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  1. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S34...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S346543.g09358.01.t

Possible name(s)

PRDM10; PRDM15; ZNF85

Location

S346543 [12,697 / 19,997]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 839

>Moocci.CG.ELv1_2.S346543.g09358.01.p
MLNCDQQQSMEDLSEVDKDTWDSIMSSSENISSSAMFDIDLDNEPDFTVTDKKAKCRAIA
TLPDVLYIKNSGKVKKAVFAKKEIPARTRFGPVDAPLTTKDNLSPCSFLLKLKKMVIGTS
TSNKDEFAYYDLSNINFCNWTSLVQPASCFSHQNLCAHQVDDHIYFTKRKERSVPPKKRG
WKQSNKEIQMKDTNNDILPDSSEQSAIVSKIKDRKSNSKIVHSDVRSYLCQYCGNTYKRI
DKLTEHIKKKHMETLVSIQEPSSSTKIASEEPEELSHLDGFPYKCKTCKIGFRRRGMYLN
HILKRHPNIKIGDLPELTMPILKHVRDFLCPHCEKHPGKAIPPSIRTVLKANPTTTTINQ
EASIEAGQVIEVEPVKCMYCEKQYSSKGKLNKHVSDKHSEMVSGTGLFESMQKTAKDSAN
SNFSFQSNNNNVPQSSIAGQYTSYQKNDSVNSMSRFNYPPKSGLGTTHIGQNSNVHMMNQ
PIPNQTFLTCNTTQASENSMLFTGQSPSKFTSTHHVHPRKQMIHALDQENNRNRASSQQF
YANSHSQSQPNFNSDKQFIQHDFSIPVPLINVNNKNNHHAPHRSEYSNIIAQDYNGGVQN
EVIATNIAVSTTPASDTESSKVQIPDIPEDPSTHHQLMQTVQALLETDGHLDSNGIVNLQ
SEHDTTNQQNSTDWLSPYDSIVPVPYDSNKANNGNNEYNMTLPDSTTKVTMYRILFKKGT
ITHFLNKTEKEERVLIQYLIQSCDKNTIRYQELVSLKEDICNKNKTDLWLGLETDGSPIQ
YMSITYRDRNYALNGVMTLNGLDGVLGRIKPLVQPAPLFVNEGQSPENLSGLRLENSEI

