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  1. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S5...'
  2. Transcript 'Moocul.CG.ELv1_2.S80...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocul.CG.ELv1_2.S80221.g05901.01.t

Possible name(s)

NSMCE1

Location

S80221 [7,077 / 11,777]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 256

>Moocul.CG.ELv1_2.S80221.g05901.01.p
MPRYERHHILFLQSLMRSHAMTKMEASELCERCCHACDAEFDGEILPFINTINEKIQPFH
IQIKRGLRESTGETVIAIINMNDSEVNQVTIGADYSKVDVEVFQHIIRLILISENGMASS
TDILNLINNEITNKNISKGDIEELVRRLIADKWLGEEEGWIYFEPRAYLELEPYFESEFD
ECLQKCTLCNCFVYRGNACNNCNLKIHKYCFDRYASNNSTGTICPECSEPFMYSNENDPP
VSQVVQSSRKRKRLHQ

Nucleotide sequence

Length: 2,833

>Moocul.CG.ELv1_2.S80221.g05901.01.t
CATTTGCCTTTTTATTCAAATAAACTAAAGTCGTTGTTTAGTCTGTTAAGCTAACCCATT
GGAATATTTTTCTCCCAACGCTGTAAGCTGAAAGCGATGACCTTTCTACCAAGAAAAACA
TCAAAATAGAAGTTTATTGTAGGTTAGGTTTTATTTAACACAGCATACATTAATTAATGA
GTATAGGGCTAGCATAGGCTACACAAAATATAGCGTGTGACCATAGTTTACGTTTGCATC
ATTGTAGATGCTTCAAACGTTTCAAAATAGAGTTTCTGTACCTCCATAATATAGTACATA
ATTTACAGTATTTGTGTAATACAACCAAACAGAACGTGTTATTCTTTAGGAAATGTTGAA
AACTGTTATATTGGCCGTGGAGTGAAGTCGCAACGAAAAGCAGAATAGAGCTATGATAGC
GGTTTGCTACGGTCGCTCACAAAGGCCGCGTGAGTCCTATACATTTACAAGAGACCCCAA
GGGACAGGCTGCAACACTTTATGGGCAGGGTGGTTGAAATCTGAAAGGCTGTTAAGAAGT
AATCGTCAAACTTTGTGGCTAACGCCTATATACTGTAACTTTTGTAGTTTTGCCTAGTCA
GCTAGGCCTAGTGGTCTTTAGCTAGCAGTTTAGCCTATATCTGTATATCATATTCTGTCA
GTCTTCAGGTCTTAAATTTTAATAATGCCTCGGTATGAACGCCACCATATACTTTTCCTC
CAAAGTTTAATGCGGAGTCATGCGATGACCAAAATGGAAGCATCAGAGTTGTGTGAAAGA
TGTTGTCATGCTTGCGATGCTGAATTTGATGGGGAAATCTTGCCATTTATTAACACAATC
AACGAGAAAATTCAGCCTTTTCATATCCAAATAAAGCGTGGTTTGAGAGAATCTACAGGA
GAAACTGTAATTGCAATCATAAACATGAATGACAGTGAAGTGAACCAAGTTACGATTGGA
GCAGATTATTCGAAAGTGGATGTTGAAGTTTTTCAACACATCATTCGGTTGATTTTGATA
TCGGAAAATGGAATGGCTTCCTCAACAGATATATTGAATTTAATAAACAACGAAATTACA
AATAAAAATATATCTAAAGGAGATATTGAGGAACTTGTTCGTAGATTAATAGCAGACAAG
TGGTTGGGTGAAGAAGAGGGTTGGATCTATTTTGAACCACGTGCATATTTGGAATTGGAA
CCATACTTCGAATCGGAATTTGATGAATGCTTACAAAAATGCACTTTATGTAACTGTTTT
