- Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S24...'
Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S246039.g05579.01.t
Possible name(s)
AP1G1; AP1G2; AP2A1
Gene model
Location
S246039 [7,357 / 21,029]
Amino acid sequence
Length: 515
>Moocci.CG.ELv1_2.S246039.g05579.01.p
MAAVQRHRTTVLDCLKDPDPSILRRAMELCFALINHNNIRGTMRELLSFLSRCPPEFKSD
CASGIFLVAEKFSPNRRWHIDTMLKVLTTAGNYVRDDTVPSLIHLLSDTEKLQSYSVYSL
YKEAKLEENFSQQPLMQVSAWCIGEYGDILLAGVVDEEETVQVSESEVLTLLESLLDSSL
SNNTTKSYAINAIMKLSTRMPNMTGRIQSIMSNYGDSHSMEVQQRAVEYTTMFSKHNNLR
PGVLEPMPKFEKLTLPEDQPEAGDSEVLVGANQKEETTMPVPTTANPSSNVDLLLDLVDM
SSEPAAPAPAANPQANIYNLLEQMNQPAPATNGIGGTTSGSGSMDILGGMLDLGGTPANM
PMTNMAPVASNGLDSLLNMGSGTPASNPMQMQSNSIPDIVAFDKVETGLKIVFSFEREPN
SPVLNVHICATNSTSAPFNDFVFRAAVPKTLQLQMLPPSGNVIAPGNSGTVKQTIRLNNP
NKVALRMRMKITYTVNDQPITQTGEVNNFSPLTYQ
Nucleotide sequence
Length: 4,482
>Moocci.CG.ELv1_2.S246039.g05579.01.t
TTTTCTTTAGCTTGAAACTTTAAAGCTTCTACCAAGCCAAAGATTTACAGATAAACGTAT
TGGCTACTTGGGCGCTATGCTGCTTTTGGATGAAAATAGAGAAGTTCAACTTTTGATGAC
TAACTCGCTTAAAAATGACCTGGACCACCCTTCACAATATGTACAAAGCCTTGCCTTATG
TACCCTTGGCAATGTTGGTTCAACAGAAATGGTAAGGGACTTGGCATCGGATGTTGAAAG
ATTAATGAGAGCTTCAAATGCATATATTAAGAAAAAGGCAATTCTTTGTGCCTGTCGTGT
AATAAGGAAAGTTCCTGAGTTAATAGAAAATTTTGGACCATTAACGAAAGCATGTCTAAA
TGATAAACACCATGGTGTTGTTTTGGCCACTGTATCCTTAATTACTGAAATGTGTCGGCA
AAGTAATTCAACTTTAAAATCATTTAAAAAGCTTGTACCAACGCTTGTCAGAATCCTAAA
GAACCTCATCATGTCCGGATATTCACCAGAGCACGATGTTTCAGGAATCAGTGATCCTTA
TTTACAGGTACGAATTATAAGATTACTTCGAATTCTTGGACGACAGGATAGTGAGTCAAG
TGAAACAATGAATGACATTTTGGCGCAAGTTGCGACTAATACAGAAACAAATAAAAATGT
TGGAAATGCTATATTGTACGAGACAGTTATAACTATAATGGATATTAAATNTTAATTTCA
TTTAACCAGGTTCTAGCTGTCAATATACTTGGTCGTTTCCTTTTAAACAACGATAAAAAC
ATAAGATATGTTGCATTAAACTCCCTTCTTAAAACTGTCACCACGGATATGGCAGCTGTC
CAAAGGCACCGGACAACGGTACTTGATTGTCTCAAAGATCCTGATCCTTCTATCTTGAGG
CGTGCAATGGAACTTTGCTTTGCTCTTATAAATCACAACAATATTCGTGGAACAATGAGA
GAATTACTGTCATTTTTATCAAGATGTCCTCCTGAGTTTAAATCTGATTGTGCTTCCGGT
ATTTTTCTTGTTGCGGAAAAGTTTTCTCCGAATCGGAGGTGGCATATTGACACCATGTTA
AAAGTCCTTACCACTGCTGGCAATTACGTACGTGACGACACAGTTCCCAGTTTAATTCAC
