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Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S204636.g04350.01.t
Possible name(s)
SYT1; SYT2; SYT5
Gene model
Location
S204636 [2,499 / 12,069]
Amino acid sequence
Length: 415
>Moocci.CG.ELv1_2.S204636.g04350.01.p
MKKAVIMESLFRMKRESNNASAPVPTVADVAAAATEGKAGTQAPNVIEEKLKEEANKIFK
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EKVQPDVGDLSNGEKEEEEKKLGKLQFSLDYDFQANNLTVGVIQAADLPGMDMSGTSDPY
VKVYLLPDKKKKHETKVHRKTLNPVFNETFNFKVNYNEIGGKTLVFAVYDFDRFSRHDII
GEVRVPMNQVDLGSVVEEWRDLISAENDKENEKLGDICFSLRYVPTAGKLTVVILEAKNL
KKMDVGGLSDPYVKITLMQGGKRLKKKKTTIKKNTLNPYFNESFSFEVPFEQIQKVSLNV
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Nucleotide sequence
Length: 2,631
>Moocci.CG.ELv1_2.S204636.g04350.01.t
GTACTTTTAACAGATAAAATTAAATAGGTCTACATTACATTACATACATGGTAGTCTTAA
AACAATAAAAGTCAGAATCACTTCGTTGGTTATTCCAATTAATTAAAGCAGAAGAAAATT
GGATGAAAAAGGCCGTAATCATGGAGTCTTTATTTCGAATGAAACGAGAATCCAATAATG
CTTCGGCTCCTGTTCCAACTGTAGCAGATGTAGCTGCTGCTGCCACTGAAGGGAAAGCTG
GAACACAAGCACCAAACGTCATAGAAGAAAAACTAAAAGAAGAAGCAAATAAAATTTTTA
AATTGTTACCTATGTGGGCATGGGTCTTGATAGCTATTGGTGCTGGTCTGTTACTTCTTT
GCATATTGTACTGCTGCTGCAAAAGATGTTGCTGCAAAAAGAAGAAAAAGAAACAAGAAA
AGAAGGGATTAAAAAACACCATCGATCTTCAAGCAGTAAAAAGTTTGGGAAATAGTTATA
AAGAAAAGGTGCAACCAGATGTTGGCGATCTGAGCAATGGTGAAAAAGAAGAAGAGGAAA
AAAAACTTGGAAAACTTCAGTTTTCACTTGATTATGACTTTCAAGCCAATAATCTAACTG
TGGGAGTAATCCAAGCTGCAGATTTACCAGGAATGGACATGTCAGGAACCTCAGATCCTT
ATGTTAAGGTATATCTCCTTCCAGATAAGAAGAAAAAGCATGAGACAAAAGTTCACAGAA
AAACTCTGAACCCGGTCTTTAATGAAACATTTAATTTTAAGGTCAACTACAATGAAATAG
GTGGGAAAACGCTTGTTTTTGCCGTTTATGATTTTGATCGTTTTTCGCGTCATGACATCA
TCGGTGAAGTGAGAGTGCCGATGAATCAAGTTGACCTTGGTTCCGTAGTGGAAGAATGGA
GGGATCTCATCAGTGCTGAAAACGACAAAGAAAATGAGAAACTCGGAGACATCTGCTTCT
CACTTAGGTACGTCCCAACGGCTGGGAAACTGACAGTTGTTATTCTGGAGGCAAAGAATC
TGAAGAAGATGGACGTGGGAGGACTATCTGATCCTTATGTTAAAATAACTTTAATGCAGG
GAGGAAAAAGACTGAAAAAGAAAAAGACTACAATAAAGAAAAATACACTGAATCCCTATT
TCAACGAATCATTTAGTTTTGAAGTGCCATTTGAACAAATTCAGAAAGTTTCTCTGAATG
TAGTGGTGCTTGATTATGATCGAATGGGAAAGAACGATCCTATTGGTCGATTGGTCCTTG
GATGTAACGCCTCCGGAACCGAGCTTCGACATTGGTCAGATATGTTAGCATCACCAAGAC
