Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

Moocul.CG.ELv1_2.S114608.g13535.01.t

Possible name(s)

CDS1; CDS2

Gene model

Moocul.CG.ELv1_2.S114608.g13535

Location

S114608 [37,212 / 43,517]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 440

>Moocul.CG.ELv1_2.S114608.g13535.01.p
MNAGNVRKRKVRNEDPADDHASDSSVNQTSDVPQSKDDTPEFMKDALKDLPPKWKNWWIR
GVYSVFMILSFFIIIYSGHVAFVTVIFLIQFKCFHEIITIGHQVYKSYDLPWFRSLSWYF
LLIANYFFYGETLNEYFGRFTRTVSSFDENPRSTTNHLFCVHFNDHTGTVNVLLPIPPDD
LVWSLPRRLHALCVKSRQEDVPSPVLHAHLIIQNLYEGLIWLIVPVSMVIINDIMAYICG
FFLGKTPLIKLSPKKTWEGFIGGGIWTVIFGWLLAGYLSQFSMIVCPIEVDANFTTQEGC
EISATFLPTEYTIPLYIRVLLKVVGLNWSTVTIIPFQLHSLWFSVFASVIAPFGGFFASG
FKRAFKIKDFGDVIPGHGGLMDRFDCQFLMATFVHVYLSSFIRVPSPRKLLPIIFALKPQ
EQEWILQELQRHLQVNAGDV

Nucleotide sequence

Length: 2,008

>Moocul.CG.ELv1_2.S114608.g13535.01.t
TATTAAAGAGCTGTATTTTTTTCGAAGAAGTTTGTGTTTGTTTTTGATTAGTCATGTTTG
AATTTCGTAATTGTAAACAAATAAACTAATAAGCAAACCTAACTAACTCACCGTACTTCA
AATCAAACGTGTTGCCTTTTAACTCACAAACAGTCAGAGAGTATAGGTTATTGCATGTTG
GTGTTCATATTATGTAGTTGGTGAAAGTGATATAAAACTGTTTTCTCCACGACAATTTGC
TGATTTAAGACTGTAAGACATTAAGATGAATGCCGGCAACGTACGAAAACGAAAGGTTCG
AAATGAAGATCCTGCAGACGACCATGCCAGTGACTCAAGCGTAAATCAAACATCGGATGT
GCCGCAGTCAAAGGACGACACTCCTGAGTTCATGAAAGATGCACTGAAGGATCTTCCTCC
AAAATGGAAGAACTGGTGGATTCGAGGAGTTTACTCGGTATTTATGATTCTATCTTTCTT
TATCATCATTTACTCCGGACACGTGGCGTTTGTCACCGTCATCTTCCTCATCCAATTCAA
ATGCTTTCATGAGATCATCACGATCGGGCATCAAGTTTACAAATCGTACGACTTGCCGTG
GTTTCGATCGCTTAGTTGGTATTTTCTCCTCATTGCAAATTACTTCTTCTACGGAGAAAC
GTTGAATGAATATTTTGGAAGGTTCACTCGAACTGTAAGTTCATTTGATGAAAATCCACG
TTCAACAACAAATCATTTGTTTTGTGTTCATTTTAATGATCACACAGGAACCGTTAATGT
TCTTCTTCCAATACCACCGGATGATCTCGTTTGGTCTTTACCTCGTCGGCTTCATGCTCT
TTGTGTTAAGTCTCGTCAAGAAGATGTACCGTCTCCAGTTCTTCATGCACATCTTATCAT
CCAAAACTTATACGAAGGTTTGATCTGGCTTATCGTGCCGGTCAGTATGGTCATCATCAA
TGACATCATGGCGTACATTTGTGGATTCTTCTTGGGAAAAACTCCACTTATCAAGTTATC
ACCAAAGAAAACGTGGGAAGGTTTCATCGGAGGTGGCATTTGGACGGTGATCTTCGGCTG
GTTGCTTGCTGGATATTTGAGTCAGTTTTCGATGATTGTTTGTCCGATCGAAGTTGATGC
AAACTTTACAACGCAAGAAGGATGTGAGATCTCCGCTACTTTTCTCCCAACGGAATACAC
GATACCACTCTACATCCGTGTCCTTCTAAAAGTGGTCGGGTTGAATTGGTCCACTGTAAC
CATAATCCCGTTTCAACTTCATTCGTTGTGGTTCTCAGTGTTTGCATCCGTCATCGCTCC
ATTTGGAGGTTTCTTTGCAAGCGGTTTTAAGCGGGCTTTCAAGATTAAGGACTTCGGTGA
CGTCATTCCGGGCCACGGTGGTTTGATGGACCGATTCGATTGTCAGTTTCTAATGGCAAC
CTTCGTTCACGTTTACTTGTCCTCATTCATCCGTGTGCCGTCCCCACGGAAACTCCTTCC
AATAATATTTGCACTGAAACCACAAGAACAAGAATGGATCCTGCAGGAACTTCAACGACA
TCTTCAAGTCAACGCCGGTGATGTGTGACGACATTCGTTTCGTGCTTCAAAATCATGTTT
TATGCAAATGATGCAGCCATGTTTTATACTTTTATAAACACTGATAAAATATTATATTAT
CATTTAATTTTATAATTGATTATATTTTATATATAGAAGCATGCTGTTTGTTTTATTTGC
AGTTATTGGCCATGCATTATTACATGAAATGCAAATTATTATTATTCATTTACTCCAGGG
TATATTGTATATCATCGTCTGTCCTCATACTGCTACCTATTATCGTTGTGCCGACCCGTG
TGTGGTGTGCTTAATATACTCGATGCTGGTGGAATCAATGATACTTGTGTTTGCTGTGAT
GTTTGAATTTGTACAACTCTTTGATCGGTGTACACCATTAGGAATAAAGAATATTATTCG
AATTTGTTTCTACTTATTTTATTTTTGA

InterProScan

PIRSF	PC_Trfase_euk (IPR016720) - T[2-438] 1.7E-132
ProSitePatterns	PC_trans (IPR000374) - T[359-385] .

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
CDS1_HUMAN	48.712 %	395	4.91E-135
CDS2_HUMAN	50.461 %	397	1.17E-135