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Transcript Model

Transcript Id

Moocul.CG.ELv1_2.S52283.g03065.01.t

Possible name(s)

MYD88

Gene model

Moocul.CG.ELv1_2.S52283.g03065

Location

S52283 [40,588 / 45,246]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 207

>Moocul.CG.ELv1_2.S52283.g03065.01.p
MLLNEHNNRLISVNNIRDSESWPHGPTSLIDEEENAIVEIKYNDGNESSLHVAAGVQNAR
FNQIKNEKVEVQESYDVFLIFDIADKDFVTELHDRLKNENFKVCIPQRDLPGGTTEYDTN
LEFMFDRSRKVVIVKSDELFASQLWKWHMNMLIGSDPVAKQRKIIPVKYKDVSTKNILEH
LCCCDRTTVLEEEWFWTKLFNSIRHNR

Nucleotide sequence

Length: 4,082

>Moocul.CG.ELv1_2.S52283.g03065.01.t
ATGTTGCTAAATGAACATAACAACAGACTGATCAGTGTTAACAATATCAGAGACTCAGAG
TCATGGCCCCATGGTCCAACATCCCTGATAGATGAGGAAGAAAATGCAATTGTTGAAATT
AAATATAATGATGGAAACGAATCTTCGCTGCATGTTGCTGCTGGTGTTCAGAATGCCCGC
TTTAACCAAATCAAAAATGAAAAAGTTGAAGTGCAAGAATCATATGACGTGTTTCTAATA
TTTGACATCGCTGACAAAGATTTCGTCACGGAATTGCATGATCGTTTGAAAAATGAGAAT
TTTAAAGTCTGCATTCCTCAGCGTGATCTTCCTGGTGGCACCACAGAATACGACACAAAT
CTAGAATTTATGTTTGACAGATCTCGAAAAGTTGTAATCGTCAAATCTGATGAACTGTTT
GCAAGCCAGTTGTGGAAATGGCATATGAACATGCTCATTGGAAGTGACCCAGTGGCCAAA
CAGCGTAAAATTATTCCGGTTAAATATAAAGATGTTTCAACAAAAAACATTCTTGAACAT
CTATGCTGTTGTGACAGAACTACGGTGCTGGAGGAAGAATGGTTTTGGACAAAACTTTTT
AACAGCATTAGACACAATCGTTAATTAATAATAATTACGTACCAATGTGTACCAGCCAAG
TACCAACAATCAATAACACAAATCTATATTTTAACCTTTAGGTAAAAGATAGAGTTCATA
AAAATCAACAAATTATGTTCTATTTTTTTCTCTTCTAATGCATTGAGATTCTTACCAATG
GTTTGTAGTTCCCTTGCAGTATGAATGTGTCTTCTTCTGTTAATTCCCTCCTCTATTCAA
TATTGCAAAAAAAAATATTATTAGCCAATGTCTGCACTTATTTTTTTTTTATTTTATTGC
TTTTCAAATTCTGATCAATTTTTAAACCATACAGTAAACTGCATTATTACTATGTCTTCA
TGTCATTTTTCTTCTACTGTGTTTGTTTAGGCTATGCCTGTTATTGTTGCTCTTATGAAG
GTTGTATAAATATGTATATATAACACTTAAACAGGATAAAGGCGTTTTAAATAACTATAA
TTTTTATTAATAGTGCAAGAAAGATTTTGGATAAATTCATCCATAAGGTAAATTGAGTTC
AAAAAACAAGCTATCCTAATTAAAATGAAAGATGAATGAAAGAAAAACAACAACAAGTAG
GTATACCGCAAAAAAATATACCAAAAGCAATCGATAAAATGTTACTGCTTCATTGGCAAT
TAATTCTAGTGCAAAAATTTATAATAAATCGTTACATATCGTATGATTATTGCACATAAT
GGCATTTGAATAAATAAGCTTCTTTCATTGAACAGACGGAAAAGTATTGCAACTATACGA
ATCTGATCAACTAATATATGTTTGATAAGTTAATGAAGTTACATGGCTAAATACGAATAA
TAATGCATTGGTTATGTTATGATTCGCTTGATGATACTACTGGTACACTTTGGTTGCTAG
GTTCCATGGCACCCAAGTCCTGATTCTGCTGCTGTTCATTCAAAGGAACATCATCCATGT
CAATGGTGGTGAAAACAGGATTTTGAAACGTCGTAGTTGTATTGTTACTGGTATTTGTAT
TCATGTCGATCCCACCATAATCTGCACTCTGTGGATTGTTATTGGATTCTGTATTTTCAT
TTGGCTTGTTATCAGTTTTATCTTCTGCATTGCAGAATGTCATCTCTATGGAGTAGTAGA
CGGCCCAAAAGACGAAGAACGCAGAGAGCATAACAACTAATTTGAGTGTTCGGTCTTGAA
TAGCAGAAGTGACATCAAATTCCAGTGGAACTCCAATGGGGCAATGAACAGTATAATTAC
TATCAGAAGATAAATATTTACCATCAAACGCATCTGAAATTATCATCCTCCTCTCTTCGA
