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  1. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S34...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S347873.g09422.02.t

Possible name(s)

ATP1B1; ATP1B2; ATP1B4

Location

S347873 [22,256 / 27,418]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 331

>Moocci.CG.ELv1_2.S347873.g09422.02.p
MSSSDIAEVDNRNRFQKAWDGFKSFIWDPQTKTVMGRTGKSWGKILTFYFIYYGLLACIF
AIAITACLNSLDEYTPSFQTRVQAPGITIQPKTPSLTQQTSDVVFNRNDANSYQKYIDIM
DKFLADYDDSKQANNSEFMTCVKGNANTNQEFNGNEIMKACRFSRSSLGKCSSGTYGYDV
GKPCVILKVNRIINWYPVGYTDLSKATGNSDSKAPPLTQVLSDNGQVYDPYLMYVACYGS
RDEDIKHLNGGTSMSPTVYYPENNGVGFEYFPYFGLKRQPKYLNPLVAVQFTNVSTNVDI
SVKCKAYAYNIEDSARMGIGFFGFYLRVNDK

Nucleotide sequence

Length: 1,663

>Moocci.CG.ELv1_2.S347873.g09422.02.t
ATACTAAATTCTTGTGTATTAACAACATAACAAGCATGTCGTCGAGTGATATTGCTGAAG
TAGATAACCGCAACAGGTTTCAAAAAGCATGGGATGGATTTAAATCATTTATATGGGATC
CTCAGACAAAAACTGTCATGGGTAGAACTGGAAAAAGCTGGGGTAAAATCCTGACCTTCT
ACTTTATCTATTATGGACTTTTAGCTTGTATATTTGCAATAGCAATAACAGCTTGTCTAA
ACTCATTGGATGAATATACACCAAGCTTCCAAACTAGAGTTCAGGCTCCTGGCATTACTA
TTCAACCAAAGACCCCATCTTTAACACAACAAACTAGTGATGTCGTTTTCAATAGGAATG
ACGCTAACTCTTACCAAAAATACATTGATATAATGGATAAATTTTTGGCTGATTATGATG
ACAGTAAGCAGGCCAACAATTCTGAGTTTATGACTTGTGTAAAAGGAAATGCTAATACTA
ATCAGGAATTTAATGGAAATGAAATCATGAAAGCATGTCGATTTTCTCGCTCTTCTTTAG
GAAAGTGCAGCTCTGGCACTTACGGATATGATGTTGGTAAACCTTGTGTTATACTTAAAG
TCAATCGGATTATTAACTGGTACCCAGTCGGTTATACTGATTTATCTAAAGCAACCGGCA
ATTCAGACTCTAAAGCACCTCCATTGACACAAGTATTAAGTGACAATGGACAAGTATACG
ACCCCTATTTGATGTATGTTGCCTGCTATGGATCTAGAGACGAAGACATAAAACACTTGA
ATGGTGGAACAAGTATGTCTCCTACAGTATATTATCCTGAAAACAATGGTGTTGGGTTTG
AGTACTTCCCATATTTTGGGCTTAAACGCCAACCTAAATATCTTAACCCATTAGTGGCAG
TACAGTTTACTAATGTCTCTACAAACGTTGACATATCTGTAAAATGCAAAGCCTACGCCT
ATAACATCGAAGACAGTGCGAGAATGGGCATAGGATTTTTTGGATTTTATCTCCGAGTCA
ACGACAAATAAGTGAACGCATTACACAATTCACCATTGTCAATTTATTAGCAAGTAACTT
ACAAATTTTTCATTTCTTTATACCTGTTAATTGTGAATACCTGTTTGTAAAATTGTTAAA
CATAATCGTTCATATTACTTATTGTTATAATAATTATATCAACATACCTATGTCACTTAA
AATCATCTTTTGTTTTAGGGAAAAAATAATTTTATAAGGTATATAATGATATGGCCATTT
CTGCTCAAGGTTATTGATATGGACTTTTTTTTAATGATTTTTTTTATTTAATAGCAAAAT
CAATCTAAATACAGTGTTTTTTTTATAAGTTAATAATTCAGAACTGCTATATTAATAAAA
ATAAGTGCTTCATGAATTCCTCATAAGGTATCAAAATGTTTATCTAGAAATGGGTATGAT
GGTATTAATTATATTTGTGTATTAAAATCTACAAAGGACATTATGTCCTTACTCGTTTTT
ACCCGTTCCATACTTTTTGCAGTTTTTTAAAATTAGTGTTTAGATTTAAACTATTTTAAA
TAGGTAATAAGCTTTGCCATCTACATCTGTGGATTGTTTTTTGTTAGTTAATCTGATATA
CTTGTTAAATTTTCAATAAATAAATTGTATGTTGTTAAATATA

InterProScan

PANTHER
Na/K_ATPase_sub_beta (IPR000402) - T[10-329] 5.6E-76
TIGRFAM
Na/K_ATPase_sub_beta (IPR000402) - T[13-314] 2.0E-79
Pfam
Na/K_ATPase_sub_beta (IPR000402) - T[14-314] 7.2E-86
ProSitePatterns
Na/K_ATPase_sub_beta (IPR000402) - T[22-42] .
Gene3D
Na/K_ATPase_sub_beta_sf (IPR038702) - T[72-329] 2.9E-61

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
AT1B1_HUMAN 37.919 % 192 2.39E-59
AT1B2_HUMAN 36.164 % 194 1.91E-60
AT1B4_HUMAN 30.662 % 144 1.98E-40