Login
Help

TRANSCRIPT CARD

Submit your Data

  1. Molecular Tool 'Tbx6b mRNA'
  2. Clone 'cima84180'
  3. Molecular Tool 'Ci-nodal mRNA'
  4. Molecular Tool 'Cirobu_Eph1 MO (Fiuza 2020)'
  5. Transcript 'Moocul.CG.ELv1_2.S10...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocul.CG.ELv1_2.S104288.g09816.01.t

Possible name(s)

CHST11; CHST12; CHST13

Location

S104288 [13,145 / 15,854]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 323

>Moocul.CG.ELv1_2.S104288.g09816.01.p
MKLMNYYHLFYVLCIITRMGSKIYSVTDALPLHILSEDEPYRSRMMGIYRRCGDMPPDFH
KNAVDLSRFIFDDKHKVLMCVVPKNACSTLKRVMLFLNGMTRDIDAVPKKILDLSLGHIK
TFDSLKNVREIQHKLNTYTKFMVSRHPFERLVSAFKDKFQSSPLSKKYGGKAIQIAKLML
KRRMLHKDENYHREINELRMSAKFGNISFNTFLWFLQTHANRRNNFDLHWREQTLLCNPC
AVDYDFIIDFNSLSEDGEKLLNYLQRNDPNDELKVHLPPPYQRPVDDSAAKSLFETIEPE
IISGIENIYKNDFYLFNYNPVTF

Nucleotide sequence

Length: 1,956

>Moocul.CG.ELv1_2.S104288.g09816.01.t
ACTTGGGATTTAGTAATTGGATCTCTGTCCCCAATGGCAAATGATATAAATGTAAAAAAA
GATATAGGACAATAAAAAAAATCGCGTATAAATAAATATATAAACGCGCAAATTGAGATG
CAGATAGAAAGATTATTACGTCATAATATATGTATGTCTTCTGACATAAGCGACAAATCG
CCTTATAATGAGGTTCGCCGTAATTTCGGCCGCTATGTTACGCTGTTGAGTCAATCGCTC
GAAATTGTGGGTGAAATTGCGGCGAATCGCGAACCTCATTCCGTTGTTCTGACAAAAGAG
AACGAACATGAAGCTTATGAATTATTATCACTTGTTTTATGTGTTATGCATAATAACTCG
AATGGGAAGTAAAATATATTCGGTTACAGATGCTCTCCCTCTTCATATACTTTCTGAAGA
TGAACCATATAGGAGTAGAATGATGGGCATATACCGAAGATGCGGTGACATGCCACCAGA
TTTCCACAAAAACGCTGTCGATTTGTCGCGGTTTATTTTCGATGATAAACACAAAGTATT
GATGTGTGTCGTGCCGAAGAACGCTTGTTCAACTTTAAAACGTGTAATGTTGTTCCTGAA
TGGGATGACAAGGGATATAGATGCAGTGCCTAAAAAAATATTGGATTTGTCTCTCGGGCA
CATAAAAACATTTGACAGTTTAAAAAATGTCAGAGAAATCCAACACAAATTGAACACGTA
CACAAAATTTATGGTATCTCGCCATCCCTTTGAAAGACTGGTTTCAGCTTTCAAAGATAA
ATTTCAAAGCTCACCCCTTTCTAAAAAATATGGCGGTAAAGCTATACAAATAGCAAAATT
GATGTTGAAACGAAGAATGCTGCACAAGGACGAGAACTATCACCGCGAAATTAATGAATT
AAGAATGTCTGCGAAATTTGGGAATATTTCATTTAATACTTTCTTATGGTTTCTACAAAC
GCATGCCAATAGAAGAAACAATTTCGATCTTCATTGGAGAGAACAAACACTATTATGCAA
TCCATGTGCGGTTGATTATGATTTTATAATTGATTTTAATTCACTTTCTGAGGACGGTGA
AAAATTATTAAATTATTTACAACGAAATGATCCAAACGATGAATTAAAAGTTCATCTCCC
ACCGCCTTACCAGCGCCCCGTGGACGATAGTGCCGCCAAATCTTTGTTTGAAACTATTGA
ACCGGAAATTATATCGGGCATCGAAAATATTTATAAGAATGATTTTTATTTATTTAATTA
CAATCCTGTGACATTCTAAGCAACACCTCACCCACCATTCCGTTCTTTTGTTTTTATTCT
TCTATTTCATTTGTTTTCAGTATAAAACCACTTGAGTCAAGATGTCGTAAATTTTAAGAT
ATGTTATAATTGTTTATGGCATAGCACACCCTTTGTTTTGTAAGTTAACGCATCCATGAA
TCTTCATTTTCCTGTCTCTGCATTCACAAGTGATAGTCACCTTGTGAATTAGTTAGCTTA
TCAATGGACGTAGACGCAGCCATGGGCTAGGCAGCGGGCACGGAATAATAGTTGGATATT
ATAAGTTAACGCAGCGCAAACGCAAGCTTTGTATTGTATCCAATAGAAACATAATGCACA
GTAAATTTTGAGGGTTGATGTAACATAATATGGCATATGCTTGAAAAAACTCATGGTAAA
TATGGACTGTCTTGTGCTAACAAAGTGATGGTGTCAGAAACGAACTGTGGTAAATATGGA
CTGTAGCAAATATGGACTGGCTTGTGCCAAAGAATATAGAACGCTTTGCTTGTGCTAACA
AGGTGATGATGTGACAAATTGACTGACTTCCGCGGACAAGTTAATTTGACAACTGGATTG
CCGATTGCGGAACATGTGTACTGGCTTGTGCGAATCAAGTAATGTGGAAAATGTGGGCTG
TGACAAATATAGGCTGTAGCTTGTGAGGCTAGCTTA

InterProScan

PANTHER
Carb_sulfotrans_8-10 (IPR018011) - T[65-319] 6.1E-56
Pfam
Sulfotransferase (IPR005331) - T[68-319] 5.0E-40

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
CHSTB_HUMAN 30.682 % 119 7.94E-31
CHSTD_HUMAN 31.599 % 116 4.24E-30
CHSTC_HUMAN 30.996 % 115 2.9E-29