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  1. Clone 'AHC0AAA26YA04'
  2. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S49...'
  3. Transcript 'Mooccu.CG.ELv1_2.S35...'
  4. Transcript 'Moocul.CG.ELv1_2.S31...'
  5. Transcript 'Moocul.CG.ELv1_2.S58...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocul.CG.ELv1_2.S58346.g03592.01.t

Possible name(s)

SLC6A1; SLC6A11; SLC6A13

Location

S58346 [5,352 / 9,086]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 208

>Moocul.CG.ELv1_2.S58346.g03592.01.p
MVGIKEEKMDQIGTNGRTTQNKFYRVLVIALDLVMFGDSRTCATETVEGVGVASTLMLFY
SSVYYILIIASVLVYMFHTFTLQELPWMTCDNWWNTNSCVTLHLASNQTSNTTKVTLSTE
VFFNNNVLQMSKGIDDIGTIANWKLIRCFILSWVICYFVLFKGLKLAGKVVYFTALFPYV
ILTVLAVRGCMLPGASDGLKYFLYPNFT

Nucleotide sequence

Length: 1,805

>Moocul.CG.ELv1_2.S58346.g03592.01.t
TTTCAGAATTTTTTATAGGTTTCTCAAGAGAAATAATTTGTTGTTAAATTTATGCTGGTT
AATTAAAGTGACTAAACTAAAATGTCTAATGGTGGGTATAAAAGAAGAAAAGATGGATCA
AATCGGGACAAATGGTCGAACAACACAGAATAAATTTTATCGTGTCTTGGTTATTGCTTT
GGATTTGGTAATGTTTGGAGATTCCCGTACTTGTGCTACAGAAACGGTGGAGGGGGTCGG
TGTGGCATCAACACTAATGCTATTCTATAGTTCGGTGTATTACATCTTGATTATTGCTTC
GGTTTTGGTATACATGTTTCATACATTCACTCTTCAAGAACTACCTTGGATGACATGCGA
TAACTGGTGGAATACAAATAGTTGCGTGACGTTACACTTGGCGTCAAACCAAACTTCCAA
CACAACCAAAGTTACTTTATCAACTGAGGTATTCTTTAACAACAATGTTTTACAAATGTC
TAAAGGGATTGATGATATTGGAACCATCGCAAACTGGAAATTGATTCGCTGCTTTATTCT
TTCATGGGTTATTTGCTACTTTGTTTTATTCAAAGGACTCAAATTAGCTGGGAAGGTAGT
ATACTTCACAGCTCTCTTTCCTTATGTCATATTAACGGTTCTTGCCGTACGAGGATGCAT
GCTTCCCGGCGCCTCAGATGGGTTGAAGTATTTCCTTTACCCAAACTTCACATAGTTAAT
GGATGTAAACGTTTGGGTGGAAGGCAGCAGTCAAGTTTTGTATTCGTACGGAATTTGCTT
CGCAGTCCTCATTGCATTTGGCAGCTACAGTGACGATGAAGCGGATTCGTTGAATCAATC
TTTAAGTACCACGTCAGCATGCAGTCTTACGTCTTTATACTCTGGTATCGGTGTGATCAG
TGTTTTCGGACACCTTGCGCATGTTACCAACCAAAACGTGTCAGATGTTGTTGCTTCCGG
TCGCAGGCTTGGTTTTTCAAACAATCCCCGGCGCGCTTTCACTTATGCCTCTTCCACAAT
TATGGACATTTCTTTTCTTGTTTATGATGTTGCTGATTGGGATTGATTCGATTTTTGCAT
GCATGGAAGGTGTTGTGTCTGCTCTTGGTGATTACATTCCAGGTATCGTCTACGTCAAAT
CACGAAGACAGTGGTTCATGCTATGTGCATGCATTGCCATAGCACTTCCAGGAATACCCA
AGATATTTGGGTGTGGGATTTACATTTTCGAGATTTTCAACAACTACAGTGTTGCGGGGG
TTTGTATGTATACCGTCGCCTTTTTTGAATGTGTAGCGGTTGCTTACATGTACGGTACAA
ATAAGTTCTGTGGAAATGTTAATTCCATGATCGGATATTCCCCTCCAAAATTATTTAACT
TTTGTTTTCTGGTTACTGTACCACTTCTTACACTGAGTGCGTTATTGGTTGCGATTATAC
AACACAAACCATTAGCTTTGAGTTGGTACACTTATTCACAAAAGGCACACGGTTTCGGTT
GTATGTTGGCTTTGTCGTCTGTTCTGTGCATTCCAGTATGCTTCATCTATTTCCTGATTA
AAGCTGATGGAAACAACTTACTTTTGAAATATAAATCCGCAACAATGCCGCTGTTTGCTG
GTCCTCTTGAAAACGCAGATTTGTCGATGGAAAAAGTAAATTAAATGAACATATTTAAGG
ACCATTCATGTTTGTTAACGAATTGTAACTATATGAGACTTTATTTTACTGTTTAACTGT
TCTAGTTATACATTAAGATTGACATTACAACATTTTCCAATGCAAATATTGAAATATTGT
CAATC

InterProScan

PANTHER
Na/ntran_symport (IPR000175) - T[41-207] 4.1E-52
Pfam
Na/ntran_symport (IPR000175) - T[46-207] 2.7E-47
SUPERFAMILY
SNS_sf (IPR037272) - T[47-207] 3.79E-37
ProSiteProfiles
Na/ntran_symport (IPR000175) - T[48-208] 19.654
PRINTS
Na/ntran_symport (IPR000175) - T[49-75] 1.0E-13 - T[170-187] 1.0E-13

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
S6A12_HUMAN 44.72 % 146 5.02E-41
S6A13_HUMAN 43.827 % 147 1.84E-41
S6A11_HUMAN 42.771 % 139 2.41E-38