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  1. Transcript 'Cisavi.CG.ENS81.R16....'
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  4. Transcript 'KH2012:KH.L153.22.v2...'
  5. Transcript 'Moocul.CG.ELv1_2.S11...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocul.CG.ELv1_2.S113842.g13158.01.t

Possible name(s)

ZFP36; ZFP36L1; ZFP36L2

Location

S113842 [79,347 / 82,752]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 424

>Moocul.CG.ELv1_2.S113842.g13158.01.p
MASMMTASFSDYRLDRDRDIKPSAYLANLPSGFSAFSTGASALRTPEKAVSIPVAAPSAY
RPALPRSTSMQPRTTSGLNATTPAARSRLNLSRTTSVCSVPTVIPESSIIPATSTTATSE
PINVFKDVGFRNRAFSEGANGQSQLQQQLQQQQVQSSRYKTELCRPFEENGKCKYSDKCQ
FAHGKHELRNLVRHPKYKTELCRTFHTSGFCRYGPRCHFIHNTEDANTTRATNAPNSFAQ
QSFGQSSNAMPVPEPQNNVSNHYQNSRPAQLELIGKQFSVDSGIGTYAQSSYSPNSTSPL
NGSPISDILGSHTVLSPLSPPVSGSRFSFNNNMLSGNNEGFQRSTNMSSNYGYCGIDTSS
CTPPNSTFDLLKQQINSTGYEITDDTVFEPLTPPDSDRESMTGSPSSRSSQQRLPIFRCL
SHSD

