- Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S11...'
Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S113400.g01766.01.t
Possible name(s)
CALU; RCN1; RCN3
Gene model
Location
S113400 [1,605 / 9,047]
Amino acid sequence
Length: 248
>Moocci.CG.ELv1_2.S113400.g01766.01.p
MFHKIDKDGDGYVSESELKDWITFQQQQYINKEVESQFPQHDITKDGIITWEEYKKVTYG
HLDDDDIAAGDQEGFRYSDMMKRDLDRWEAAAAHEPDPGSNVKSCDKKEFTKFLHPEEFR
DMHNVVLMETMHDIDENKDGYISMDEYIKDMYKPEQDGETEPDWVETERQQFIQYRDKDK
DGKLSLEEMKDWILPDDYDHAEAEAKHLIYEADEDKDGEISKDEMLEKEDLFMGSQATNF
GYALHGEL
Nucleotide sequence
Length: 2,844
>Moocci.CG.ELv1_2.S113400.g01766.01.t
CTAGAAAAATGTTCCACAAGATAGATAAAGATGGGGATGGTTATGTATCTGAATCTGAAT
TAAAGGATTGGATCACGTTTCAGCAGCAACAATACATCAATAAAGAGGTTGAAAGTCAGT
TTCCACAACATGATATAACAAAAGATGGTATAATAACATGGGAGGAATACAAAAAGGTTA
CCTATGGTCATTTAGACGATGATGACATTGCAGCTGGTGACCAAGAAGGATTCAGATATA
GTGATATGATGAAAAGAGACTTAGACCGTTGGGAGGCTGCTGCAGCACATGAACCTGATC
CAGGCTCTAATGTAAAATCTTGTGACAAAAAAGAATTTACAAAGTTTCTTCATCCAGAAG
AGTTTAGAGATATGCATAACGTTGTTCTTATGGAAACAATGCACGATATTGATGAGAATA
AAGATGGTTACATTAGCATGGACGAGTACATAAAGGACATGTATAAACCAGAACAAGATG
GAGAGACAGAGCCCGATTGGGTGGAAACTGAACGTCAGCAGTTCATCCAATACAGGGATA
AAGATAAGGATGGAAAACTGAGTCTAGAAGAGATGAAAGATTGGATTCTTCCGGATGATT
ATGATCATGCTGAAGCTGAGGCCAAACATCTTATTTACGAAGCCGATGAAGATAAGGACG
GGGAGATATCGAAAGATGAAATGCTAGAAAAAGAGGATCTATTTATGGGGTCACAGGCTA
CTAATTTTGGATACGCTTTACATGGGGAATTATAATTAAAACTGATGATAAGCTGTCCAA
GGAAGAAATATTGGAAAAAATGGATATTTTCATGGGTTCACAAGCTACAGACTACGGAAA
TGCCTTACACGAAGAACTATAATTTTAATATCATATTTATAATTATGCTGTATAAGTGTT
CGAAAATGGTTATATTTGCAGAGTCTAAAACAAATTTTTAAATATTGATGTTTTTTAAAT
TGGTTAAAATTAAGTAATCTGCAGAATGCATGTTAAAAATGTTATAGGGAAATAAAAAAT
ACAAAATCTGTATTATTGTTGCTTATTATACTTTTCATTTTGATCACAACTTGCTAATGT
GGAAGTGTGCCACCCTAAAGTTTGGGGTCCAACAAAAAATCAATTTTAGTCAAGGGCCTA
TTCCATCCAAATAAGTTTTGTCATGGCCATAGTTTAATAAACTCTTTCAAAGGCTATATA
AAAAAAGCCTTAAAAGCTTGCATTTGTAGCGGGCCGACCACATGTTACACACTCCTGCCT
TAATGCATAAGGACTTTAAACTAGACGCTGCACTTCAATGTTGCAGTAAGGCAGCACCCA
ACTTTGTATAGGCAGATCGGTATTAGGCTATTTTTCAATCTGAAAAGATTTTTGATGACT
CTGAATGATTGCTGCGCAGCCAAAACTCAAGTGCTGGTTATGGTTACATTTGCACCAATT
ATCTATATGATTCAAGATTTGTATCAAAATGATCTGTACAACAAACTGCCTTAATACAGA
