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Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S190583.g03826.01.t
Possible name(s)
TBL1X; TBL1XR1; TBL1Y
Gene model
Location
S190583 [4,652 / 15,515]
Amino acid sequence
Length: 653
>Moocci.CG.ELv1_2.S190583.g03826.01.p
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STTQPSNAGDTTNSVTNTSTVNSMALSTAATTINTNSASSTTVVTAATSSTPVKSEQPQT
NGESAINGPGTPTEVSSTMTSEPMEVDILKSSDNIKISSSKATVLRGHDSEVFICAWNPT
CDLLASGSGDSTARIWNLKEDIVTSSSASANSQQLVLRHCIKEGNQEVPSNKDVTSLDWN
CDGSQLATGSYDGYARIWGTNGKLVNVLGQHKGPIFALKWNKRGNYILSAGVDKTTIIWD
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VYSVAFSPDGKFLASGSFDKCVHIWSTQIQVQHSCKTMIRFSIFFFRSLFEIIRCAICIS
HEQNGTELISITGSLVRSYEGTGGIFEVCWNASGTKVGASASDGTVCVLDLRK
Nucleotide sequence
Length: 3,105
>Moocci.CG.ELv1_2.S190583.g03826.01.t
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TATGTTACCGATCTAAGAATGATTATATCTAGAGAATGCTTAAGAGTAGTTCAATCTGGT
TTTGTTGTTTATAAAGTCTACACACAAAGCAATTTGAGGTCGTACAAAAAGTTGATGACT
CACATGGAATTGTCCATTTTTGAAAATCACTCTACTAGTCCTAATGAATCAGGCTTCCAC
CACAGCGCATTTGTGTTTGGTCTTGAATCTCATATTAGTCAGTCAAACATAAACGGAGGC
CTGGTTCCATCTGCTGCGCTTATTTCAATTATCCAAAAAGGACTCCAGTATGTTGAAGCT
GAAATAAGTATAAATGAAGATGGAATGATTTTTGAGGGAAGATTTAGTGAATCTTTATCA
TTAGTGGATGCTGTCATGCCAGATGTTGTACTTGCAAGACAGCAGCAACTTCGGGAGGCA
GCTCAAAAACAACAGCAAGAACAATTGAAAGAAAAACTAAAAAAAATCAATGAAAGTACA
TCCACAACACAGCCATCAAATGCAGGAGATACAACAAACTCTGTGACTAACACAAGTACA
GTTAACTCGATGGCATTAAGTACAGCTGCAACAACAATTAACACGAATAGTGCATCTTCA
ACTACAGTTGTTACGGCTGCCACTTCATCAACACCTGTTAAAAGCGAACAACCTCAAACC
AACGGCGAAAGTGCAATTAATGGACCAGGAACACCAACAGAAGTTTCTTCAACAATGACC
TCAGAACCTATGGAAGTAGACATTTTAAAGAGCAGTGACAATATTAAAATTTCATCAAGT
AAAGCAACAGTATTAAGAGGACATGACTCTGAAGTTTTTATCTGTGCATGGAATCCTACT
TGTGACCTTTTAGCTTCAGGATCTGGTGATTCTACAGCAAGAATATGGAATTTAAAAGAA
GATATTGTAACATCCAGTTCTGCATCAGCAAACAGCCAACAGTTAGTTTTACGACATTGT
ATTAAAGAAGGCAACCAAGAAGTCCCTAGTAATAAAGATGTTACATCACTTGATTGGAAT
TGTGATGGAAGCCAACTTGCAACAGGATCATATGATGGTTACGCCAGAATATGGGGAACA
AATGGAAAATTGGTTAATGTACTTGGGCAACACAAAGGTCCGATATTTGCATTAAAGTGG
AACAAAAGGGGGAATTACATTCTTAGTGCTGGTGTCGACAAAACCACAATTATTTGGGAT
GCTATGACTGGTGAAGCCAAACAACAATTTCCTTTCCATAATGAAGAGTTTTTATTTATA
AAAAAGACTAAAAATAATGAAGTTAATGCAATTAAATGGGATCCTTCAGGAACTTTATTG
GCTTCATGCTCAGATGATATGACTTTAAAGGTCTGGTCACTAAAACAAGACACGTTTGTT
CACGATTTGCGCGCGCATAACAAAGAAATTTATACAATTAAATGGAGTCCTTCTGGGCCA
GGATCGGCTAACCCTAACCAAAATTTGATGTTGGCAAGTGCATCGTTTGATTCCACAGTA
AGACTGTGGGAATTAGAACGTGGTGATTGTCTACACACGCTTACCAGGCACCAAGAACCA
GTGTATTCGGTAGCTTTCAGCCCTGACGGCAAATTTCTGGCCAGTGGATCTTTTGATAAA
TGCGTTCATATTTGGAGCACACAGATACAGGTTCAGCACTCGTGCAAAACAATGATCCGA
