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  1. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S45...'
  2. Region 'REG00000053'
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  4. Region 'REG00001197'
  5. Transcript 'Moocul.CG.ELv1_2.S62...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocul.CG.ELv1_2.S62138.g03944.01.t

Possible name(s)

PRPF4; TBL1Y; WDR11

Location

S62138 [1,000 / 4,564]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 1,187

>Moocul.CG.ELv1_2.S62138.g03944.01.p
MTDKKTPCLIPERVIPGILSKHNQLAIDWGYQGLIAYGCHNNVIILDYNTLQIIQTLILH
KSPIALVKWARENYHHDVAKPYSPRLASVDEHGKIVVWDVAQGLQQAVFLEPNKSVEDLA
WLKNQDASVDLLVAIHCPNIVVLWNADTGTKLWRKCYDSVSHLRSLTFDFFDIKNVAFLG
SDCVLFANDFAVNCEPTSNGKKFYMTLDKNSSNSNKNSLTSSLEAVGKVALSGIKLLMGD
ERPKHNEVALLECLQLLYLPASRHHLAAVFPREILILDVSIFQAIASIPIERSTSSFLRV
LPTQQRNAFYCVHENGSVSFRVQKCVTVGKSQLEFGKTNDRLYDMSYELACHSESFRVTN
KVKPFCGTICPISETKVAVMISDGRIFIWNLTSSNNRANDLKSNHGNNLLSVFAPKETNR
NFLGTLRAMISPLFDTEENRKNHKKIHLQFALTGCSCEIVSQQITCIRMCPPLTHKNWPH
YHPLTAVGLYNGNIQVFNIRDGHLLRELSVHTCQVRGIEWSSLRSFVSFGYAEPSSNHQN
SVFNELKVTDLDTGKTVALREGKSSEPIIQFIRISYQRQYLVVVFQSKPFELWDIRSRQL
LRELSSTFPNISALEWAPGHTTKKSKSDFIGEDCANVLTREHLVLTDSSSKCYHCIVESS
SFRLGSCIPNKSNRDAVVSGITWKGDHLFMGNSEGTMTAWDLQDKIARSVSTYQGCIKKV
KFGPGKGNFKVLVLYDEGVDIWDAQTLQCISSLHMPKTLNKIIDVDWCASENPVIAFQNS
TLVVTGLDLKIPMKSNSLSNFHSRLTISCPYFLSPKMALIFKAVLLHGNVQVLKDSADLP
PNTLDMLNAKISSLTSVQNDCLSDSSMLVRGNNVARIFGDESEINFYSVLGNCVDKNYKP
LGVEMDTLAQNSLFKLSEVFRNKRQILLRQTEHHRSNCVRNLILLGQIDHAIQLSLETES
HTEKYYTDSLKVCLLTSLNKNPEASQSTVKLVSTNLIASGKLLEGVELLCMIDKPYGACR
YLSSSGLWDLAVWLAKVRLSNEQYENIVMSWATHLSSPKVNQKSKALLVYLSLNKYEKIL
ETLFQIRHFDRAAIFCDICIEEHLIQPSEKFTKLCEQIYTEYARFLYMIGGPKYIMEHYC
NKGGEEGKGFLMEIETNEATSDDTANSKDWSIIPSSNSSISDDFEKK