CCAGTTTCATTTTCTGAAACTTTGTTTGCAATTTATTATACAATTTTAATTATTTTGTTT
TGACTCTGCAAAGTTAGAAAAGGTGGTAGTAGTTAGTATCTTCAATAATGTAGCAAATTC
ATATTTATCGTACACTTGCAATTAGTTTTTCACATTAACCTTTGAAAAATGAAGCAAACC
TTTTTTATACCCTATTACATTTCTTGTACTATATAAGGAAATTTATTTTAACTTTAGAAT
ATTTAGCAATTTAATGATTTGTTTTATAATGAAATGAATTTTTGTTCATCTGGTTTGTTA
AACTGCCAAAAGTGCCATAACTCGTCGATTTTATTTGTTATAAACTTGTAGTAGTTTATT
TTTTGAATTTATTTTTTCCAGAAAATTTAAGGTTTATATTTGTGTTCAAATTGTTCTCTG
CAGTATAGTAAAATAATATTCAACTATAGCAATGGCAAAAGCCTACCTTGCATTGATTTT
AGAAAGCTACACATGCCAATAATATTATATAGATTACTTTTTCATACTTTTAATAAAAAC
ATTTTCTTGAATGAAATGTTTTTTTATAAAGTGTCATAAACTTCTTTGCAATATTAAATT
TGTTACGTAGGAATAGTACACAAACTACTTAAGAAATACTTTGTAGCTTACTAAAGTATA
TAAGAACTATTTATTACATACATTTTGTATAATTATTTAATCATCACTCTGTATTGTTAC
CTGTCACTACTAACCCTTTATCAAATAACTTTATGTATTATCATGTCATGACATCAAACG
AGCCTTGATTTAGAATGCAAAACTTTATCTGTTTTATTCAGTATAGCTTTTACAGCTTAT
TTTTACATTCAAAAGTTAAAATTTTGTAATATTAGGAAAACAAACTAAGCTGATTTTATG
CTTTTTATATATTGCTCTCAATATTACTAAAAATGTAGTTAAACTTTATATACATCAATA
TCCTTTAAAACAAAGTAAAAAAAATTTTGTAGCCACTGTTAATTACTTATTGTCATTAAC
TTATCTCATTATCAAATATTATTTAAAAAAAACTTAATTATTGAAGCAACTTATCAAAGT
GATAGTCCAGGTTAGTCTATATCTGGATCATGTTATTCTTATCTGAAAAATACACTTTTT
TTTATCTTATATAAGGGTATGTTTCTATATTTACAGACTAGTATGGAAAAGTAGTTATGA
TTTAATATGTAATTCATTACACTGTTTGTATATTTCTTTAGGCCTATAAAAATAACTTTG
TTGTAATTCACATTTCATTAATATTAAATTTTATTTTGTATTGTACTTGTCTGCCTATCC
AATAATAAAATATTACATTTTTCA
| SUPERFAMILY |
EF-hand-dom_pair (IPR011992) - T[1-62] 1.6E-14 - T[106-246] 1.59E-24 |
| SMART |
EF_hand_dom (IPR002048) - T[1-25] 3.7 - T[126-154] 0.26 - T[168-196] 14.0 - T[204-232] 10.0 |
| ProSiteProfiles |
EF_hand_dom (IPR002048) - T[1-28] 12.951 - T[29-64] 8.07 - T[122-157] 8.934 - T[164-199] 9.548 - T[200-235] 8.516 |
| Pfam |
EF_hand_dom (IPR002048) - T[2-19] 1.1E-4 - T[128-147] 0.0022 - T[177-190] 0.011 - T[202-224] 0.0058 |
| ProSitePatterns |
EF_Hand_1_Ca_BS (IPR018247) - T[6-18] . - T[135-147] . - T[177-189] . - T[213-225] . |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| CALU_HUMAN | 52.653 % | 249 | 1.03E-82 |
| RCN3_HUMAN | 43.59 % | 194 | 4.27E-61 |
| RCN1_HUMAN | 46.862 % | 208 | 1.89E-66 |
