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  1. Transcript 'KH2012:KH.C12.450.v1...' > 
  2. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S27...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S279277.g06755.04.t

Possible name(s)

VAMP1; VAMP2; VAMP3

Gene model

Moocci.CG.ELv1_2.S279277.g06755

Location

S279277 [35,863 / 41,179]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 133

>Moocci.CG.ELv1_2.S279277.g06755.04.p
MSYHPVPNPNGRSYGGTDTGAGGPVGGGSGNKRLQQTQAQVDEVVDIMRTNVDKVLERDE
KLSELDNRADALQQGASQFETQAAKLKRKYWWKNCKMIIMLSLVVAIIYLSSQVTRIIDE
EFSSTTILKIPLN

Nucleotide sequence

Length: 1,881

>Moocci.CG.ELv1_2.S279277.g06755.04.t
GTTGTTTTTATAGCATTCTATTAACTGAATTCTAGAATTAGAAAATGTCTTATCATCCTG
TACCTAATCCTAATGGCAGGTCATATGGAGGCACGGACACAGGTGCTGGAGGCCCAGTTG
GTGGCGGATCAGGAAACAAAAGATTACAACAAACACAGGCTCAAGTTGATGAGGTTGTTG
ATATTATGAGGACGAATGTTGATAAAGTATTAGAAAGAGATGAAAAATTATCAGAACTCG
ATAACAGAGCTGATGCATTGCAACAAGGGGCATCTCAATTTGAAACACAAGCGGCAAAGC
TAAAAAGAAAATATTGGTGGAAAAATTGCAAGATGATAATCATGCTTTCATTGGTTGTGG
CAATAATATATCTGTCGTCACAAGTAACCAGAATAATTGATGAAGAATTCAGTTCAACAA
CCATCTTAAAAATTCCTTTAAATTAAAAAAAAATTTGTTATAATTTTTTCGTACTACTGG
ACTGTTATAAAAAGCCAATCTTAGGAGTATTTATTACATTGCAAAATGGTCAACAAAAAA
CTAGTATTTTAGTTCATTCATTACCATTTAATTGTACGAAAAAGTTAATTAACCAAATTA
ATATAAATTTTAAATAAGTTGGTTGTAAAAATGTTATATTACAGAAAGCTTTCCTTTAAA
TGACAGTTTTGGATAGAGTTAAAGCACTTCTTAACAAAAGTTTTAGACATGGTTTTAAAT
CATAATAGGCATTATAATATTTTTATATGGGAGGTTTTTTAATTATACGGATGATTTGAT
AAACTTGACGTAAAAATTCTACATAAGCAACCATATGTTGACCCAGTTTGTCATTTGCAC
AATAATAGAAATCCTTACATGGGTCTGATGGGATCTGTGTAATAATATATTAATTTACTC
ACTTCAATTTGTTTATATATTTTCAAACTTTTTACCACCAAGCTATGTTTTTACTGTACT
TGTTCATAACAATGGTTTGGTAATATGGTTCTGTAAAGTATAATATGTTCTATTCTATAT
TGTGTATTCTGTAGAAAGAGTATTGTAATTGTGTTGTTCCTGTTATTTTGCATGTTATGT
ATATATTTTATAAACTTGCTTAATATTCACTAGGCTATTTAATATTTGCGAATATTTATA
TACAAATAACACTTACATATTAGATTAACTATATCTGGTTTAACAAACTATGCTTTAAAA
ATGTTATTATTCTAATTTTTACTTCGCAATTAGTGTATCAATTGGTTAATAAAGCAGTCA
CAATGACTTTATTTTATTATAATTTGGTGAAATACTTTTTAACATATGTTACATGAATTA
AAAAATGTAAAATGTTTTCACACAAAACTGTGTTTAATACAGTATAAAATATCAATACGT
GATCCAAAAATAGGAATACATAAATTTACTATATATAGTTAATTATTAGCAATATAAATA
ATTTTATGCTTTTCAATAAGTTCAATGTCTCTTTCAAGTTGTTTCATTTCAGCTTCCATT
CTTTCTTTTCTATTCTTTTTGGGAGCTGTGTCTGTCACTACTGACAACCCCTGATATTGG
TGATGAAGTTCTTCCCAATTTTTCTTTAAACCAGAAATTATTTCGTCTCTTTCGGATTCG
GACAGCTGTTTCATAGCTCCTTGTCTTTTTCTTTCTAAGATGTAGGCATCGTATTCTTCT
TGTGCTCTTCGAACTTCTTCATTCCTTTTTAATAAATATTCTGGAACTTTACCATAGTCT
TCCTTTTTACAATATTTGGGAACTAAACCAGATGTTTCCAGAAGATTATTATCACCAATA
CGAGTATCAACAAATTTGGGAAGTGGTTTTTTAGGCACAGACATAATATTTTCAACAGCA
TTAGAATTAATAAAATTTTTA

InterProScan

Pfam
Synaptobrevin (IPR001388) - T[31-109] 6.2E-32
ProSiteProfiles
Synaptobrevin (IPR001388) - T[33-93] 18.917
PRINTS
Synaptobrevin (IPR001388) - T[38-57] 2.9E-24 - T[58-77] 2.9E-24 - T[94-113] 2.9E-24
ProSitePatterns
Synaptobrevin (IPR001388) - T[51-70] .

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
VAMP3_HUMAN 82.667 % 133 1.37E-41
VAMP2_HUMAN 84.932 % 132 4.87E-41
VAMP1_HUMAN 79.487 % 134 6.34E-42