TTGCTTTCGGACACTGAGAAACTGCAGTCTTATTCTGTCTACAGCCTTTACAAAGAGGCA
AAACTAGAGGAGAACTTTTCCCAGCAACCTCTAATGCAAGTTTCTGCATGGTGTATTGGG
GAGTACGGGGATATATTACTTGCTGGTGTTGTTGATGAAGAAGAAACTGTACAGGTTTCG
GAATCTGAAGTACTGACATTACTAGAAAGTCTCTTGGATTCTTCCCTCTCAAACAACACA
ACAAAATCTTATGCAATTAATGCCATTATGAAGCTAAGCACCAGGATGCCAAATATGACT
GGTCGAATTCAATCTATTATGTCAAACTACGGGGACTCACACAGTATGGAAGTTCAGCAG
CGTGCAGTAGAATATACTACCATGTTTAGCAAACATAATAATCTACGACCTGGTGTCCTT
GAACCGATGCCCAAGTTTGAAAAGCTTACCTTACCAGAAGATCAACCAGAAGCTGGCGAT
AGTGAGGTGTTAGTTGGTGCAAACCAGAAAGAAGAAACAACAATGCCCGTCCCAACCACT
GCAAATCCTTCTAGCAATGTAGACTTGTTGCTGGACCTTGTTGACATGTCAAGTGAGCCA
GCAGCGCCCGCCCCAGCGGCAAACCCTCAAGCAAACATCTATAACCTTCTTGAACAAATG
AATCAACCTGCACCAGCTACCAATGGCATTGGAGGTACTACTAGTGGATCAGGATCGATG
GATATTTTGGGAGGAATGTTGGATCTTGGTGGTACTCCAGCCAACATGCCTATGACAAAT
ATGGCTCCAGTGGCATCTAATGGTTTAGATTCCTTGTTGAATATGGGAAGCGGTACTCCT
GCTTCAAATCCAATGCAGATGCAAAGTAATTCCATACCTGACATTGTCGCTTTTGACAAA
GTGGAAACTGGTTTGAAGATTGTATTTTCGTTTGAAAGAGAACCTAACAGCCCTGTTTTA
AATGTCCATATTTGCGCTACCAATTCGACCTCAGCTCCTTTTAACGACTTTGTGTTTCGA
GCTGCTGTTCCAAAGACTCTCCAGTTGCAAATGCTACCACCTTCTGGCAACGTTATAGCA
CCAGGAAACAGTGGAACAGTGAAACAAACAATCAGGCTTAACAACCCAAACAAGGTTGCC
TTGCGTATGCGAATGAAGATAACGTATACAGTTAACGATCAACCAATAACTCAAACCGGA
GAAGTTAATAATTTTTCACCCCTGACTTATCAATGATAATACGCAACTAATTGTATATAT
TATATATCATATATCAATTGAGTCCAATGCCTAGGATCATATTAACACAGTGCACTATAG
CTTTTTAATTTCTTAGCGAGAGACATAACTCCTCGAAACATTATGTGTATCAAAGGTTTA
ACTATCTAAAACCATTCCTTCCACATTAGTGAGATACTTTTATTATATTGTGCAAATTAT
TTAATAAAACCTGCTTTGAATATTATATGCTAGATAAAAAAGACATCAAGAGACTACAAA
TCTCCGATGAGTCTCCATTTTAATGTCGTATTACAGACAAATTTTTGACTTTTGTATAAT
TTATATAAGTTTGACCACCATGTTGTATCTAAAATTTCCAAATTTTAAAGATATATTAAA
TGGATTACCTGGTATTTTCCTATATTACCAAAAACATAAAACTACAGGCGGCGAAACAAG
TTTTAAGTTGTTCTATTATTTGATTTTCTTTTTACAGTATAGATTTTAACATTCGAGACT
TTTGTATTAAAATACCTGTTTAAATCAACAGTTTCTTAACCACAATTTTAACCTTTTACT
ACACTCAAATAGTATCCCTAATTTGGTCACGTGAATGTATATTTTGTTTATCCTTAACTT
TATGAGAAAAAATCCTGACACTGCAACGGAAATAATAAAATATTTGTTGCAATATTAACA
TTTCACAATCAATATGGAATTTTTTATAATTTTTCCACTATAATTTTAATATACTTTTGT