Nucleotide sequence

Length: 3,019

>Moocul.CG.ELv1_2.S113842.g13158.01.t
TCTCCAGTCGAATTCGATCAGCATTTAGACTTACCGTTGAAACAAGTTGTATTAGCACAG
AGCTGCTTTTTCTGTTACGGTACATGCAAATACATTAATTTTGCTGTTCTATTCAGATCC
GAACAGAATATCATACATATTATACTTACTTAAACCTTATAAGTAAGTTTCATTACTCAA
AAACCAAGGATTAATACAAATAAAATTGAAAATGGCATCAATGATGACTGCAAGTTTTTC
CGATTACAGACTTGACAGAGATCGAGATATCAAGCCAAGTGCATATCTTGCAAACTTGCC
TTCGGGATTTTCCGCATTTTCGACCGGGGCATCTGCTTTGAGGACGCCGGAAAAGGCCGT
CTCTATTCCCGTCGCCGCACCCTCTGCATACCGGCCGGCGCTGCCGAGATCTACCAGCAT
GCAACCTCGTACAACGTCGGGATTAAATGCAACTACACCTGCTGCCAGAAGTCGATTAAA
TTTGTCAAGAACGACCTCCGTTTGTTCTGTACCCACTGTTATTCCTGAAAGTTCAATAAT
CCCAGCGACTTCTACCACAGCCACAAGCGAACCTATTAACGTATTTAAGGATGTTGGATT
TCGTAACCGAGCGTTTAGCGAAGGCGCTAATGGCCAAAGTCAGTTGCAACAGCAATTACA
GCAACAACAAGTACAATCAAGCCGCTATAAAACCGAACTGTGCCGACCTTTCGAAGAGAA
CGGAAAATGCAAATACAGCGATAAATGTCAATTCGCTCATGGCAAACACGAATTAAGAAA
TCTTGTCCGACATCCAAAATACAAGACCGAATTGTGTCGCACTTTTCACACAAGTGGATT
CTGCAGATACGGACCGCGCTGCCACTTTATTCATAACACTGAAGACGCCAACACTACTCG
AGCTACCAACGCGCCAAATAGTTTTGCCCAACAATCTTTTGGACAAAGCAGCAATGCGAT
GCCAGTTCCAGAACCGCAAAATAACGTTTCAAATCATTACCAAAACTCAAGACCTGCTCA
ATTGGAGTTGATTGGAAAGCAATTCAGCGTTGACAGTGGTATTGGAACATACGCACAATC
GTCTTATTCACCTAACAGCACAAGTCCACTGAATGGCTCTCCAATTTCGGACATCCTTGG
AAGCCACACTGTTTTGTCGCCACTTTCCCCGCCAGTTTCAGGCAGCAGATTTTCGTTCAA
CAACAACATGTTATCAGGGAATAATGAAGGCTTTCAGCGATCGACCAACATGTCTTCAAA
TTACGGGTATTGCGGCATTGATACATCGTCATGCACACCGCCCAATTCTACCTTCGATCT
GTTGAAGCAACAAATTAACTCAACTGGATATGAGATTACCGACGATACAGTTTTTGAGCC
TTTGACACCACCCGATTCTGACAGAGAATCTATGACTGGTTCTCCATCAAGCCGTTCATC
TCAACAACGTTTGCCCATCTTCCGCTGTCTATCGCACTCGGATTAAGATGGAACACATCC
ATTGACGTTGGTTAAAGCTGACGAGAATGTTATTATTTGTCGAGCTTTGTGTGGCGAGAT
GTAAATTAACGCACATAACAGAACCTTACCTTGCAAAAATACTAAATAAGCTCAAGGAAT
CTTTACTAGTGCATGTAAGTGCCTATAATTTTATTTCGTTCAATGCTCTTAAACCATTAA
CTTTGTTAAAATGTATATTTTTATCGAAATTTACATTATTTACGGCAGGGAAATTATTTA
AATCTTTTAGAACAATATCACTTGTTCCCGTAGGCTGTATGATGTAAAAACAGGCTGTGC
TTTTTAGACTTTATGTCATTATTTATGTTTTCCATGGTTTTATCTTATGGTAAATGCAAC
ACGAACTATTATTGTTTTATTTTTTCTCGCGACAGATATTCGCATTTTAATCATACCGTT
ACCATAGTTAAATACCATGTTTATTTATTAATAATGCTGCTTCATTTATCACTATCTTGT
TGGTTTTTGCTATACGTTTTTTTTTTATTTCTATCTAATCTTTTCTACAAAAATGCAGTT
AAAAACAATAAAAAAATATTTCTCTTCACACGACGAATTAAAATAATTCCAAGCAGTTTT
GGTTAATGACTTTGCACAGAATGTCGGACGTGTTGAGACGATTTGTACGTCAAGTTTGCA
ATGTAATGCCTTAACACCAACGCCTATGTTAACAACGATTAAGTCCATACAAAAAACATC
TTTGGCGTATATTTTTATGCAAGTCTGCTAAGTTAAATTCTGTGCGTTGTATCCCTGTAA
GGTGCTTCTATTTATTTATTCTTGTGTAATTTTATTTTGCCAAATATGTTATTGCCAATA
TTACTTATCATGTTTCCTTAGTACATTATGCTTGGTTTAACGTTAACTTCGGCAACCTGG
TTTGATTCCTTGTAACCCAACACTTCTGTCACGTGGTCTTTCTTTGAGGCGTGCAGCAGA
AGTGTACTTAGTTAATAATAAACCATGGCACGATGTATGAATTGTGCGGCGAATGCGTTT
CCCGCGCTCCCTTCACACATGTTGGTTTGATTATTGTAAAAGGCTGCCGCATTGCAATTT
CGTTATTTTTCACATTTCGTTGTGTTTTGGGACATTTCGTTTGTTTTTTCATACTACGTT
TCATCTACTGATATATTTATTATTATTATACCTTTGTCAACGAATGCTTTTTTACCACTG
TACCTGTCTACTGCTTAAAAAGCTTTGTTACTCACAATTGAAAGATAATGCAGGTACAAG
GGATGCATTTGTGATGTAACAATTATCACTATGATGATGATAATAATCATTGTTTTCATA
TTTTGTTTTCCATTATTATATTATTTAATTATTTGCGTTGGTTTTTGTTTAAGCAGCATT
TGCTATTACCCCTGTTGGGTCGAGTGTCTTTGTTTTTATTTTATTACGTTTTTTCATCTA
TTATTATTCTATTATAATTATATTATTATATTGAAATATTTCTTCTGCGTGTTGTTTACG
GATGATATGCTTCTTAAGA

InterProScan

ProSiteProfiles
Znf_CCCH (IPR000571) - T[158-186] 15.892 - T[196-224] 15.76
SMART
Znf_CCCH (IPR000571) - T[158-185] 3.7E-8 - T[196-223] 3.1E-8
SUPERFAMILY
Znf_CCCH_sf (IPR036855) - T[158-189] 1.83E-9 - T[192-224] 7.06E-10
Pfam
Znf_CCCH (IPR000571) - T[159-185] 7.5E-10 - T[197-222] 4.5E-10

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
TISB_HUMAN 73 % 165 1.8E-47
TISD_HUMAN 63.208 % 143 4.24E-38
TTP_HUMAN 68.116 % 108 2.46E-26