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  1. Transcript 'KH2012:KH.C14.232.v1...' > 
  2. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S27...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S279277.g06755.03.t

Possible name(s)

VAMP1; VAMP2; VAMP3

Gene model

Moocci.CG.ELv1_2.S279277.g06755

Location

S279277 [35,863 / 41,179]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 165

>Moocci.CG.ELv1_2.S279277.g06755.03.p
MSYHPVPNPNGRSYGGTDTGAGGPVGGGSGNKRLQQTQAQVDEVVDIMRTNVDKVLERDE
KLSELDNRADALQQGASQFETQAAKLKRKYWWKNCKILSNPVPMIIMLSLVVAIIVIIVI
NVGDSDSRKLILFYMQLHKVYLSSQVTRIIDEEFSSTTILKIPLN

Nucleotide sequence

Length: 1,977

>Moocci.CG.ELv1_2.S279277.g06755.03.t
GTTGTTTTTATAGCATTCTATTAACTGAATTCTAGAATTAGAAAATGTCTTATCATCCTG
TACCTAATCCTAATGGCAGGTCATATGGAGGCACGGACACAGGTGCTGGAGGCCCAGTTG
GTGGCGGATCAGGAAACAAAAGATTACAACAAACACAGGCTCAAGTTGATGAGGTTGTTG
ATATTATGAGGACGAATGTTGATAAAGTATTAGAAAGAGATGAAAAATTATCAGAACTCG
ATAACAGAGCTGATGCATTGCAACAAGGGGCATCTCAATTTGAAACACAAGCGGCAAAGC
TAAAAAGAAAATATTGGTGGAAAAATTGCAAGATTCTTTCTAATCCAGTTCCCATGATAA
TCATGCTTTCATTGGTTGTGGCAATAATAGTTATTATAGTTATCAATGTGGGCGATTCTG
ATAGTCGTAAGTTAATCCTGTTTTACATGCAATTACATAAAGTGTATCTGTCGTCACAAG
TAACCAGAATAATTGATGAAGAATTCAGTTCAACAACCATCTTAAAAATTCCTTTAAATT
AAAAAAAAATTTGTTATAATTTTTTCGTACTACTGGACTGTTATAAAAAGCCAATCTTAG
GAGTATTTATTACATTGCAAAATGGTCAACAAAAAACTAGTATTTTAGTTCATTCATTAC
CATTTAATTGTACGAAAAAGTTAATTAACCAAATTAATATAAATTTTAAATAAGTTGGTT
GTAAAAATGTTATATTACAGAAAGCTTTCCTTTAAATGACAGTTTTGGATAGAGTTAAAG
CACTTCTTAACAAAAGTTTTAGACATGGTTTTAAATCATAATAGGCATTATAATATTTTT
ATATGGGAGGTTTTTTAATTATACGGATGATTTGATAAACTTGACGTAAAAATTCTACAT
AAGCAACCATATGTTGACCCAGTTTGTCATTTGCACAATAATAGAAATCCTTACATGGGT
CTGATGGGATCTGTGTAATAATATATTAATTTACTCACTTCAATTTGTTTATATATTTTC
AAACTTTTTACCACCAAGCTATGTTTTTACTGTACTTGTTCATAACAATGGTTTGGTAAT
ATGGTTCTGTAAAGTATAATATGTTCTATTCTATATTGTGTATTCTGTAGAAAGAGTATT
GTAATTGTGTTGTTCCTGTTATTTTGCATGTTATGTATATATTTTATAAACTTGCTTAAT
ATTCACTAGGCTATTTAATATTTGCGAATATTTATATACAAATAACACTTACATATTAGA
TTAACTATATCTGGTTTAACAAACTATGCTTTAAAAATGTTATTATTCTAATTTTTACTT
CGCAATTAGTGTATCAATTGGTTAATAAAGCAGTCACAATGACTTTATTTTATTATAATT
TGGTGAAATACTTTTTAACATATGTTACATGAATTAAAAAATGTAAAATGTTTTCACACA
AAACTGTGTTTAATACAGTATAAAATATCAATACGTGATCCAAAAATAGGAATACATAAA
TTTACTATATATAGTTAATTATTAGCAATATAAATAATTTTATGCTTTTCAATAAGTTCA
ATGTCTCTTTCAAGTTGTTTCATTTCAGCTTCCATTCTTTCTTTTCTATTCTTTTTGGGA
GCTGTGTCTGTCACTACTGACAACCCCTGATATTGGTGATGAAGTTCTTCCCAATTTTTC
TTTAAACCAGAAATTATTTCGTCTCTTTCGGATTCGGACAGCTGTTTCATAGCTCCTTGT
CTTTTTCTTTCTAAGATGTAGGCATCGTATTCTTCTTGTGCTCTTCGAACTTCTTCATTC
CTTTTTAATAAATATTCTGGAACTTTACCATAGTCTTCCTTTTTACAATATTTGGGAACT
AAACCAGATGTTTCCAGAAGATTATTATCACCAATACGAGTATCAACAAATTTGGGAAGT
GGTTTTTTAGGCACAGACATAATATTTTCAACAGCATTAGAATTAATAAAATTTTTA

InterProScan

Pfam
Synaptobrevin (IPR001388) - T[31-120] 9.0E-31
ProSiteProfiles
Synaptobrevin (IPR001388) - T[33-93] 18.917
PRINTS
Synaptobrevin (IPR001388) - T[38-57] 2.7E-22 - T[58-77] 2.7E-22 - T[99-118] 2.7E-22
ProSitePatterns
Synaptobrevin (IPR001388) - T[51-70] .

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
VAMP3_HUMAN 79.221 % 132 8.29E-41
VAMP2_HUMAN 84.286 % 127 1.18E-38
VAMP1_HUMAN 72.941 % 128 6.63E-39