GACCAATTGCGCAATGGCATACTCTACAAGCTATTGAAGATCAACAGTAACATAGAAACT
AACTAACAAGCTATGTAATTAACTTTTAGTTTATCTGTTAATTAACAATATGCTAATTAA
ACAACATAATTGGCAATATTAATTAGCGCTCAATTAAAAATATTACTGTATGTATTTGTA
TATAAATCGATTTCAAGTTTTTAGAATATAATTTTAATGTATTCATATCTTTTAGGCATG
TTTTATAACTTTTTCGTAGACGTAACTTATATTTATGTTTTATTATTTTGTTTATTCTTT
ATTTTATTTTGCACTTTCACTAACAACATTGGACCATATAACCATCACATCATTGTAGCA
AATATTAACATTTTATTCTATTTTTAATTACTGTTTTATAATTAATTGAATGGGCCGAAT
GCAATTGTCACTCATTTTACTTACTGTCTCTATCTCTATGGTATCGTTAATGTCATTTTT
TCTTGAGATATTCTCTTTGTATGTTTTATTATGTAAATTTCTTTACTAATGCAGTTCATT
TTGTCATAAAGTTCTGTTTGCAGTTTTTATATATGTAGAGATTGTTTATATATTTTATCT
ATACAATATTTTACTTTGTTCTATTGAAATTACGCGGTGCATGTTAACTGACTGATTGCA
TTTTGCACAAATTATAAAAGGTAACGTTTTAGTTAAGTTTAGATGTTTTAGTTGTTTTTA
ATCCCGAAATTATGTATATAAATTAACTTTTAATATGTTTTTAAACTTTATTTGGGACCC
AAAAGTTTTTTTTTAGCACAATTTGTTTTTTTTTATTGTTTTTCACAAATTCATACTCTA
CAAGAAAATCTTATTTTCCTTTATCAAATATTTTATAGGTAATACTATATAATATTTATC
TCATTTTAATTCCAATAAATTAATTTACGTTGCAAAATCAAATTGTGTCCAAATTTATGC
CATATCAAATGCAGTAGAAATTGAACTAATCAAAAAATGAAATTAAAAATTTGAAATGTT
GCTATATTTAAGTTTTTATTGTTATAATTTTTTTACTCAATATTACCGGTGCTTTACTCG
CCTTAGTTAAGGCGCAATTTTCCATGTTTTACCAAAGATTTGTTTAATTGAGTCTAAATT
TATGTTAAAAATAGCTCAGATTCTTGGCTAGAAAATAATATAATAAATCCATTTATAGCA
AATTTTATGCTCTTTTTAAACGCACATATTCAGACGAAGCTAAACTTTGAATATCAATTT
TTATGTTAAAACTTTAAAAAAACCATTCAAAGACTAAGCATTTAAGCAATA
| PANTHER |
Synaptotagmin1/2 (IPR015428) - T[20-413] 2.6E-182 |
| Gene3D |
C2_domain_sf (IPR035892) - T[129-268] 8.3E-51 - T[269-414] 1.1E-57 |
| PRINTS |
Synaptotagmin (IPR001565) - T[145-160] 3.6E-18 - T[160-173] 3.6E-18 - T[215-230] 3.6E-18 - T[235-245] 3.6E-18 |
| ProSiteProfiles |
C2_dom (IPR000008) - T[155-244] 21.512 - T[287-378] 22.785 |
| SMART |
C2_dom (IPR000008) - T[157-259] 3.0E-25 - T[289-403] 3.4E-25 |
| Pfam |
C2_dom (IPR000008) - T[157-262] 7.5E-31 - T[288-393] 6.6E-25 |
| PRINTS |
C2_dom (IPR000008) - T[173-185] 9.3E-11 - T[200-213] 9.3E-11 - T[224-232] 9.3E-11 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| SYT2_HUMAN | 64.01 % | 461 | 6.97E-162 |
| SYT5_HUMAN | 60.34 % | 416 | 1.99E-144 |
| SYT1_HUMAN | 65.625 % | 468 | 1.68E-164 |