- Transcript 'Harore.CG.MTP2014.S1...' >
- Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S1...' >
- Transcript 'Cisavi.CG.ENS81.R0.1...' >
- Clone 'cima051k09' >
- Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S41...'
Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S419463.g12738.01.t
Possible name(s)
Moocci.CG.ELv1_2.S419463.g12738
Gene model
Location
S419463 [15,574 / 17,380]
Amino acid sequence
Length: 495
>Moocci.CG.ELv1_2.S419463.g12738.01.p
MAKTDPLIKSLKYLIEEFLSSAQVIDDNNPYLAPFCQTIEHGLTQGLVLGKWTAMKDNSQ
SFRRKRFWELLENFQTNGPIPMKISSIITKAKSNKQLRHGDGKFRFVIRSFITKKLIHVL
LEFLMTRIIELKDNWYFKNSAENCIGTSIVTNEHLAEQFRSLLLVTSTSLEFNLKLKNGY
FLDETWLIPEFHEVELVPTNELGVGLIYIDGYGIITNIKPGGVVADSSCIGVGDLLVTMN
DQILFPAKRNGDNNAVNIWQKCKSDGKPCWLAVIKARCPATGSIFTPLKKVLTDYQSFMD
DFNIKKQKKLDEISKATDEKIAKQLSPKSWNNGMAPVMSNQADVEFYEVNYVGEVSVGEF
GGMGRIEGVIKQALTKRNPISIIQVVLEITEININVKARTCSNKTCQDLVHSGTKNNKNF
TCTCNKNIFSHKFSDISSCGKMVSEENHFCYIAGDTFCTISKQFKGYVFEANSLPQAKRI
LNNIYQGFKRTTWFM
Nucleotide sequence
Length: 1,488
>Moocci.CG.ELv1_2.S419463.g12738.01.t
ATGGCAAAAACTGATCCATTAATAAAAAGTTTAAAATATCTAATAGAAGAATTTTTGTCC
TCAGCACAGGTTATTGATGATAATAACCCATACCTGGCACCTTTTTGTCAAACAATAGAG
CATGGTTTAACTCAAGGACTTGTATTAGGAAAATGGACTGCCATGAAGGATAACAGTCAG
AGTTTTCGGCGCAAAAGATTTTGGGAGTTATTAGAAAATTTTCAAACGAATGGACCTATT
CCAATGAAAATCTCTTCAATTATTACAAAAGCAAAATCTAACAAACAACTACGCCATGGT
GATGGAAAATTTCGATTTGTTATTCGTAGTTTTATTACAAAAAAATTAATACATGTACTT
TTGGAATTCCTAATGACAAGAATAATTGAGTTAAAGGACAATTGGTATTTTAAAAATTCA
GCTGAGAACTGCATAGGAACTTCAATAGTTACAAATGAACATCTTGCTGAACAATTTAGA
TCCCTACTACTTGTAACATCAACATCTTTGGAGTTTAATCTAAAACTAAAAAATGGATAT
TTCTTGGATGAAACTTGGTTAATACCAGAGTTTCACGAGGTTGAATTGGTTCCTACTAAT
GAACTTGGTGTTGGTTTAATTTATATTGATGGATATGGAATAATAACAAACATAAAACCA
GGTGGAGTAGTAGCAGATTCATCGTGTATTGGTGTAGGTGACTTGTTGGTTACAATGAAT
GATCAAATACTGTTTCCAGCAAAACGGAATGGAGATAATAATGCTGTAAATATTTGGCAA
AAATGTAAATCTGATGGAAAGCCATGTTGGTTGGCTGTAATTAAGGCGAGATGTCCAGCA
ACAGGAAGTATTTTTACACCACTAAAAAAAGTGCTTACTGATTACCAGTCGTTTATGGAC
GATTTTAATATTAAAAAGCAAAAAAAATTGGATGAAATTTCCAAAGCTACAGATGAAAAA
ATTGCCAAACAATTGTCACCAAAATCATGGAACAACGGCATGGCACCTGTTATGAGTAAT
CAAGCAGACGTAGAATTTTATGAAGTTAATTACGTTGGAGAAGTTTCAGTGGGGGAATTT
GGAGGCATGGGAAGAATTGAGGGTGTTATTAAGCAAGCACTAACTAAAAGAAATCCAATT
TCGATCATTCAGGTTGTTTTGGAAATAACAGAAATTAATATAAATGTTAAAGCAAGGACT
TGCAGTAATAAAACATGTCAAGATTTAGTTCACTCTGGCACAAAAAACAATAAAAACTTT
ACATGCACCTGCAACAAAAATATTTTTTCTCACAAATTTTCTGATATATCAAGTTGTGGA
AAAATGGTGTCAGAGGAAAATCACTTTTGTTACATTGCTGGTGACACTTTTTGTACAATA
TCAAAACAATTTAAAGGGTACGTGTTTGAAGCTAATTCTCTTCCACAAGCCAAGCGTATA
CTTAACAATATATATCAAGGATTTAAGAGAACAACTTGGTTTATGTAA
| SUPERFAMILY |
Run_dom_sf (IPR037213) - T[7-179] 1.29E-12 |
| ProSiteProfiles |
Run_dom (IPR004012) - T[26-179] 11.673 |
| Pfam |
Run_dom (IPR004012) - T[35-177] 1.8E-5 |
| SUPERFAMILY |
PDZ_sf (IPR036034) - T[181-246] 8.67E-5 |
| ProSiteProfiles |
PDZ (IPR001478) - T[193-242] 8.707 |
| Gene3D |
PH-like_dom_sf (IPR011993) - T[305-493] 7.8E-12 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|