- Transcript 'Moocul.CG.ELv1_2.S86...' >
- Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S30...'
Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S306991.g07768.01.t
Possible name(s)
SNX30; SNX4; SNX7
Gene model
Location
S306991 [3,296 / 10,348]
Amino acid sequence
Length: 439
>Moocci.CG.ELv1_2.S306991.g07768.01.p
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AGFKMQETYVVYLVESKPKDIGSIDDDVSSVWRRYSEFELLRNYLFVNYPYVVMAPLPEK
RANYVWTKISTDTFDPEFLDRRKAGLESFIHRIASHEILSNDPILLKFFTQEQSWKETVL
ATGYQAKSDSWLQTINASWRVKDPDKSIEDLRTYANELQKNISSVLQTRAKLADRLYAID
KIHGNYDRIFKEWSQHEDAKCAEAMRKASVQMDRLANSIDMNMEEEEMYAEQLKEYLHFS
DALKGVIKKHEFLQYDLESAKNQLSSAQAEKQRIESGGPKGFSFGGVKAKLFGGDTPEQK
EQKLQQISETINNYEKNVEEKTQRSREFLTKAQNEVELFKRRKTADLQEILTNNIILKIK
MCKEEKEIWTKFKETISEI
Nucleotide sequence
Length: 3,175
>Moocci.CG.ELv1_2.S306991.g07768.01.t
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AAAAATCGGATGATGAAGATTTATTCGATAAAGAAGGTATTTCTATAGAAAACGACGAAA
TAGCAACACCAAGTTCTAATCACGATAATTCAGAAGACAAGAATGTAATCCGAAAAACTT
TATTTGAAAGACTTGACATTAAAATTGCTCAACTAGAGAAGCAAGTTAAAACTGCAGGGT
TTAAAATGCAAGAAACATATGTTGTTTATCTGGTTGAATCAAAGCCAAAAGATATTGGAA
GTATAGATGATGATGTATCTTCAGTATGGAGGAGGTATAGTGAATTTGAACTACTAAGGA
ACTACCTTTTTGTGAATTACCCTTACGTTGTCATGGCACCATTGCCAGAAAAACGAGCGA
ATTATGTGTGGACCAAAATTTCTACTGATACATTCGACCCTGAATTTTTGGATAGACGAA
AAGCAGGTTTGGAATCCTTTATACATCGTATTGCAAGTCATGAAATCTTAAGTAACGACC
CTATCCTACTTAAATTTTTTACTCAAGAACAAAGCTGGAAAGAAACTGTTTTAGCTACTG
GTTATCAAGCAAAATCTGATTCTTGGTTGCAAACGATAAATGCGTCATGGAGAGTTAAAG
ATCCAGACAAAAGTATCGAAGATTTGAGGACTTATGCAAACGAATTACAAAAAAACATAT
CATCTGTTCTACAAACAAGAGCGAAACTTGCCGACAGATTATATGCAATAGATAAAATCC
ATGGAAATTACGATAGAATATTTAAAGAATGGAGTCAACATGAAGACGCAAAGTGTGCAG
AAGCTATGAGAAAGGCGAGTGTTCAAATGGATCGATTGGCAAACAGCATAGACATGAATA
TGGAAGAAGAAGAAATGTATGCTGAACAATTAAAAGAATATCTTCATTTTTCTGATGCTT
TAAAAGGTGTAATTAAAAAACATGAATTTTTACAATATGATTTGGAGTCAGCAAAAAATC
AACTATCTTCTGCGCAAGCTGAAAAACAGCGAATTGAAAGCGGTGGACCCAAAGGATTTT
CATTTGGAGGAGTTAAGGCTAAGCTATTTGGTGGGGACACCCCTGAGCAAAAAGAACAAA
AACTTCAACAAATATCCGAAACAATTAACAACTACGAAAAAAATGTTGAAGAGAAAACGC
AAAGATCACGAGAGTTTTTAACAAAAGCACAAAACGAAGTCGAACTATTTAAAAGGCGGA
AAACTGCTGATTTGCAAGAAATTTTAACTAATAATATTATATTAAAAATTAAAATGTGCA
AGGAAGAAAAAGAAATATGGACCAAATTTAAAGAAACTATTTCAGAAATTTAGACTTAAT
TTTGTTATATAATATGTAAGCTCATTTATTTATTTCTAAAGTCACTAGCATTACTGTATG
