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Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S222563.g04923.01.t

Possible name(s)

RNF13; RNF167; ZNRF4

Gene model

Moocci.CG.ELv1_2.S222563.g04923

Location

S222563 [58,016 / 66,134]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 335

>Moocci.CG.ELv1_2.S222563.g04923.01.p
MNNSMDTKLLTLLSSLVKCLRDRRRTRRSRLSLARLKQLPVKKFEKGNEYDVCAICLDEY
EEGDKLRILPCKHAYHCKCVDPWLTSSKRVCPLCKQKVLSDDESSSDSEDEESDDENTPL
LSTSTAAASPNAPRWATGFSRQNPILRAFRRNRRQRLISDSSDDTDTESGGENSVSNIRV
SSPRITRLSHQQSADIESNGPLLMQHRTSEQESSVVEEVEPCCSYGNRQNGHRRDRSDDY
IHSAEVYIEGTTRRSNASITIISDDEKNGSDSVNSSLSASGEYQSIASNQPEAVCLSEPE
SELVNSGVYQSVDSEEDDDIIVLTQGSHQSQAEEV

Nucleotide sequence

Length: 2,616

>Moocci.CG.ELv1_2.S222563.g04923.01.t
ATGAACAACTCGATGGATACTAAGTTATTGACATTACTTTCATCGCTTGTAAAATGCCTC
CGTGATAGAAGAAGAACCCGAAGAAGTCGTCTCTCACTTGCAAGACTTAAACAACTTCCT
GTTAAAAAGTTTGAAAAGGGAAATGAATATGATGTTTGTGCAATTTGCCTTGATGAATAT
GAAGAAGGAGATAAATTAAGAATACTTCCTTGTAAACATGCTTATCATTGCAAATGCGTA
GACCCATGGTTAACAAGCAGCAAAAGAGTTTGTCCTCTTTGTAAACAAAAAGTTTTAAGT
GATGACGAAAGCAGTTCAGATTCCGAAGATGAAGAAAGTGATGATGAGAACACTCCACTT
CTTAGTACATCTACTGCAGCAGCTTCACCAAATGCACCAAGATGGGCAACCGGTTTCAGT
CGCCAGAATCCTATACTAAGAGCTTTCAGAAGAAACAGGAGACAAAGATTAATCTCAGAC
TCTTCTGATGATACTGACACTGAAAGTGGTGGGGAAAATTCTGTTTCAAATATTCGAGTA
TCAAGTCCAAGAATCACTCGGTTAAGCCACCAACAATCTGCTGATATAGAATCAAATGGA
CCTTTACTTATGCAACACCGAACTAGTGAACAGGAATCAAGTGTTGTTGAGGAAGTTGAA
CCTTGTTGTAGCTATGGAAATCGTCAAAATGGTCATCGCAGAGATAGATCAGATGATTAC
ATACATTCTGCAGAAGTCTATATAGAAGGAACCACAAGGAGATCAAATGCATCAATAACC
ATCATATCAGATGATGAAAAAAATGGGTCAGATTCAGTCAATTCTTCTTTATCTGCCTCG
GGAGAATATCAAAGTATTGCATCTAACCAGCCAGAAGCTGTTTGTTTGTCTGAACCAGAG
AGTGAATTGGTAAACAGCGGCGTTTACCAATCTGTAGATAGTGAAGAAGATGATGACATC
ATCGTATTAACCCAAGGTTCTCATCAGAGTCAAGCCGAAGAAGTTTAAGAAAATAAACTA
AAACACCTTTATTTTTATTGCAACAGTGGTATTTTTGACACTGGCAGGATATGATATAAA
TACAAACTAAAAGTTCACAAGCATCTTATCTTAATAACTTATCATATGAACTATGGAATA
ATATAATAAGTTAAATAAGATGATATATTGTCAAGAAATATTTCCTTACAGAAAATGAGT
ATCATATTTCGTAGAACTAATTTAAAATACTCTTTAATACTTGTTGCAATGAAGCCATGT
TAAAAGTATACAATAGTACATACACATACATGCATAACTCTATTTTGCCTAAATTAAATT
TACACCAGACGACTACATTAGTATCTGTTTAAGTTTTTCTAAATTACAGTAAAATTAATC
CTCGAAAAAAGTAGTCTAGCAGATTTGCTTGCTAAAAATTGTTTAAACTAACCTACTATT
TTATATTAAAGTTAAAGTATTTTTTTTTTTTTGGTCAAATTGCTCAAAACCTGGTACAGG
TTATATATTACNNNNNNNNNNATATAAATACAAACTAAAAGTTCACAAGCATCTTATACA
TATTTTGTATTAATAACTATCGTGATGAATTTTTTATTTAATATGTTTTAATCTTACTAG
TTGTAAGATAATTTAACTTTTATTTAATATTATTTCCATATTCTTTCTTTAATGTAACGT
AACATAGGAATTCTAATTTTATTTTGTAAATTAAAGTAATTAATTTATCATAAATACGAT
TAAATTATCATTTCATTTGTAGAATCTCAAATTTCTTAAAATTAGAATATCAGATTGACC
AAAAAATATTTTAGGCCAACTTTTACAAAACAGCTATATACAACATTTAAGGCCTTAAAG
TTACTGAAATATGATGGAAGCTTTTTTAAAATTAATTTCTCCTTTTTGTCAATTCAATTT
TTTTCAGAGCAAGTGTACAATGTTAGTTGGGTATTGTGCATTTATTATCTCAGGAAATAC
AGAATAAAAGAATTTTTTGAGAACATTTTAATTAACAATGTGAAATGAACAAAGACCGAA
AATTAATAAAAAGCATGAAAAAATTTTTTCACAAAAAATTCACTGTTTTATATTGTATCT
ATTTAGTTTTAGATAAGTCACATCACACAACAAAAATTAGATAAACATTTCCTTTTTTTT
AATTGTTTGTTTTGATTTTTACATGTCTATAGATTTTATAGTTTGTAATGTGCTGCATTT
CAATTCCAAAATCTTATGATTTTGGATAATTAGACAGGGTTATTTCCTGAAGTAATTTTA
CAGCGGAAACAGAAACCACTTTAATAGCTACATTTACATGTCACTTTTATGTTCCATAAA
TTTCTAACTTGTATTGAAATGAGAACAAAAAATATATAACCGTTATTATTGATTAATGTT
CTTTTTTAATTTTTGTGTATTACACATACTTTTCATTGTATATATGTATAATTTTTATTT
ATTATTTTCTTTTATATAAATTTTAGTCAAAATGAAATCTTAAATTATATTGCCTTGTAT
ATAATTATTGCCTATGTTGATTAATAAAATTAACAAAATTGCAGATCTGTTTTTAAATTT
GTTGAAAAATTTTTTTTAACATGAAATTCAAAACTA

InterProScan

Gene3D
Znf_RING/FYVE/PHD (IPR013083) - T[29-105] 3.3E-20
Pfam
Znf_RING (IPR001841) - T[52-95] 1.9E-13
ProSiteProfiles
Znf_RING (IPR001841) - T[53-95] 12.799
SMART
Znf_RING (IPR001841) - T[53-94] 3.4E-8

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
RNF13_HUMAN 58.974 % 136 5.93E-37
RN167_HUMAN 59.036 % 129 8.55E-35
ZNRF4_HUMAN 47.573 % 92.8 5.92E-21