Login
Help

TRANSCRIPT CARD

Submit your Data

  1. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S42...' > 
  2. Transcript 'Haaura.CG.MTP2014.S9...' > 
  3. Transcript 'Moocul.CG.ELv1_2.S67...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocul.CG.ELv1_2.S67266.g04431.01.t

Possible name(s)

RAB11A; RAB11B; RAB25

Gene model

Moocul.CG.ELv1_2.S67266.g04431

Location

S67266 [7,154 / 12,787]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 189

>Moocul.CG.ELv1_2.S67266.g04431.01.p
MGTKDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTI
KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVDRWLKELRDHADNNIVIM
LVGNKSDLRHLRAVPTDEAKAFSEIYRIVSQKQIRDAKNAASEKPHNDVIDVIAPTNPES
DKEGRKGCC

Nucleotide sequence

Length: 2,231

>Moocul.CG.ELv1_2.S67266.g04431.01.t
ATATAGCTAACCATTAATTTTTTATCTTGCAATAAGTTACAGAATACTTTTCAACAATCG
TTTTACTGCCAACGATCTCAATTTCATAAGCTTCCTGTTCTGCACAATCAATAGCAACAA
ATTTTAATATAATAAATATAATATGGGAACCAAGGACGATGAATACGATTATCTTTTCAA
AGTTGTTTTAATTGGTGATTCCGGTGTCGGGAAAAGTAATCTGCTGTCACGATTTACAAG
AAATGAATTTAATTTGGAAAGTAAAAGTACAATCGGTGTCGAATTCGCTACAAGAAGTAT
ACAAGTTGATGGAAAAACCATAAAAGCACAAATCTGGGACACGGCAGGGCAAGAAAGATA
CAGAGCCATCACATCCGCGTATTATAGAGGAGCTGTCGGAGCTCTTCTTGTTTACGACAT
CGCAAAGCATTTGACTTATGAAAATGTTGATCGCTGGTTAAAAGAACTTCGAGATCACGC
CGATAATAATATCGTTATTATGCTGGTCGGAAATAAAAGTGATTTGCGACATTTGAGGGC
GGTTCCCACTGATGAAGCTAAAGCATTTTCAGAAATATACCGAATAGTTTCACAAAAGCA
AATTCGCGATGCAAAAAATGCTGCAAGCGAGAAACCACATAATGATGTTATTGATGTCAT
TGCACCAACCAATCCTGAATCTGATAAGGAAGGAAGAAAAGGATGTTGCTAAAACATGAC
CTTGGATCATGAAAGCTTGATTAGGGAAATGTTATATCTCGCATGTACAAATGTATTTTC
AAACATAAATTAAAACCATTCCATGCATCTATCAACGATTCGTTATATGTATGCCGCTTT
CCTGATTAATTTTGTAATTTTTGCAACTGTATTCTACCAATTTTAACCAGAAAATATCGC
ATTTGATTCGTAAATTTTATGTTAAAACCTGCAGAAAATATGAATTAGTATTTGATTGCC
GTAATGAGTTTGTCAAATCACCCTTAGAATCAGGATGTTGTGTGACTACATCTTATGAAT
CATTTGAAATATTTACTAAGCTACAACTTCTGTGTTTGCCTTTTCTAATTGACTTTGTTC
ATTTGTTTCATCTTTATCAATTCATTTACATGTTCTATTGCAGTGAAGTGTGGAGGCCGT
TTTATTAATTCAATTTTAGCATGGTTTATTTGCATGTGGCATGCGTCTACCTTATATCGA
TTCGTAATAAATGATGTTCTAACTACATGCATGAATGAAGAGATTCTTTTAATGGTGATT
AGCAACATCTAACTTTGTTTGTGGCAAGAATTAAATGAACTAACAAATGGCTTACTGAAC
AGAATGCAGTCAACATCAAGTCTTCCTCGTTTTAAGATTGCAAATACTTCATTCATGTTT
TAAAGGGTATTCATTTACTCCGTCAAGAATTAGATTACAGGACTACCAGTATGAACGTTC
ATGATGGATGGTGCTATGTTTATCATGATTTTGTTGATTAACTGGTGTAGGGGTTGCATG
CTCTGTATTAACACATTTATTTTCACGTAGAAATCTATCGAATTGTGTCACAAAAGCAAA
TTCATGACTCGCAATCAGAAGATGCGCCAAGCAAAGATGGCGGAGTTGGAATCGTGATTC
CATCTACTGATAACAACCAGTCAACAAAACAACCATGCTGCAAATCGCTTTAATTATTCC
CACCAGCAACACAACTTGGTGCCGCTGTTTCTTATAACGATATTAATAATAACGAGGCCT
CCACCTTCATCACATATGTATCAATTGCTTATTATTGTTATACATTCAATCCCTCTTAAT
CTTGTGACTGACTGACCGCTAATAACTAAATTATTGCAGGCATAAATTAGCAATTTTTAC
CTATTGGTTTCATTAATTCATGTACTTTTACTTCGATAAGTTTTATTCATGTGATTTGAT
CATTTCTTTCACTTTTTTCTTTGTTAATAATTGATTTTGATTACCGTGGCGTATATGTAG
TTCTGAGGAAGTATGAAGTTATACATAAATGACTGATAATACAGTAATATAAAAATCTGT
CATCACAAGTAATTTATACACTGCAGACGACGCAGTAAAATTATGTGTTCACGATTTTCC
CGAAAAACTGTTGGAATTTTTTTAACTGTGCTAATAGAATATTATCAGTTAAATGTTTCT
ATATTGTGTATATATGATATGGCATTGTTATTAATTATAAATTAAAGGCAAATATATTAT
AACTACACAGA

InterProScan

SUPERFAMILY
P-loop_NTPase (IPR027417) - T[7-148] 1.82E-50
TIGRFAM
Small_GTP-bd_dom (IPR005225) - T[10-160] 4.1E-41
Pfam
Small_GTPase (IPR001806) - T[13-146] 2.2E-52

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
RB11A_HUMAN 72.222 % 307 5.84E-108
RB11B_HUMAN 74.074 % 317 1.2E-111
RAB25_HUMAN 69.231 % 214 5.16E-71