Nucleotide sequence

Length: 2,520

>Moocci.CG.ELv1_2.S346543.g09358.01.t
ATGTTGAACTGTGACCAACAGCAATCAATGGAAGATTTGTCTGAAGTGGACAAAGATACA
TGGGACAGTATAATGTCTTCAAGTGAGAATATAAGTAGCTCTGCAATGTTTGATATTGAT
TTGGATAATGAACCAGACTTCACAGTTACTGACAAAAAGGCAAAGTGTAGAGCAATAGCT
ACTTTACCTGATGTTCTTTACATTAAAAACTCTGGTAAAGTTAAGAAAGCAGTATTTGCA
AAAAAAGAAATTCCAGCTAGAACAAGATTTGGCCCAGTAGATGCACCACTAACTACAAAA
GATAATCTTTCCCCATGCAGTTTTTTATTAAAATTAAAGAAAATGGTTATTGGTACCAGT
ACGAGTAATAAGGATGAATTTGCATATTATGATCTCTCTAATATAAATTTCTGTAATTGG
ACTTCTTTGGTTCAGCCAGCTTCTTGCTTTTCTCATCAAAATTTATGCGCTCACCAAGTT
GATGACCACATTTACTTTACCAAAAGAAAGGAACGAAGTGTTCCTCCTAAAAAGCGTGGT
TGGAAGCAGTCCAATAAAGAAATTCAAATGAAAGATACAAACAACGACATATTGCCTGAC
AGTTCTGAGCAAAGTGCAATAGTTTCGAAAATTAAGGATCGAAAATCCAATTCAAAAATT
GTTCATTCAGATGTAAGAAGTTACTTATGTCAGTATTGTGGCAATACATACAAAAGAATT
GATAAGTTAACTGAGCATATAAAAAAGAAACACATGGAAACATTAGTTAGCATTCAAGAA
CCTAGTAGTTCCACTAAAATAGCTTCAGAAGAACCTGAAGAATTAAGCCATTTAGATGGA
TTTCCATATAAATGTAAAACTTGTAAAATTGGTTTCAGAAGAAGAGGGATGTACTTAAAT
CACATTTTAAAACGACACCCTAATATTAAAATTGGAGATCTACCTGAACTTACTATGCCC
ATATTAAAACATGTTCGTGATTTTTTATGTCCTCATTGTGAAAAACACCCAGGTAAAGCC
ATCCCTCCCAGTATAAGAACTGTTTTAAAAGCAAACCCTACTACTACCACCATTAATCAA
GAAGCTAGTATTGAAGCTGGTCAAGTCATAGAAGTAGAACCTGTAAAATGCATGTATTGT
GAAAAACAATATAGCAGCAAAGGAAAGTTAAACAAGCATGTTAGTGATAAACATTCGGAA
ATGGTATCTGGAACAGGTCTTTTTGAATCGATGCAAAAGACAGCTAAAGATTCAGCAAAT
TCTAATTTTTCATTTCAATCTAATAATAATAATGTACCTCAAAGTTCTATTGCGGGTCAA
TATACAAGTTACCAGAAAAATGATTCTGTTAACTCAATGTCTAGGTTTAATTATCCACCT
AAATCTGGTCTTGGCACAACACACATAGGGCAAAATAGTAATGTTCACATGATGAATCAG
CCAATTCCAAACCAAACATTTTTAACATGCAATACTACACAGGCAAGTGAAAACTCAATG
TTATTTACCGGTCAAAGTCCTTCCAAGTTTACAAGTACCCACCATGTACACCCTAGGAAG
CAAATGATCCATGCATTGGACCAAGAAAATAATAGAAACAGAGCAAGTTCTCAACAGTTT
TACGCTAATAGTCACTCACAATCACAACCAAACTTTAATTCTGATAAACAATTCATACAA
CATGATTTTTCAATACCGGTACCACTTATAAATGTTAATAATAAAAACAATCACCATGCA
CCACATAGAAGTGAGTATTCTAATATTATTGCACAAGATTACAATGGAGGAGTACAAAAT
GAGGTCATTGCGACAAATATAGCTGTGTCCACAACACCAGCTTCTGACACAGAAAGCAGT
AAAGTTCAAATACCTGATATACCAGAAGACCCTTCCACACATCACCAGCTGATGCAAACT
GTTCAAGCATTACTTGAAACGGATGGTCATTTGGATTCTAATGGAATTGTCAATCTGCAG
TCTGAACACGATACAACTAATCAACAAAATTCAACAGATTGGTTGTCACCTTATGACAGT
ATAGTACCAGTACCTTATGATAGTAATAAAGCTAATAATGGAAATAATGAGTATAACATG
ACTTTACCAGATTCAACAACCAAAGTGACCATGTACCGAATTTTATTTAAAAAAGGTACG
ATAACACATTTTTTAAATAAAACAGAAAAAGAGGAACGAGTTTTAATACAATACTTAATT
CAAAGTTGCGATAAAAACACAATTCGATACCAAGAGTTGGTTTCATTGAAAGAAGATATC
TGCAATAAAAATAAAACAGACCTATGGCTTGGTCTTGAAACAGATGGGTCACCAATACAA
TATATGAGTATAACATACCGGGATAGGAACTATGCATTGAACGGGGTAATGACATTGAAT
GGCCTTGATGGGGTTTTGGGTAGGATAAAACCCTTGGTTCAACCCGCCCCGTTGTTCGTA
AATGAGGGGCAGAGCCCGGAAAATCTGAGTGGCCTTAGGTTGGAGAATTCTGAAATTTAA

InterProScan

SUPERFAMILY
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SMART
Znf_C2H2_type (IPR013087) - T[228-251] 0.032 - T[283-306] 0.067 - T[375-398] 0.013
ProSiteProfiles
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ProSitePatterns
Znf_C2H2_type (IPR013087) - T[230-251] . - T[285-306] . - T[377-398] .

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
PRD10_HUMAN 36.818 % 147 2.99E-36