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  1. Transcript 'Moocul.CG.ELv1_2.S24...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocul.CG.ELv1_2.S24758.g01043.01.t

Possible name(s)

RAB18; RAB2A; RAB2B

Gene model

Moocul.CG.ELv1_2.S24758.g01043

Location

S24758 [24,461 / 26,676]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 206

>Moocul.CG.ELv1_2.S24758.g01043.01.p
MGDGGVLTTLKILIIGESGVGKSSLLLRFTDDKFDPDQPATIGVDFKVKAVSVDGNDVKL
AIWDTAGQERFRTLTPSYYRGAQGAIFVYDCTRRESFANISNWMTELETYTTKPNIVKML
VGNKIDRNDRVVSREEGLKFARKHAMLFIEASAKTKDGVQCAFDELVEKIIQTPGLWEKD
GAKSTGFGVGSNQAPQGESSCGGCVI

Nucleotide sequence

Length: 1,302

>Moocul.CG.ELv1_2.S24758.g01043.01.t
AGATTAAGATTTGTGTTTATCATGTTTATCATAGGCTACTTTCTTGTATTTGGTTTGTTA
TTATCCAGATTATTTCTAATCTGATTTAACTGATTAAACGAACAACTTAACAATATTTTA
AATGGGAGACGGAGGAGTATTAACAACCTTAAAGATTTTGATAATTGGGGAGAGTGGAGT
TGGAAAATCAAGTTTGTTGCTTCGCTTCACTGATGATAAATTTGATCCAGATCAACCAGC
AACGATTGGTGTTGACTTCAAGGTAAAAGCAGTATCGGTTGATGGAAATGATGTAAAACT
TGCGATATGGGATACTGCCGGTCAAGAGAGATTTCGGACGTTAACTCCAAGTTACTACCG
TGGAGCGCAAGGCGCAATATTTGTTTATGATTGTACGAGACGAGAATCGTTTGCCAATAT
CAGCAATTGGATGACGGAACTCGAAACTTACACGACAAAACCAAACATTGTTAAAATGCT
TGTTGGGAATAAAATTGACAGAAACGATCGAGTCGTGAGTAGAGAAGAAGGTTTAAAGTT
TGCACGAAAACATGCAATGTTATTTATTGAGGCGAGTGCAAAGACGAAAGACGGAGTACA
ATGTGCATTCGATGAACTTGTTGAAAAAATAATACAAACGCCAGGACTATGGGAGAAAGA
TGGTGCTAAATCAACCGGCTTTGGTGTTGGCTCTAATCAAGCTCCACAAGGGGAAAGCTC
ATGTGGAGGGTGTGTAATTTAAACAATATTTATAACAATTCAATTGTTAAATCGTGTTTC
GTGATGGTGATGTGCACTTAAAATGACTTGAGAAGAATATGCTTTCCTCTGAAGAATATT
AAATTGATTGGGAGCAAGCAAAATGTTAAAATACTGGACCAATATTTTTCAATGCCTCAT
CACACATTTTTCGTAGTAACTTTTGATTTTCTGTTTTAGTTAGTTTATTTGGTGTTTGTT
TAGCTACCACTTTCATCTTGTATGATTTTATATGATTTTTTTCAGTTATTTCAATGATTC
AATTAGTTTTGTTAGTTGAAATTTTATTATTTAATCTTATGCTAGCAGTGCATAAACATA
AAACAGTGATTCTGCTAGTATATTTGAATTTGTAATTGTACTTTTTAAATCAACCAATTT
CTCTTATAAATTTTCATTTTTGTGCATTGTCCTTCTTTGCAATGTTATATATCAAGGCCA
AGGTTGCAATGGTCAGTGGTCATTCAAACTTTCTCACCGCCAATAACTACTACTACTTCC
AAACAAAATTAAAATTAATTCATTGTTTTACGAAAATAATTA

InterProScan

TIGRFAM
Small_GTP-bd_dom (IPR005225) - T[9-166] 4.6E-32
SUPERFAMILY
P-loop_NTPase (IPR027417) - T[9-179] 2.98E-57
Pfam
Small_GTPase (IPR001806) - T[11-171] 1.1E-57
ProSitePatterns
Sigma_54_int_dom_ATP-bd_1 (IPR025662) - T[12-25] .

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
RAB18_HUMAN 78.771 % 294 1.02E-102
RAB2A_HUMAN 45.55 % 170 1.76E-53
RAB2B_HUMAN 47.895 % 172 1.76E-54