GTATACAGGGGAAATGCATGTAATAATTGTAATTTAAAAATTCACAAATATTGTTTTGAT
CGTTACGCAAGCAATAACTCAACAGGTACTATTTGTCCCGAATGTTCGGAACCTTTTATG
TATTCAAACGAAAATGATCCACCTGTAAGCCAAGTTGTACAAAGTTCACGAAAAAGAAAG
CGATTGCATCAATAACCACAACATTTTATTGTTCTTGTTTCTTTACATTCTTTTCTTGAT
ATAAATGTTTTTGTAAAATATGGTTTGTTTCTATTTCTGGTAGAAAAGTTGTAAGGTCTG
CTTCGGTATTACGCCTTAACGATAGAACAACATCTTCAGGATTAACTTTATATAACTTTT
TAAGAGCGAGTAGCGCAAGATCTTTTTCCACCGTAGGTAAAGTTTCTCCACCAGATTCCA
CATACATTACTTTATCTATGTACAGTCCAACAAAATAAAGTGGCAGAAGTGTGTTAATAC
CAGATTGTTTTGTTAAGCGAACTTCAAGTATTCCTAATTCTTTGTTCTTACATTCTTCAA
TAAAGAATTTCATGGGATTGGCTGGTTTCCAAATATTTTCAACAGTGTCTTTGTCAACGA
GATCAGTAATGACAAAATCTAGTACAAATTTTGCAGCTTCTTCAATGCCATTGTTTGAAC
AGTAAATTGCTCCTACTGTTGAGTAGAAACACCGGCTCAAAGTTGTAGTAGAGAATGGGT
AGTCCTTGCATTGAATAAAATCAACAATTCCTAAATTTGTTGCCAAATATGCAGTCAATT
TTTCAGAAGTTAAATGAGTTTCAATGGCTTCACTGCATTCAGGTGAAACATTAGGAAAGT
ATTTTATTAAATATGAATGGACAAAAGAAGATACTACTTCTTTGCCGAGCAGAACTAATC
TGTTGTTGTTTGGAAATTCATCTTCTACATGCTCTTCTGACACAGGTAAAGGTTCAGTAA
ATGCAGAACAGAGTATGTCTTCATGGGCATTTAACTTTAGTCGTTTACAAAAAGCTATCA
GCTCTGCTTCCATGTTCCAGTTTAGTTCATTGCACCTTGGGACTTGTTTTGGAACACCTT
GCAAGTCAGATTTTCTCTGCATCGCAAGTAACCAATGTCGTTGCCATCGTTTAACAACAA
CTTTATCCACAAATGGTTGGAAATTTGGATTGCCAACAATAGGTATCCGTGGCATATATG
AATTAGTGCTTTGATGTTTACCATTAATGCACATGAACTTCGGATTAATAGAAAGTATAC
CATTGCTTGTACGAATGAAACCAACCAATTTAATTGCTATTTGCATTCGATTCATGTTTA
CTTGTCTTTTGCAGGTGGAGTAAATCCTTCGCAGCACTTTTGGGGAATATGACTAAATTC
CCTGCAGCACTTCTTTAGTTCATCAATGACAGTTTGGCACTTATCAAAATTATAGTTATG
CCTTTGTAAGCAATTTTGAATAGAACAAGCAAACTTCTGACAACGTTCAGGCATGATTCG
GTGGTTCCGAAGTGTACATGTCGCTTTTCCAAACTGTATGTAAGCTATGACAGCTACGTA
GATTGACTAAAAT

InterProScan

PANTHER
Nse1 (IPR011513) - T[2-243] 2.1E-60
Pfam
Nse1 (IPR011513) - T[10-171] 6.7E-11
Gene3D
WH-like_DNA-bd_sf (IPR036388) - T[85-182] 1.5E-20
ProSiteProfiles
PE/DAG-bd (IPR002219) - T[171-224] 8.136
Gene3D
Znf_RING/FYVE/PHD (IPR013083) - T[184-239] 2.5E-9
Pfam
Znf_RING-like (IPR014857) - T[186-227] 1.6E-6

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
NSE1_HUMAN 29.183 % 132 1.65E-37