT
ATTAATAAATTTTTGTATCGTTTTCATACCTCATCCAGTCCAAAGCAAGCTCATGCAAAA
ACACTCGTTATTAAAGCATTGCAAATCCGGCCTGAAGGCCCGTACACTTGTCCTGAATGC
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CTTACTAAATTTTTTTCATCAATATCTAACTCAGCTGGTGAAGTTAACAATGAAGAAAAT
GGAACTTTTTCGTTTTATGAAACAGCTGATGGAACTTCTGTTGATGGTGTTTCTTCAAGC
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GGAGATTCTACTTCCAGTGTTTCTAGCTCCAATAAAACAAAAGCTAATAATACCTCATCA
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TTAGATTATCATGGTAAACGCATAGACACTGAACAGGGTACATTTGCTGGATTGTTAATG
GGTCTTGGACAGTTAAACTGTTCACAGTTGAAGCTCAAAAGAGTTACAAACAGGCATGGC
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TCAACAGCCATGGCACTACTGGAGGTTACAAATAAAGCTGTGTGTTTGGTACAAACTGCT
GCTGAGACCACATATGAAGTGGTATCGCCAGCTGAATTGCATCGTAGAGATCGTAGCCTG
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TTATTTGGTTATGTCTTATGAGCAACTTTTCATCATTGGATTATAAGTTAAATTTTGTAA
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TAAAATGTACTTTATGGAATATTAATTGATATAATTATGTCAGTAGTAGCTAAAATGTGT
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GCGAATCTGGCACTTAAATTCCCATAGGCCAGCACATGCCACAGTAAGTTTTTTGGTAAA
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TTTATCGGACCCTGGTTACAACCTTGAAATCTGTTTATTTATAGTATTTTAAAGTGTGTA
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TATACTATAACTCATAAATTATTACTTTTCGTAAAAAGTTAGTTTACAAACTTTGTTTTA
TTCTTTTTCTTCATACGTCAAATATTTTTTAACGTAATGCTTTAATAATATTTATGTAAT
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GTATAAATCCCATTGCACTAATGTAAACTAAATAGAGATGTAAAATATTAAGCTGGTGTT
CCATTTTATGTAATGTTAGCTGTGCAATATAATAAAACAAATACACACAAATGAACAAAT
GAACTTAGTATTTCTATATATTTATTTGATAAACATTTTAAGGTTAAGACCTTAATAAAA
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ATTTTTCTTTGTCGAAATGATCCCAAAAGTATTTTTCTGAATGATCTGCATCATTGTTAC
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CTTTTTTTTCTTCCACCTTCGCAAGTTGTACTTCAGGTTTTTTTGATTCTTTAGCTTTAT
TATCACCACCCGCTTTCTTAGTTTCAGTTTTTTTTTTAGGTGTGACTGCTTTCTTTTTTT
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GTGTAGCAAGGTGTGTATTTAAAACATTCAATATTTCTTTCATGCCTGTCTTGGACTTTT
CAGTAGCCTGCTTATTATACTGCATCATACCCATAGTTGGATAAACCCAAGTACATACCA
ATGGCAAAATTTCATTGTCAGCAAAACCAATCCATTGCAAAACTAAAGGCTCACTTTCAC
GTCCTCTGGTCTGATCGTTTCCTACGTAATACGCAATTGCGTTGGTCTCATTGAGTTTAA
TATCTTCGTCTTCAAATGCTGGTACTTTTCCAAGTGGAAATTTTTTTAAAAAATTATCTG
TTTTGTCAGTTGTACCAAGAACAAAATCGGGCGCGTCCTGGACAACTTTTATATTTTTTT
CTGCATACTTAGACGCTATTTGAATTTTGTAAGCCCGAAAGTTATTAGGGTATGTGTACA
GAGTACCAACCATTTTGTGTATTTTCCAACGAGAACTAAAATATTGATAGTTAAAAGGCC
ACCTGCTTATCAACCTGCCAACAAAGAGCTACGGTACTGAATCTTCAGTTTA

InterProScan

PANTHER
ATG2 (IPR026849) - T[35-1262] 0.0 - T[1322-1905] 0.0
Pfam
Autophagy-rel_C (IPR015412) - T[1812-1904] 1.0E-28

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
ATG2B_HUMAN 32.26 % 876 0
ATG2A_HUMAN 43.699 % 486 8.76E-142