Nucleotide sequence

Length: 3,564

>Moocul.CG.ELv1_2.S62138.g03944.01.t
ATGACAGACAAGAAGACTCCGTGTTTGATCCCAGAGAGAGTTATTCCTGGGATTCTGTCA
AAGCATAATCAGTTGGCAATTGATTGGGGTTATCAGGGACTCATCGCATATGGCTGTCAC
AATAATGTAATAATATTGGATTATAATACTCTTCAAATAATACAAACTTTAATCCTACAC
AAATCACCGATTGCATTGGTAAAATGGGCAAGAGAAAACTACCACCACGACGTTGCAAAA
CCATACAGTCCACGGTTGGCTTCTGTTGACGAACATGGTAAAATAGTTGTCTGGGATGTG
GCACAAGGTTTACAACAAGCTGTATTTCTTGAACCTAATAAATCTGTAGAAGATCTTGCA
TGGCTTAAAAATCAAGATGCATCGGTTGATCTCCTTGTTGCTATTCATTGTCCTAATATT
GTTGTTTTATGGAATGCTGACACCGGTACAAAATTATGGAGGAAATGCTACGATTCTGTT
TCTCATCTTCGAAGCTTAACATTTGATTTCTTTGATATAAAAAATGTTGCATTTTTGGGT
TCTGATTGTGTTTTATTTGCGAATGATTTTGCTGTGAATTGTGAACCGACTTCAAATGGA
AAAAAGTTTTACATGACGTTGGATAAAAATTCATCTAATTCCAATAAAAATTCGTTAACA
AGCAGTTTGGAAGCTGTTGGAAAAGTGGCATTAAGTGGAATAAAATTGTTAATGGGAGAT
GAAAGACCAAAACACAATGAGGTGGCATTGCTGGAGTGTTTACAATTGCTTTACTTACCT
GCCAGTCGTCACCATTTAGCAGCTGTTTTTCCAAGAGAAATTTTAATTCTGGACGTTTCT
ATTTTTCAAGCTATTGCTTCGATACCAATAGAGAGATCAACTTCATCGTTTTTAAGAGTT
CTGCCAACACAGCAGCGAAATGCTTTTTACTGCGTGCATGAAAATGGATCTGTTTCGTTT
CGTGTTCAAAAATGTGTAACTGTTGGTAAATCCCAACTTGAATTTGGCAAAACGAATGAT
CGTTTATATGACATGTCGTATGAGTTGGCTTGTCATTCAGAATCTTTTCGGGTCACAAAT
AAAGTCAAACCATTTTGTGGCACCATTTGTCCCATATCGGAAACTAAAGTTGCAGTTATG
ATTAGTGATGGGAGAATTTTTATTTGGAATTTGACATCGAGCAACAATAGAGCAAATGAT
CTAAAATCAAATCATGGGAATAACTTGCTTTCAGTATTTGCTCCTAAAGAAACCAACAGA
AATTTTTTGGGAACATTACGAGCTATGATTTCTCCACTGTTTGACACTGAGGAAAACCGT
AAAAATCATAAGAAAATACATTTACAGTTTGCCCTTACAGGATGTTCTTGTGAAATTGTA
TCGCAACAGATAACATGCATAAGAATGTGTCCACCGTTAACTCACAAGAATTGGCCACAT
TACCACCCTCTGACCGCAGTTGGCCTTTATAATGGAAATATTCAGGTTTTCAATATTCGA
GATGGTCATTTGTTAAGAGAACTTAGTGTGCATACCTGCCAAGTACGGGGAATTGAATGG
AGCAGTCTAAGAAGTTTTGTTTCATTTGGATATGCAGAGCCAAGTTCTAATCATCAGAAC
TCAGTCTTCAATGAATTAAAGGTTACTGATCTTGATACAGGGAAAACAGTTGCTCTGCGG
GAAGGAAAATCATCCGAACCGATTATACAGTTCATTCGAATATCATATCAACGACAGTAT
CTAGTTGTTGTTTTCCAGTCAAAACCATTTGAGCTATGGGATATACGTTCTCGCCAGCTA
CTCAGAGAACTCTCGAGTACATTCCCAAACATATCTGCGCTGGAGTGGGCTCCAGGTCAC
ACAACAAAGAAATCGAAATCAGATTTTATTGGTGAAGATTGTGCAAATGTTTTGACTAGA
GAGCATTTAGTGTTGACAGATTCTTCCAGCAAATGTTATCACTGCATTGTTGAAAGCTCA
