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Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S146454.g02553.01.t
Possible name(s)
IL18R1; MYD88; TLR4
Gene model
Location
S146454 [6,843 / 10,583]
Amino acid sequence
Length: 441
>Moocci.CG.ELv1_2.S146454.g02553.01.p
MRNIFRSISRSRKPCESTDSGVVAECDSTTSDITESLGNTSSTTMTSALNSNNSLDCMTA
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IMLNPLQVQAPADNMTDVPLRELLTDTLTELSSRFDMDGIGIKDWKYLAAEIGMANHEVM
KIKQTQTYYTTAVLHRWNTMIPLPTIADLIVLLEKLERNDIITDMMCYFERDARRFRSEN
SKSFIHSSPSLTSQISNMSNLSNSSFEEIGTYSEKFSENPEQDDMASMIPAVGSQDSCDP
PPKKQLILENYDALILFDNNDGEFVRKLINNLEKQGFKLCIPARDIPAGTTQYETNLQFM
FERSRKIVIVMSNELFESRAYMWHMNQLIGRDPIARDRKIIPVKYKAVTVSNILDHLCAC
DLMRTLEESWFWDKLYSSIKL
Nucleotide sequence
Length: 2,452
>Moocci.CG.ELv1_2.S146454.g02553.01.t
TTTTTTGTTGGCAGGATAAAACTGTAATTAATCTTCATTAACTATCTGAAAAAATCTGTA
ACTATACTAAAAAAGGTACTAGCCTATATACAAAGACAAAGACTGCTTGAATAACATATA
GCTGACAGAGGGATATTAAAAATGCGTAACATTTTTCGTTCAATTAGTCGGTCAAGAAAA
CCTTGTGAATCTACTGACAGTGGTGTAGTGGCCGAATGTGACAGTACCACTTCGGATATA
ACTGAAAGTCTGGGAAACACTTCATCAACAACTATGACTTCAGCATTAAATTCTAATAAT
TCTTTAGATTGCATGACAGCAAATAAAGATATGCTTCCTGAATATTCACCAAATAAAAGT
TTGTCAATGACTAGTTTGGATTTTAATACAGATAGTTTGGAAAAGGGTTTGCCTCCAAAT
TATTCTACGCTAGTCTCATCCACTACGGATAGTGCAAATTTAGGACCCCCTCGTAATCAA
GTTGCTCACTATGCTCCAGCAATAATGCTTAATCCATTGCAAGTACAAGCTCCAGCTGAT
AACATGACAGATGTACCATTACGGGAACTTCTTACAGATACCTTAACTGAGTTGTCTTCT
CGATTTGACATGGATGGGATTGGAATAAAGGATTGGAAATATCTAGCTGCCGAAATTGGA
ATGGCCAACCATGAAGTTATGAAAATAAAACAAACACAGACATATTATACAACAGCTGTT
TTACACCGATGGAATACAATGATACCTTTACCCACAATTGCAGATTTAATTGTTCTCTTA
GAAAAACTAGAAAGAAATGACATTATCACAGACATGATGTGTTACTTTGAAAGAGATGCG
AGAAGATTTCGATCCGAGAATTCAAAGTCATTCATCCACAGTTCTCCGAGTCTAACAAGC
CAAATATCAAATATGTCTAATTTAAGTAACTCAAGTTTTGAGGAAATCGGAACATACAGT
GAAAAGTTCTCAGAAAATCCTGAACAAGATGATATGGCATCAATGATCCCCGCAGTGGGT
TCACAAGATTCCTGTGACCCACCTCCAAAAAAACAACTAATTCTCGAAAACTATGATGCT
TTGATACTATTTGATAATAATGATGGAGAATTTGTGCGGAAATTGATCAATAACTTGGAA
AAACAAGGATTTAAACTTTGCATCCCAGCAAGAGACATTCCAGCTGGAACTACACAATAT
GAGACTAATTTACAGTTTATGTTTGAAAGGTCTCGCAAAATAGTAATTGTAATGTCAAAT
GAATTGTTTGAGAGTCGGGCTTACATGTGGCATATGAACCAGCTTATTGGAAGAGATCCA
ATTGCACGAGATAGAAAAATAATCCCAGTGAAATACAAGGCAGTGACCGTATCCAATATA
TTAGACCACTTGTGTGCATGTGATTTAATGCGTACTTTGGAGGAAAGTTGGTTTTGGGAT
AAGCTGTACAGCAGCATCAAACTGTAATCAATCTGGAAATGGAAACAATGAATATTTAAT
ATATATTGATTTTAAAGTGTAGCATTAATTTAATGTTATGGATGATTCCAAATAGGATAA
CCAATGTAAAAAACTTTTAAAACGTTAATAAGTTTTTTTTCTTTGGGCCATCTTTACTTT
TAATTAAATTTATTAGTGTCATGTTTATTTTATTTTACATTCATTTTAAATTCAATCAAG
TAAATTTGACACTAATATGCTGTAGTTTGTGTATAGCATTCTTATTATGTGAAATTAGTT
GTAATCAAGAGTACGAAAAAGTCAAATCCGATAATCTAATTACCATAAGCTCAGATTTTT
TAAATCCACAAAATGCAAGGTTACTCAAAAACAGTGTAGAAATAAAATGCCATACAATTA
AGCTGCGATCGATGTGATACAGTCTAAATACTTACAAATAAACAAAGAATTGGCATATTT
ACTTTTTAAATAGAGTAGCAACTTGTACATCATCACATTGAAGATTTTAAATGCGGTAAG
GTTTTGAACAGTTTACCCTAAAGTTACTGACTTTGTCAAACTCTGGTTTTATTATATATG
TATTTTTTGCATATTAACAACAAAGATTGTATATAAGTGAATTTATTTTTTTAAAAGGTT
TTATTATATTATGCTTGGTCTTTCTTGTAAGGCTATTTTCTACCTTTAAATTTATTTATA
AAAACCATTTAAAATTACTTCAAGTAACTCTTCTTTGCTAAATGTGCAAACCAAAAATCA
AACAAGTAAAATTTTTATACTTTTTACATTGAACTTTATTTATTTACTTTATTAACATAA
TACTTTTTTTTCATTGAACTAGTTGCCATTTTAATTTGTTTGATATTACAGTACAGTTTT
TATTGTTATGTACATTACAAAATGGATGTTTTATTGATCTTTTAATATTGCCCTGCCATG
CAAACGATTATTTTCCTTATTGCACTATAATACAAAAATATTTTATTGCAAA
| SUPERFAMILY |
DEATH-like_dom_sf (IPR011029) - T[132-239] 3.24E-10 |
| ProSiteProfiles |
Death_domain (IPR000488) - T[164-229] 12.157 |
| ProSiteProfiles |
TIR_dom (IPR000157) - T[309-408] 15.595 |
| SUPERFAMILY |
Toll_tir_struct_dom_sf (IPR035897) - T[310-439] 3.14E-20 |
| Gene3D |
Toll_tir_struct_dom_sf (IPR035897) - T[310-440] 1.5E-22 |
| Pfam |
TIR_dom (IPR000157) - T[323-409] 1.2E-8 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|