GACTATTGTTTTGCTAGTAAATAATTTTATAATTTTCCGTAACTGTAAATGAGTTATACC
TGTGCTAGATAAAGTGTCTTTCTTCCTGGAAAATAAAATTATGTATTTATAGTGCTATGG
TCAAGCCTGTAGTATACCATGAAAACCTGCGTCCAACAAAAATATAGAGTTGGATTCAGT
CTCTATTACACACACTTACAATCTATTAAATAAGCTTATTTCAGCTTTAACCAATCTTTC
ATCCAACCGTGATCAAAAGGTTTTTATTTTATGCAGGATAAGCTGTGATACTGGAGTAGT
AATACTATACCTCTTTTTGACTTTTAAAAAATTGGTATCAGCTTGATAAGAATGAAACTT
TCTCTTAGTTTTAATCTAGCTGTATTTCTATAGCTTAGTTAATGATATGCTAAATAACTT
CAATATTGGTACTACGAAAATACCAATATTGCCAAGTTATATTGTAATGATACAACATCA
CTTCTGGCAGCATCAGTTTTGCAAAATACAACTTTATCCAGCTATTGTTTGAAATATGTG
TGTGCCTGCACTAACTTATTTGAAAATAAAAAGTTGAAACTAAAGTAAAATTCTTTTTTT
AATTTTCACACAAGTCATCTTTAAATTAGAGATATACAAATTTGTAATTCCTTGCCTATA
TGTTTATACCTAAATGCTAAAGCTTATCTTTAATATGACCATTATTTTAACTTTACTGTA
TTCTTATCGTGCTAGCAAACTTTATTGTATTTATAGCCCATGTATTATTATTATATTAGG
ATTTTGATGATCTACATGTATATTTAACACTAAAACTGACTTCAGTTAGTTAGATTATAT
TTTGAAACTTAATTTTCTTGTTGAACACAAAAAATGCTATTTTTATTTTAATGCCAGTTC
TTTTTCAAATAAATTTTAGTTACATCTGAATAAAAGTTTTCCTAAATTTCTCATAAATGG
ATGTATTGTTTTACAAAAACTGAGTTTAAACATTAAAGGTTATAATTTTTTTTCCCAATT
TTGACCAATGTTTTGCCATATTAAAGAAGTTGTGTTTAAAATGAATTTAAATAAACATTT
TAAGCCAGTGTGGTAATTATATCCACAGTGGGACTGAAATTTAATTAAAACTTTATTTAA
TAAAGACAAATTAACTTATACTAACTATGCCACTATATTTATAGATATGTTTTATGTATA
TACATTATTTTCATATTATTAAACGTTTTAAGCAGATTGTGACTTCTCTACCAAGTGACG
TATGCGCGAGTAATACATACAATAATTTTGTGAAAATTTGTGTTAAATTAATCAAAATCA
AATGGTATATAAATAAAAATTTATATTTAAACTTGCAAAAAA
| Gene3D |
ARM-like (IPR011989) - T[1-251] 4.1E-84 |
| SUPERFAMILY |
ARM-type_fold (IPR016024) - T[3-261] 3.5E-36 |
| Pfam |
Clathrin/coatomer_adapt-like_N (IPR002553) - T[3-236] 1.1E-42 |
| SMART |
Clathrin_a/b/g-adaptin_app_Ig (IPR008152) - T[391-510] 2.5E-34 |
| SUPERFAMILY |
Clathrin_app_Ig-like_sf (IPR013041) - T[391-512] 1.29E-34 |
| ProSiteProfiles |
GAE_dom (IPR008153) - T[394-510] 44.859 |
| Pfam |
Clathrin_a/b/g-adaptin_app_Ig (IPR008152) - T[407-510] 8.8E-28 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| AP2A1_HUMAN | 26.19 % | 99.4 | 8.73E-22 |
| AP1G1_HUMAN | 45.247 % | 426 | 5.25E-141 |
| AP1G2_HUMAN | 51.22 % | 296 | 1.29E-91 |