TATCTTGCTGGGTCATTTGTGAGCCATACATAGTGACAGACCAACTTTTTAAAGTTCCAG
CAGTTTCATTGACTTTACGTTTGTCAATTATTTTAAATTTAAATGTTCCATATGGTTTTT
CACCCCAACATTTAACAGTTGAAAAAGCCCAATTTTTAAAACCATCTTTAGATTTATCAA
GTTTTCTTCCTGAGAAAACACTCTTTGTTCCACTGCCATTATCATCAGATGGACATTCAA
ATTCAAATGACAATTTTCCACGATTGGCATGATTAATATTCACTGTGATTAAAATATATT
CCAAAGAGTTTAATAAATGTTTGGCTGCTTCTGATTTTGATATATGATGTGTTAAAGTAA
GTGCATTTTTTCGACCCACGGGGATTTTTATATTAGATTGATTCTTAGCGGGATCAGTTC
TGAGTGAGACGAGCATAGGAACAGATTCCCAAACTCTTGCTGCGTTCACTAATTTCCAGG
AGTCCAAAAATCCAAATCCATGACTGCTACTATGCATGAATCCAGCTTTATTTGTAACCC
AATCATCGTTACCTATACTTTGCCCTTTCCAATTTCGTTTTCCTGTGAAAGCTATTATAT
GTTGCACATCTCTCCAGGTAAGACATGGTCTTGATTCCAACATTAATGCAACCATTCCAG
CAACTAATGGCGTTGCTGCAGATGTTCCAGAAAAACCATCTGTACATCCACCATTCCAAT
CTGTAGTTGCAATATTTCTTCCAGTGCCACTGCTTAATGTAGTACCAAGCATTGAGTTGC
ATGCTTCGGAATAACTTGGCTTCGTTCCAAATTCGTCAAGAGCGGCTATTGTGATGGTGT
ACATTGAATTCGCATAACCATCAAAATCACAGTTATCGTCTGGTCCACCATTTCCACTGG
CTACAACAAAGATTGAACCAAATCCATTTCTACCGGCAACAACACCATGTTCAAGAGCCG
CCCTACCCAATGCATGAGGCCCATCCATTTCCTGGGCATCATCCTCGGGCCCCCATGAAC
AACTGTACACATCATTAACATCCATGTACTTGTTAAATGCCACTGCTTCTGATGCATCTG
TGGTTGGACCATCGATAGCCCTTATGCCACTTATTTGTGCGCCAAATGCGATCCCAACTC
CGCAAACAGAATTAGGAACAGCAGCCACTTCACCCGCACATCGAGTTCCATGCTTATTTT
TTTCCTCCTCATCATATCTTGGACTTGGATCTTCATCATTGGAATTTATATCGAAACTTC
CTTCGGGACAGTAATTGTCTTTTAGATCGGGGTGATTCCACTCCACGCCATCATCCACTA
TCGCCACAACTACACCTTTTCCAGTTATATTTTTCTCCCACACCCCCGTGACATTACAAT
CTAAATAACCATTGTAGTTGTGTAAATGCCATTGCTTATGGAATAATGGATCTTTAAATG
TATGCCAGTCTGGAACTATTGTTCTTTTTACACGAATAAGTGGTTTTTCATGTTTCTGCC
ATTCAATGGTGATATGTTTTTCTAACTCCAATAAAGTGTGCGATACATTTCGACCATTTT
TATGCCCAAATGCATAATGACCCTTTAAAAGGCCAACTTGTCCCAAATAATCCAGGGAAT
AAATTTCTGCGATTTCTTTGGCAAGTGTATTGTAATCATCTTTTGACTCCTTTAGCTTCA
AGCTGATAATTTCAGTTGATCTGTCAGCTACATGACTCTGACTAGAAATGGTGATGAAAA
CGAAACAGAAAAAGATCTTACAGCAAGCTTCATAAAAGTAAATTGGCTTCATTCAACGAG
GACCTTTTAAACTAAGCTTCAAAACATCGCATTTCTGCTTGCCTCTGCATTGGAATGATT
TTTTTTATTATTTATGACATACATCAAACAAACAAGCGCACAGAACGGAGTATCAAAGAA
AGTGTTCTATCAAAGCGTGTCGTTTTCAATGCGCGTCGTCTATCTGCTGATCATTTTCCA
ACATATCCCGAGGGCGATATGATTGATTATTGTATACTTCGTTGTTATTTGTAATAAAGT
TTCCGATCGGACTTCTCATCCCGGTCGCTGTCGCTCGCCAGCTCTAGTTCTCCGTGGTTT
ACCGATTTAATCCATTCCAGCATTAAAGAACAGCTAATAAGTTGTTTCCACCTTCTAAGC
AT

InterProScan

SUPERFAMILY
Toll_tir_struct_dom_sf (IPR035897) - T[70-206] 1.83E-20
ProSiteProfiles
TIR_dom (IPR000157) - T[73-170] 13.097
Gene3D
Toll_tir_struct_dom_sf (IPR035897) - T[74-203] 8.6E-22
Pfam
TIR_dom (IPR000157) - T[77-181] 2.4E-8

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
MYD88_HUMAN 26.842 % 80.9 2.59E-18