Login
Help

TRANSCRIPT CARD

Submit your Data

  1. Transcript 'KH2012:KH.C1.542.v1....'
  2. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S29...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S293155.g07285.01.t

Possible name(s)

AC093525.1; ATP6V0B; ATP6V0C

Location

S293155 [35,837 / 38,986]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 155

>Moocci.CG.ELv1_2.S293155.g07285.01.p
MSSTAGPDYAPFFSAMGATAAMVFSALGAAYGTAKSGTGIAAMSIMKPELIMRSVIPVVM
AGILAIYGVVIAVLISQKMVIGMTLFTAFLHLGAGLSVGLSGLAAGFAIGIVGDAGVRGA
AQQPRLYVGMILILIFAEVLGLYGLIAALVLIVRG

Nucleotide sequence

Length: 1,200

>Moocci.CG.ELv1_2.S293155.g07285.01.t
ATATGTTTTTCAGATTATATTAATATTTTTAACATTCTTTATAAAGCATCTGCAATCTTT
TTAAACCACCCATTTAAGTTTGTACATTTATAACTTCCAAATTAAATCAAAATGTCAAGT
ACAGCAGGTCCAGACTATGCACCTTTCTTCAGTGCTATGGGAGCAACTGCTGCTATGGTT
TTTAGTGCCCTTGGAGCAGCTTATGGAACTGCAAAATCCGGCACAGGAATCGCAGCCATG
AGTATAATGAAGCCTGAACTTATAATGAGATCAGTCATTCCAGTTGTTATGGCTGGTATT
CTTGCGATTTACGGCGTAGTCATAGCAGTGTTAATTTCACAAAAAATGGTTATTGGAATG
ACTCTTTTTACTGCGTTTTTACATCTTGGTGCTGGGTTGTCTGTGGGACTTTCTGGGTTA
GCAGCTGGGTTTGCTATTGGTATAGTGGGTGATGCTGGGGTCAGGGGAGCAGCTCAACAA
CCCAGGCTGTATGTTGGTATGATTCTTATCCTTATTTTTGCTGAAGTTTTGGGTCTTTAC
GGTCTTATTGCTGCATTGGTGCTTATCGTCAGAGGTTAAAGGTCAAATACAGTCTGCAAT
ATATAGTTCTCTAGTCCCAACTCCGTTATTGAGTTATATTGTTTATGAAATTAATATATA
TATTATTATTATTATTCATTAATATTGTATGTTAATAATCCTGTCTCATTTTATGTACAC
GTAAAAGATATTTATTATGTGTTTGTATAAATAGTCTCAATTTTGTTAAGTGAAATTAGA
TCAAATATGACTCAAGATAACCAAGTTAAAAATATTCAATCAGAACCTTATTAAAGCTGT
AAGTGGTACAAAATGCCTTGGAAAATACTTAGCCTAATAAGCTAAATTAGATATATATTT
TTAATAAATTTGGACAAACTTTTTAAATATTGACACCATTTTTGTGTATGTATAGTAACT
CCTAAAATCGTTTTTTATTTTTCTGCTTCTAACAAGCATTTTGCATATAATGAACACGGT
GATAATAACTTTTACAACAATGAATTTACTGGGTAAGCTTACCACCACATCATGATCACC
CTATGTCAAATGAAGTTGAAAGATTTGTTGGTTATAATAAATAATATCCTATACAAATGA
CATGAAGTGGTGGTTAAGTTAATAATAACCTTACCTTGTTCTTTGTTTGTTAAAGTGTTG

InterProScan

TIGRFAM
ATPase_proteolipid_su_C_euk (IPR011555) - T[12-117] 7.6E-47
SUPERFAMILY
F/V-ATP_Csub_sf (IPR035921) - T[12-77] 4.71E-6 - T[83-153] 2.09E-18
Pfam
ATPase_proteolipid_c-like_dom (IPR002379) - T[16-75] 3.1E-12 - T[92-151] 2.3E-20
PRINTS
ATPase_proteolipid_csu (IPR000245) - T[29-53] 1.2E-57 - T[55-79] 1.2E-57 - T[103-129] 1.2E-57 - T[130-153] 1.2E-57

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
VATL_HUMAN 76.471 % 228 2.74E-78
VATO_HUMAN 31.646 % 77.4 2.34E-18