TCCTTCAGATTAGGATCTTGTATTCCTAATAAGAGTAATCGGGATGCAGTTGTATCTGGA
ATTACATGGAAAGGAGATCACTTGTTTATGGGGAATTCCGAAGGCACTATGACTGCATGG
GATCTTCAAGATAAAATTGCAAGATCGGTGTCGACTTACCAAGGTTGTATTAAAAAGGTC
AAATTTGGCCCTGGAAAAGGTAACTTTAAAGTGTTGGTTTTGTATGATGAAGGTGTTGAT
ATTTGGGATGCACAAACACTACAATGTATCAGCTCTTTACACATGCCCAAGACTTTAAAC
AAGATAATTGATGTAGACTGGTGTGCTTCAGAAAATCCTGTCATTGCTTTTCAAAATTCG
ACACTTGTTGTCACTGGATTGGATTTAAAAATACCAATGAAATCCAATTCTCTGTCAAAC
TTTCATTCTCGTTTAACAATATCATGTCCATATTTTCTTTCACCGAAAATGGCATTAATT
TTCAAAGCTGTCTTATTGCATGGAAATGTGCAAGTTTTAAAGGACTCTGCTGATTTGCCA
CCAAACACACTTGATATGCTAAATGCTAAGATATCAAGTTTAACTTCGGTGCAAAATGAT
TGCTTATCTGACTCCAGTATGCTTGTGCGGGGCAATAATGTTGCAAGAATATTTGGCGAT
GAATCGGAAATAAATTTCTATTCTGTGCTTGGAAACTGCGTTGATAAAAATTACAAGCCT
CTTGGAGTTGAAATGGATACACTTGCACAAAATTCATTGTTCAAACTGTCTGAAGTATTC
AGAAATAAAAGACAAATCTTGTTGCGACAAACTGAACACCACCGGAGCAACTGTGTTCGG
AATTTAATTTTACTAGGACAGATTGATCATGCCATACAATTGAGTCTTGAAACAGAAAGT
CATACAGAAAAATATTACACTGACAGCTTGAAGGTTTGCTTGTTGACTTCCCTCAATAAA
AATCCAGAGGCTTCGCAGAGCACAGTGAAGCTCGTTTCTACAAATCTGATTGCAAGTGGG
AAGTTGTTGGAGGGTGTGGAACTTCTTTGCATGATTGATAAACCATATGGTGCATGTCGA
TATCTTTCAAGCTCTGGTTTGTGGGATTTGGCTGTGTGGTTGGCTAAAGTGCGCCTCTCA
AATGAACAGTATGAAAACATTGTGATGAGTTGGGCTACACATTTAAGCTCACCAAAAGTA
AATCAAAAATCCAAAGCTTTGTTGGTTTATCTGTCTTTAAATAAGTATGAGAAGATTTTG
GAAACTTTGTTTCAAATTCGTCATTTTGACCGGGCTGCAATATTTTGTGACATCTGTATT
GAGGAACACCTTATACAACCGTCTGAAAAATTTACCAAATTATGTGAGCAAATTTACACT
GAATATGCACGATTTTTGTACATGATCGGAGGACCGAAGTATATCATGGAACATTACTGC
AATAAAGGTGGTGAGGAAGGAAAAGGATTTTTAATGGAAATTGAAACGAATGAAGCAACC
AGTGACGACACTGCCAACTCCAAAGATTGGAGCATAATACCATCTTCAAATAGCAGCATT
TCAGATGATTTTGAAAAGAAATGA

InterProScan

Gene3D
WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf (IPR015943) - T[6-217] 4.7E-12 - T[302-535] 1.8E-10 - T[536-790] 1.8E-14
SUPERFAMILY
Quinoprotein_ADH-like_supfam (IPR011047) - T[34-197] 1.8E-25 - T[441-607] 1.8E-25 - T[675-758] 1.8E-25
SUPERFAMILY
WD40_repeat_dom_sf (IPR036322) - T[255-398] 2.56E-9 - T[455-527] 2.56E-9

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
WDR11_HUMAN 38.857 % 869 0