TTTAGTATATTTTTCTTTAGATCTTTATTTGAAATTATAAGATGTGCAATTTGCATTTCA
CATGAACAGAATGGAACAGAACTCATTTCTATAACTGGATCACTTGTTCGTAGTTATGAA
GGTACAGGAGGAATATTCGAAGTATGTTGGAACGCATCAGGAACAAAAGTTGGTGCTAGC
GCCTCAGATGGAACAGTTTGTGTACTTGATTTGAGAAAATAATAATGAAGTAAAATTGTG
CGGAGAAATTCTAATGTGATGTTTCATCTTGAGCAGAACGTGACAAAATGCCATTACCAC
AAGAGGGCATCATATTGACTGACTATGACCAGTTTAAACTGGCTAAAGTGAGAATTCTGG
GTACACCATGCACCGTTTATACTGTAATACCAAACCTCATCAAACATTTAGAGTTGAGTT
TTACTTTATTATTGTTTTGGCAAAAACAAAGTTGGCATTGTGATTAGAAATAAAGATTTA
TCGGAATATTAGCTATTCCTTTAAACAAAATACTCCAATCACTTGCAGTGGTTGCTGTGA
TATTTTTTTCATTCCGTTCATAAATTTTATACTTAAAACAATTTTTTAATAAAAATGCTA
GTTTCCACTTAAGAAGTAGTGTGATTATTTTAACTCTTGTTAGAACATATAGTTGACAAA
AATGAGTACTAATTAAATCAAGGTGTTTTGGTATTTTTGACACCAACAATAAATAAGTTT
TAACAAGTACAATTTATCGTTTGGTGTTTTTTTTATATTTACCATTACCAACGACCAGTG
TTCCTAATGAATGTTATTTATTTTACATTCTTAAACAAGTTTTTTCATAGGAAATTATCA
TCATCGAAGTAGATTTTTAATATGAAATAAAGACACTTTTACAACATAACATATTGTTAG
TAAAATTCTAAATATCAATTTAATGTAGGATTTGATTTAAACGATTACAATTTTAAAAAA
ATTCTAAAAAAATGTTTTCTTATGACTAATTTTTAGAATCACATTTACTTTTTAATTATC
ATTTCAAGTGACAATGTTTTTGTCTTATCAACTTTGATCTTTTCAAGCAAGTTTCTTGAG
CGCTGTTTATTATATAATTATTATTATTTTGTTCCACGGCGTTCAAATATATTGCAATAT
GTTTTTATTATATACTTTTTTGCCAAATTATGGGTAATGATAGATACATAATTTCACAGT
CCAGGTTGTAAAATAGAATTACACAAAGGAACTTAAACTGTTAGCTTAAGATAGTTATAA
AGGTCTAACATTTATTGGATATTGACGTTACTATTAAATATTCCTATGCTTTATGTAAAA
GATATAATTTGCCAACAAAAATATTTAATTTTTTTTGTAGTATTG
| Gene3D |
WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf (IPR015943) - T[272-581] 2.3E-117 - T[597-653] 9.0E-9 |
| SMART |
WD40_repeat (IPR001680) - T[278-317] 3.2E-8 - T[334-379] 3.4E-4 - T[381-420] 8.0E-8 - T[434-473] 4.4E-6 - T[476-524] 6.3E-8 - T[527-566] 1.2E-12 - T[612-650] 0.09 |
| Pfam |
WD40_repeat (IPR001680) - T[283-317] 3.3E-5 - T[351-378] 2.4E-4 - T[382-420] 8.4E-4 - T[528-566] 2.7E-10 |
| SUPERFAMILY |
WD40_repeat_dom_sf (IPR036322) - T[284-568] 1.33E-64 |
| ProSiteProfiles |
WD40_repeat (IPR001680) - T[285-326] 14.519 - T[354-378] 9.94 - T[388-429] 13.015 - T[441-482] 12.38 - T[483-533] 12.113 - T[534-566] 14.819 |
| ProSiteProfiles |
WD40_repeat_dom (IPR017986) - T[285-575] 44.584 |
| ProSitePatterns |
WD40_repeat_CS (IPR019775) - T[304-318] . - T[407-421] . - T[511-525] . |
| PRINTS |
G-protein_beta_WD-40_rep (IPR020472) - T[304-318] 1.1E-6 - T[460-474] 1.1E-6 - T[511-525] 1.1E-6 |
| Pfam |
Apc4_WD40_dom (IPR024977) - T[441-496] 4.9E-6 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| TBL1R_HUMAN | 60.722 % | 538 | 0 |
| TBL1X_HUMAN | 56.579 % | 644 | 0 |
| TBL1Y_HUMAN | 55.776 % | 622 | 0 |