Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S279277.g06755.06.t

Possible name(s)

VAMP1; VAMP2; VAMP3

Gene model

Moocci.CG.ELv1_2.S279277.g06755

Location

S279277 [35,863 / 42,414]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 124

>Moocci.CG.ELv1_2.S279277.g06755.06.p
MDKSYGGTDTGAGGPVGGGSGNKRLQQTQAQVDEVVDIMRTNVDKVLERDEKLSELDNRA
DALQQGASQFETQAAKLKRKYWWKNCKMIIMLSLVVAIIYLSSQVTRIIDEEFSSTTILK
IPLN

Nucleotide sequence

Length: 1,810

>Moocci.CG.ELv1_2.S279277.g06755.06.t
ATGGATAAGTCATATGGAGGCACGGACACAGGTGCTGGAGGCCCAGTTGGTGGCGGATCA
GGAAACAAAAGATTACAACAAACACAGGCTCAAGTTGATGAGGTTGTTGATATTATGAGG
ACGAATGTTGATAAAGTATTAGAAAGAGATGAAAAATTATCAGAACTCGATAACAGAGCT
GATGCATTGCAACAAGGGGCATCTCAATTTGAAACACAAGCGGCAAAGCTAAAAAGAAAA
TATTGGTGGAAAAATTGCAAGATGATAATCATGCTTTCATTGGTTGTGGCAATAATATAT
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ATGGTTTGGTAATATGGTTCTGTAAAGTATAATATGTTCTATTCTATATTGTGTATTCTG
TAGAAAGAGTATTGTAATTGTGTTGTTCCTGTTATTTTGCATGTTATGTATATATTTTAT
AAACTTGCTTAATATTCACTAGGCTATTTAATATTTGCGAATATTTATATACAAATAACA
CTTACATATTAGATTAACTATATCTGGTTTAACAAACTATGCTTTAAAAATGTTATTATT
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TTTTATTATAATTTGGTGAAATACTTTTTAACATATGTTACATGAATTAAAAAATGTAAA
ATGTTTTCACACAAAACTGTGTTTAATACAGTATAAAATATCAATACGTGATCCAAAAAT
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TTCAATAAGTTCAATGTCTCTTTCAAGTTGTTTCATTTCAGCTTCCATTCTTTCTTTTCT
ATTCTTTTTGGGAGCTGTGTCTGTCACTACTGACAACCCCTGATATTGGTGATGAAGTTC
TTCCCAATTTTTCTTTAAACCAGAAATTATTTCGTCTCTTTCGGATTCGGACAGCTGTTT
CATAGCTCCTTGTCTTTTTCTTTCTAAGATGTAGGCATCGTATTCTTCTTGTGCTCTTCG
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ATATTTGGGAACTAAACCAGATGTTTCCAGAAGATTATTATCACCAATACGAGTATCAAC
AAATTTGGGAAGTGGTTTTTTAGGCACAGACATAATATTTTCAACAGCATTAGAATTAAT
AAAATTTTTA

InterProScan

Pfam	Synaptobrevin (IPR001388) - T[22-100] 5.0E-32
ProSiteProfiles	Synaptobrevin (IPR001388) - T[24-84] 18.917
PRINTS	Synaptobrevin (IPR001388) - T[29-48] 2.5E-24 - T[49-68] 2.5E-24 - T[85-104] 2.5E-24
ProSitePatterns	Synaptobrevin (IPR001388) - T[42-61] .

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
VAMP3_HUMAN	82.667 %	132	1.31E-41
VAMP2_HUMAN	84.932 %	131	8.14E-41
VAMP1_HUMAN	79.487 %	134	4.76E-42