Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

Moocul.CG.ELv1_2.S113530.g12933.01.t

Possible name(s)

TTC39A; TTC39B; TTC39C

Gene model

Moocul.CG.ELv1_2.S113530.g12933

Location

S113530 [9,886 / 11,605]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 572

>Moocul.CG.ELv1_2.S113530.g12933.01.p
MAEANGESSTFDENKLASECIKMMLNNNFIEAKETFNEHKDNSTLMNAGSSFRSFLEGLL
TFQDSNLEAAMLELKNTQKMCRGDDAFDTIKAKLNGKKSKQVTKHIPLETLIQNKIVIAD
CYLYTAVIYFLKQDVSGYVKGSWVLRKAWKTYERYYYKLKAMVLITRDANKNIPDLQRTL
SSNGIMKINAKDVVNHDIDVETLNRIYGAVSFGFGLFNLFVSLMPNRLLKVVNLMGFQGD
RNLGLKALENASFSEDMKAPLAMLSLLWYHTVARQFFAIDGENINDGIAEAQIILNRSEH
DFPDSSLVLFFKGRILRCKREIKKAIATFDEAFYKADGLVELQLLCCYENGWCCLLNLRW
SEALNNFIKLKNMSKWSLCYYTYLCALCLGMLGDTVECLKLMNEVPDLMKQKNNQLEIFI
VRKAKYFLKNPIRHDNVILHVFELLYLWRALPNCTDESLHSIISECEAIQDVALTGLKLL
VLGASNKVLGNGSLALGYFKACMDVADNDFDDSHIAPYACFELSEIMLEHSDTFEKGKDL
LLFCKENYSSYDFENRLQMRIYATEQRIAQRK

Nucleotide sequence

Length: 1,719

>Moocul.CG.ELv1_2.S113530.g12933.01.t
ATGGCTGAAGCTAATGGAGAATCATCAACTTTTGACGAAAATAAACTTGCATCAGAATGC
ATTAAAATGATGTTGAACAACAATTTTATTGAAGCAAAGGAAACATTTAACGAGCACAAA
GACAATTCAACGCTGATGAACGCTGGTTCAAGCTTTCGGAGTTTCCTCGAAGGACTTTTA
ACCTTTCAAGATTCGAACCTTGAAGCAGCGATGTTGGAATTAAAAAATACACAAAAAATG
TGTCGAGGTGACGATGCGTTCGACACGATAAAAGCAAAACTTAACGGGAAAAAATCTAAA
CAAGTAACGAAGCACATTCCCTTGGAAACATTGATTCAAAATAAGATTGTTATCGCTGAT
TGCTATTTATATACTGCAGTTATTTATTTTTTAAAACAAGACGTTTCCGGGTACGTCAAA
GGCAGTTGGGTTTTACGGAAAGCGTGGAAGACATATGAACGTTATTACTACAAACTGAAA
GCGATGGTTTTAATCACGCGAGATGCAAACAAGAATATTCCTGATCTTCAACGAACTTTA
TCATCGAATGGCATCATGAAAATTAACGCTAAAGACGTCGTTAATCACGATATCGACGTC
GAAACGTTGAACAGAATTTACGGTGCGGTCAGTTTTGGTTTCGGATTGTTTAATCTGTTT
GTCTCATTGATGCCAAATCGTCTTCTCAAAGTCGTGAATTTGATGGGATTTCAAGGCGAT
AGAAATCTGGGTTTAAAAGCACTAGAAAATGCTTCGTTTAGCGAAGATATGAAAGCTCCT
CTTGCTATGCTCTCACTTTTATGGTACCACACGGTGGCGCGGCAATTCTTTGCTATCGAT
GGTGAAAACATTAACGACGGGATAGCTGAAGCACAAATAATCCTAAATCGAAGCGAACAC
GATTTCCCCGATTCATCTTTGGTTTTATTTTTCAAAGGACGAATTCTTCGTTGCAAACGA
GAAATTAAGAAAGCCATTGCAACTTTTGACGAAGCATTTTATAAAGCTGATGGCCTGGTT
GAGCTGCAGCTGCTTTGTTGCTACGAAAATGGTTGGTGCTGTCTGTTGAATCTGCGGTGG
AGTGAAGCGCTCAATAACTTTATTAAGTTGAAGAATATGTCAAAATGGTCTCTTTGCTAT
TACACATATTTATGTGCCTTATGTCTCGGTATGCTGGGAGACACAGTTGAATGTCTAAAA
CTAATGAACGAAGTTCCGGATCTGATGAAACAGAAAAACAATCAGTTGGAAATTTTTATC
GTCCGAAAAGCGAAATATTTTCTGAAAAATCCGATTCGACATGATAATGTTATTTTGCAT
GTTTTTGAGCTTTTGTATCTTTGGAGAGCGTTGCCAAATTGTACGGACGAATCCTTGCAT
TCCATAATATCCGAATGTGAGGCGATTCAAGATGTTGCTTTGACTGGGCTTAAACTTCTT
GTGCTTGGAGCAAGCAACAAGGTTCTTGGAAACGGCAGTTTGGCTTTGGGATATTTCAAA
GCGTGTATGGATGTCGCGGACAATGATTTTGATGACAGTCACATCGCCCCGTACGCTTGT
TTTGAACTTTCTGAGATTATGCTTGAACATTCGGACACTTTTGAGAAAGGCAAAGACTTG
TTATTATTCTGCAAGGAAAATTATTCAAGCTATGATTTTGAGAATCGTCTCCAAATGCGA
ATTTATGCAACAGAACAAAGAATTGCACAAAGAAAATGA

InterProScan

PANTHER	Iml2/TPR_39 (IPR019412) - T[10-570] 1.3E-119
Pfam	Iml2/TPR_39 (IPR019412) - T[20-466] 5.2E-97
SUPERFAMILY	TPR-like_helical_dom_sf (IPR011990) - T[289-425] 7.59E-10

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
TT39C_HUMAN	42.883 %	452	9.43E-154
TT39B_HUMAN	23.158 %	135	1.89E-33
TT39A_HUMAN	25.427 %	123	1.04E-29