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  1. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S1...' > 
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  4. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S21...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S217951.g04789.01.t

Possible name(s)

PDE6D; UNC119; UNC119B

Gene model

Moocci.CG.ELv1_2.S217951.g04789

Location

S217951 [56,256 / 62,537]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 150

>Moocci.CG.ELv1_2.S217951.g04789.01.p
MQMATEKAEKILGGFKLNWMNLRDANSGKILWQGSDDLSRPGKEHEARVPKKILKCKAVS
RELNFSSVEAMEQFRLEQRVLFKGRVLEEWYFQFGFVIPDSTNTWQSTIEAAPQGQMMPA
NVLSGNVVIETNFYDHEMLVSQSKVRLFYV

Nucleotide sequence

Length: 2,414

>Moocci.CG.ELv1_2.S217951.g04789.01.t
CATAAAACTGTAAAATGCAGATGGCGACTGAAAAAGCTGAGAAAATATTGGGTGGTTTTA
AACTGAACTGGATGAACCTTAGAGATGCAAATTCTGGAAAAATATTGTGGCAAGGAAGTG
ATGATTTATCAAGGCCTGGAAAAGAACATGAAGCTCGTGTACCAAAGAAAATCCTAAAAT
GTAAAGCAGTTTCACGAGAGTTAAACTTTTCATCGGTGGAGGCTATGGAACAATTTCGAC
TTGAGCAGAGGGTTTTGTTTAAAGGACGTGTATTAGAAGAGTGGTACTTCCAATTCGGAT
TTGTAATACCAGATTCAACCAACACCTGGCAATCAACAATTGAGGCTGCACCACAAGGAC
AGATGATGCCCGCAAATGTATTGAGTGGAAATGTTGTCATTGAAACAAATTTTTATGATC
ACGAAATGCTTGTTAGTCAGTCCAAGGTACGACTCTTCTACGTGTGATACATAAATGTTT
GTTTTATAGAATGCGGTGCTACCGTTAAAATGCAATAGTTTAAACTTTATACGTCTTGAA
GATTTTATATTACACTGTAACTGTATTTTCTTTTACTTTAATTCTAAGAGGCCAATTACT
GTAGGGTAATAATTTACTGTCATTTTATCTGTATGTTCATTTGTTTTTGATGTAGGTTGA
TATGCCAACCTCATACCGATTATAGTAAATCTTAAAAATCGTTACGATAGCATTACAATA
GTATAATTTATTTTAATTTTATGACCAAAACATTCTGAAAATATTTTTTACTTTAAATCT
ATTTAAATTACTAAATACTGCACTTCATAGATTTGAAGTACAATTATAATAGTACATACT
GACTATTATAGTTGTGTATTTTTGTATAAAATGAAGATAATCACAAAGAACTTTATTTAC
CATGGCATAAAAATTTTATATATTTTTCATATTTTATTTTTAAAAAGAAGTCATATATTG
TGTTATACTGTTTTAAAAAACATCATTATTGTGTAATGGTGTAATGTACATTGGTGTTGG
TGGAATTTATATCTTAAAGTTTCAAGAAATGTATTCCTATGCTTAATAGAAAAATTGTAT
TACATGCTTTTTAACTGGTGGGTTTAATTTTCATAGTTCATGGTATTTATTTTTCAATTA
TTGCCATGTTGTAATGCTGCAACACTCAGTTTAAAAGGCTCATATTCCCTTTTTTAATAC
TTTTGCTTGAATATGCATAAGTAACTTTGCACATAAATTGTAATTAGCAAGAAAGGGATG
TTCTTTTTTCACCACAATGCATAATTTAGATCTTGTTTATTTATTTATTTTATTAATTAT
TAAACACAGTTATATAAGATCAAGTATAGTGCTTGCTGCCCTCTAGATATTTTACTGCAC
CCATAACTGAATATGGATCTATAAATTGATTATATAAACAAAGCTCACTTTAGGATTATA
TCTATTGTTGAAATATATTGATTTATTTCTTTGTTCGTTTGCAATTATAATGAAAGCTAA
TATGTCAAACCTGTTAGTAATATGAATAAAATTCTCATTACATAACACATACATTTTTAT
AACAAATGATTTTGGTATTAATTATAAAAATGATTTTGGTATTAAAATTCAATTAACATT
TATTGTATTGCAGTAAATATGGATTTTAAAATGTTGCCAAAATAGTCAATAATATAAGTA
AATGTTATTCGGAGTAAATATAAATAATATTGATCTCTTGAATATACAGTCTTTTTAATG
TCATAATTTCTATGTGCATAGTAACTAGTATTTAATCGCAATCAAAACTTGTAATCTAAA
AAAAATCAATGCCTAAGACTTTTTTATCAGAAATAATTACAATTTTTTACAAATAATTAC
AACATTCTGTAAGTTACCTTTATTAGGGATTTGTATCTTTAAATAGCCATGTTTTTTCTT
TTAACCAAAATCGTTAATTTTCCAACTTTTGACATTTACTTGGTGACTAGATTTTATCTC
TTATATGCTGTATTTTAAATGTTGAACATACCAATAAAGGTTTAAGTTATTTCAGAAATA
CACTCACTTTATGTCAGTTTGTATAAACCAAGGGATTTAGAAGGGAATAACTCTTTATCG
CCACCTTACTGTTTAAATGTGGTAGTAAAAGCATTTTTTACTCTGGATGGCTTGGTATTA
TCTATACAACAACTATTATTTTCCAAAATAATACAGTTGTAATCATAATAATAGTGATAT
GAATGATAAAATTGCTGTAAATATGTTGTAGAAATTTTAAAACACATTTTCAAAATGTCT
TGTTCACTATGTGTAGTCATTCCTTAAAAGTGTTTTCTATAAAAAATTTTCTAAGTTTCA
TTCTATGTGTGAATTTATATGTACTTTGTATATTTTATTACTGATATATGTTAAAAATAA
ATCTTTATTTTACA

InterProScan

Gene3D
PDED_dom_sf (IPR037036) - T[1-150] 1.2E-71
PIRSF
Rhodop-sen_GMP-Pdiesterase_dsu (IPR017287) - T[1-150] 1.2E-75
SUPERFAMILY
Ig_E-set (IPR014756) - T[5-150] 2.1E-49
Pfam
PDED_dom (IPR008015) - T[10-149] 1.2E-42

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
PDE6D_HUMAN 75.333 % 245 4.0E-85