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  1. Transcript 'Boschl.CG.Botznik201...'
  2. Transcript 'KH2012:KH.C8.96.v1.A...'
  3. Transcript 'Moocul.CG.ELv1_2.S23...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocul.CG.ELv1_2.S23676.g00931.01.t

Possible name(s)

MFAP4; TNC; TNR

Location

S23676 [12,876 / 16,932]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 350

>Moocul.CG.ELv1_2.S23676.g00931.01.p
MSVEETGFTYSRAEDEDGSPEIVVGSSRQLDVEIKRIKRRPRSSSAKEFIKRKIVGGTSY
RTDEIGEAYEPPARKPLFGQIGMARLSLVFSVISLIIGLILLFQFFIEGIAMSKNVVKLD
KMVGDLQPVDCSTVTYRQATTWNDTGGVYVICPQAYTRGLEVYCDVATDGGRWLVFQRRM
NGRLRFDRKWKPYVRGFGNAKEEFWLGLEAIHKLTQNGSFELRIDMMDWYGNRSYAHYRK
FKLGDAKSNYKLYVRGFDSKGTAGDSLSWHHGAKFSTFDNDNDNSVQNCADRWDGGWWYE
NCFDVNLNGLWVKNGVSTANKGIIWKHFAGLEHSLKFTEMKFRKLPTNSP

Nucleotide sequence

Length: 1,942

>Moocul.CG.ELv1_2.S23676.g00931.01.t
TTTTATTAAGGCCTTATAAAAAAAATTGATTTTTCAAGTATCAAGCAAACTCGTAAATTT
CGGTTGTCTATTAAACTTCTGTGACATTTATCTTTGTACATTTAAAATGTCCGTGGAAGA
GACAGGGTTCACTTACAGTCGGGCGGAGGATGAAGATGGCAGTCCAGAGATCGTTGTTGG
CAGCTCAAGACAATTGGACGTAGAGATTAAACGGATTAAACGCCGGCCACGATCTTCCTC
TGCTAAGGAATTTATAAAACGGAAGATTGTCGGAGGAACGAGTTATCGAACAGATGAAAT
TGGTGAAGCTTACGAGCCTCCAGCTCGTAAACCATTGTTTGGACAAATTGGAATGGCGCG
TTTGTCGCTTGTCTTCTCGGTCATCTCCCTCATCATTGGGCTGATTTTACTTTTCCAGTT
TTTTATTGAGGGAATCGCAATGTCCAAGAACGTTGTGAAGCTTGATAAAATGGTCGGAGA
TTTGCAGCCTGTCGATTGTTCCACGGTGACATACAGACAGGCCACCACATGGAATGATAC
AGGCGGTGTATACGTCATCTGTCCACAGGCGTACACAAGAGGACTGGAAGTATATTGCGA
TGTTGCTACTGATGGTGGAAGATGGCTGGTTTTTCAACGTCGAATGAACGGGCGGTTGCG
ATTTGACAGAAAATGGAAGCCATACGTTCGAGGTTTCGGGAATGCCAAAGAGGAATTTTG
GCTTGGCCTGGAAGCAATCCATAAACTCACTCAGAATGGAAGCTTCGAGCTAAGGATCGA
TATGATGGATTGGTATGGGAACAGATCATATGCTCATTACAGAAAATTTAAGTTGGGTGA
TGCGAAGAGCAATTATAAATTGTACGTTCGAGGTTTTGATTCAAAAGGAACGGCTGGTGA
TTCGCTTTCATGGCACCATGGCGCAAAGTTCTCAACATTTGACAATGACAATGATAATTC
TGTCCAAAACTGTGCTGACAGATGGGACGGTGGCTGGTGGTACGAAAATTGTTTTGATGT
CAACCTGAACGGGTTGTGGGTGAAAAATGGAGTCTCCACCGCAAACAAGGGCATTATTTG
GAAGCACTTTGCTGGACTTGAACATTCCTTGAAATTTACAGAAATGAAATTTCGAAAGTT
GCCGACGAATAGTCCATAACCAATTTCGATTTTATTTAAACCAGTTTCATGCAATACATA
TCCTATCGATTTTATCATTCATGGCGAAGATTTGATTGAATAATTTTGGCGCCAAATAAG
TATTTCTCTGTTCGAATCGTTTAAAAATAGCCAGCGGAGTAAGAGGCTGAAACAAACAAG
TATTGTGAGGGAACCTTCACCACATATTGACAATAAACATCCAGCCACGAAACATCGTAT
ATAATTATGATCTGACGCCTTTAAAACTAGAAAAATCTTAATTAAGTACTTAAAATACCT
GGAAAACTTTTGTCAACCGCTAATAATAGCTTATGAGAACTGTTCATTTTCCTCTCCAGT
ACAAAGTTGCTTTCAAGCGATAGAATTCGGATCGAAAAATGGCAAAACTTTAGAGTGCTG
TCAGACCAACGATAAGAAGCGTATGTTATTTAAATTGCGTCCCATGTTTAAGTTTACAAA
TTTCAAGTATAATACCCTTTCAATCTTTCACACGTCCGGGCCGATGGTGATTGCCAAGAA
TGTTTTGTACCAGTAAGTTTACTTTGCAACAAGACTGTACAAAAAACATTTTATTTACTT
TGGAAAATTTACTTTCGCATCAATCATTACTTTGTCATGTTATTAATTTTTGTAAATCCA
CTCATCGTGACATTTAAGTTATTTATTGCCGTTTCTTATTATTATGTCTGTTTTATTTCA
TGATTCTTATTGTTCTTTTTGCGTTGTGTTAAAAGCCTTTTAAGTTGCCATAACACAAAA
ATGAACTATTAATACATACAAA

InterProScan

ProSiteProfiles
Fibrinogen_a/b/g_C_dom (IPR002181) - T[122-346] 53.993
SMART
Fibrinogen_a/b/g_C_dom (IPR002181) - T[126-345] 4.0E-86
CDD
Fibrinogen_a/b/g_C_dom (IPR002181) - T[127-343] 9.86482E-99
SUPERFAMILY
Fibrinogen-like_C (IPR036056) - T[128-344] 1.18E-73
Pfam
Fibrinogen_a/b/g_C_dom (IPR002181) - T[142-343] 5.1E-65

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
TENA_HUMAN 46.903 % 202 5.78E-58
TENR_HUMAN 46.575 % 196 4.98E-56
MFAP4_HUMAN 43.049 % 180 4.71E-55