TCATTTTGTGCTTTCATCTGCCATATTGTAGTTGAAACTAAAAACAAAATAAATATACAA
AAATAACTGATTTCTTAAATAAGTTTATATTTTGATTTAAATACACCTTTACTTTGATAA
TAAAATAAATATTTTATAATATATACCTGTATTTTTATATAATAAATTTGTAATTTATCA
TTTGAAGATTTAACAACAATTTTAGTTTTACCTACAATTAATAATGTTATGTGTATGTCC
AGTATAAGTTTAATGCTGCAATTGATGTTATAGAAAATTACATTGTATCATATTTATCGT
GCAATAAATGTATATTTTGAAATAATATTATATTTATAGTATGGTATATAAATTATTTTA
TTGGACAAAGATTCACAGTAACGCAAAATGCTTCTCAGCTTTAGATATCAGTCGATAAAA
TAACCTTTCCAGCTTTCAGTTGACTTGCAAAATTAGCAGCAATGGGATCTGCCATAAAAG
TAGCAACAGCAACAACATTTTTGTTTTTGTTAATGTAATAAGCACAAAATTTTCCTTCTT
CAATGCTACCCTTAATTTTAACAGTATCATATTTCATTCCATATCCTGTATACCTTAAGC
TTTTTCCATATTGCACAGACCAAAAGAATGGTACAGAATCTACCTCCATAGACTTGTTTG
CCATATTACAACCGGCAACTTTTCCATGGTACAATGCCATTTGCCAATGCTGAATATTTG
CATTTTCATCGTTGTTGATTTTGAGTGGAAATAAAGTAATGTCTCCTGCAGCATAGATAT
TTGGAATATTTGTTTGTAAATTTTTATCTACTTTTACAAATCCTCTGTCCATGTTTAATC
CACTACCTTTAAGGAAATCTGTGGCTGGTACGACTCCCACCCCAGCAACTGCAATATCCG
CTTCAACTACTTTTCCATTTTGTAAAACAGCTTTTTTTAAGACTCCATTTTCTCCTTGTA
GCTCTGTAACAGATGCATTCATACAAAATTTTACACCTTTATCTTCATGCATTTTCTGAA
TCATTTTTCCGACTTCAACACCTAAAACTCGTTCAAATGGAGTACTAAAATATTCACACA
CTGTTAAACTTGACGCTTTGCTAACAAGGAAAGATGCAACCTCCATACCGATGAAAGAAG
CTCCTATTACCAAGACCTTTTTACCCTGAGCTTTTGTAGCAATTTTGTTGGCGTCTTCGG
GTGTACGTAAAATATAGACATTTTTAAGATCCCATCCTGGAATAGGTAGAGTGCGAGGTT
TCCCACCTGTTGCTAATAATAACTTGTTGTATGATATATTATTTCCATCTTCAAGTGTAA
CAGTTTTGGATTCAGAATTGAGACTTATAACTTCCTTTCCCAATAGAATGTCAATTCCAT
TTTCTTTATAAAAATCTTCGTTTCGCAGCTGAATAGACTGTGCTGATACATCCATTGCTT
TACTTAGCTTTGGTCTGTCATAAGGTAGATTTCTATCCAAAGTTATCATAGTGATTTTTC
CGGAATATTCATTTTGACGTAATGCTTCTGCACATGTTACAGCAGCAGCTCCTCCTCCTA
TTATAACTGCATTGTCTGAGTTCGTAATAGTAACTTTAGATGTTTTAACTCTTTTATGAC
AAACTAATCTTGAGGGCTCAGCTGAGATAAATACTTTATCATTTTCTTTTTTAACTGTAA
ATGCTTGAAGACTATCTAATCCAGGAAAATCTTCAATGTCTCCAGTTTTACTGTT
| PANTHER |
SNX4 (IPR034783) - T[31-428] 1.7E-107 |
| Gene3D |
PX_dom_sf (IPR036871) - T[42-198] 5.4E-29 |
| SMART |
Phox (IPR001683) - T[45-172] 8.1E-20 |
| ProSiteProfiles |
Phox (IPR001683) - T[50-176] 16.749 |
| SUPERFAMILY |
PX_dom_sf (IPR036871) - T[62-173] 4.45E-24 |
| Pfam |
Phox (IPR001683) - T[63-171] 9.6E-19 |
| Gene3D |
AH/BAR_dom_sf (IPR027267) - T[199-439] 9.6E-27 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| SNX4_HUMAN | 46.115 % | 377 | 5.93E-128 |