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  1. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S1...'
  2. Transcript 'Cisavi.CG.ENS81.R0.1...'
  3. Clone 'cima051k09'
  4. Transcript 'KH2012:KH.C11.299.v1...'
  5. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S41...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S419463.g12738.01.t

Possible name(s)

Moocci.CG.ELv1_2.S419463.g12738

Location

S419463 [15,574 / 17,380]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 495

>Moocci.CG.ELv1_2.S419463.g12738.01.p
MAKTDPLIKSLKYLIEEFLSSAQVIDDNNPYLAPFCQTIEHGLTQGLVLGKWTAMKDNSQ
SFRRKRFWELLENFQTNGPIPMKISSIITKAKSNKQLRHGDGKFRFVIRSFITKKLIHVL
LEFLMTRIIELKDNWYFKNSAENCIGTSIVTNEHLAEQFRSLLLVTSTSLEFNLKLKNGY
FLDETWLIPEFHEVELVPTNELGVGLIYIDGYGIITNIKPGGVVADSSCIGVGDLLVTMN
DQILFPAKRNGDNNAVNIWQKCKSDGKPCWLAVIKARCPATGSIFTPLKKVLTDYQSFMD
DFNIKKQKKLDEISKATDEKIAKQLSPKSWNNGMAPVMSNQADVEFYEVNYVGEVSVGEF
GGMGRIEGVIKQALTKRNPISIIQVVLEITEININVKARTCSNKTCQDLVHSGTKNNKNF
TCTCNKNIFSHKFSDISSCGKMVSEENHFCYIAGDTFCTISKQFKGYVFEANSLPQAKRI
LNNIYQGFKRTTWFM

Nucleotide sequence

Length: 1,488

>Moocci.CG.ELv1_2.S419463.g12738.01.t
ATGGCAAAAACTGATCCATTAATAAAAAGTTTAAAATATCTAATAGAAGAATTTTTGTCC
TCAGCACAGGTTATTGATGATAATAACCCATACCTGGCACCTTTTTGTCAAACAATAGAG
CATGGTTTAACTCAAGGACTTGTATTAGGAAAATGGACTGCCATGAAGGATAACAGTCAG
AGTTTTCGGCGCAAAAGATTTTGGGAGTTATTAGAAAATTTTCAAACGAATGGACCTATT
CCAATGAAAATCTCTTCAATTATTACAAAAGCAAAATCTAACAAACAACTACGCCATGGT
GATGGAAAATTTCGATTTGTTATTCGTAGTTTTATTACAAAAAAATTAATACATGTACTT
TTGGAATTCCTAATGACAAGAATAATTGAGTTAAAGGACAATTGGTATTTTAAAAATTCA
GCTGAGAACTGCATAGGAACTTCAATAGTTACAAATGAACATCTTGCTGAACAATTTAGA
TCCCTACTACTTGTAACATCAACATCTTTGGAGTTTAATCTAAAACTAAAAAATGGATAT
TTCTTGGATGAAACTTGGTTAATACCAGAGTTTCACGAGGTTGAATTGGTTCCTACTAAT
GAACTTGGTGTTGGTTTAATTTATATTGATGGATATGGAATAATAACAAACATAAAACCA
GGTGGAGTAGTAGCAGATTCATCGTGTATTGGTGTAGGTGACTTGTTGGTTACAATGAAT
GATCAAATACTGTTTCCAGCAAAACGGAATGGAGATAATAATGCTGTAAATATTTGGCAA
AAATGTAAATCTGATGGAAAGCCATGTTGGTTGGCTGTAATTAAGGCGAGATGTCCAGCA
ACAGGAAGTATTTTTACACCACTAAAAAAAGTGCTTACTGATTACCAGTCGTTTATGGAC
GATTTTAATATTAAAAAGCAAAAAAAATTGGATGAAATTTCCAAAGCTACAGATGAAAAA
ATTGCCAAACAATTGTCACCAAAATCATGGAACAACGGCATGGCACCTGTTATGAGTAAT
CAAGCAGACGTAGAATTTTATGAAGTTAATTACGTTGGAGAAGTTTCAGTGGGGGAATTT
GGAGGCATGGGAAGAATTGAGGGTGTTATTAAGCAAGCACTAACTAAAAGAAATCCAATT
TCGATCATTCAGGTTGTTTTGGAAATAACAGAAATTAATATAAATGTTAAAGCAAGGACT
TGCAGTAATAAAACATGTCAAGATTTAGTTCACTCTGGCACAAAAAACAATAAAAACTTT
ACATGCACCTGCAACAAAAATATTTTTTCTCACAAATTTTCTGATATATCAAGTTGTGGA
AAAATGGTGTCAGAGGAAAATCACTTTTGTTACATTGCTGGTGACACTTTTTGTACAATA
TCAAAACAATTTAAAGGGTACGTGTTTGAAGCTAATTCTCTTCCACAAGCCAAGCGTATA
CTTAACAATATATATCAAGGATTTAAGAGAACAACTTGGTTTATGTAA

InterProScan

SUPERFAMILY
Run_dom_sf (IPR037213) - T[7-179] 1.29E-12
ProSiteProfiles
Run_dom (IPR004012) - T[26-179] 11.673
Pfam
Run_dom (IPR004012) - T[35-177] 1.8E-5
SUPERFAMILY
PDZ_sf (IPR036034) - T[181-246] 8.67E-5
ProSiteProfiles
PDZ (IPR001478) - T[193-242] 8.707
Gene3D
PH-like_dom_sf (IPR011993) - T[305-493] 7.8E-12

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value