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  5. Transcript 'Moocul.CG.ELv1_2.S10...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocul.CG.ELv1_2.S100033.g08830.01.t

Possible name(s)

VANGL1; VANGL2

Gene model

Moocul.CG.ELv1_2.S100033.g08830

Location

S100033 [29,008 / 38,765]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 530

>Moocul.CG.ELv1_2.S100033.g08830.01.p
MEQDNESNYSDFSLATNRSEQHRHGGRRSHRSGGGSRRHKSRGEKTVTIRTPTMDNNGSR
HDNRTGDSEDDNWGETNTFISGTTDVTNFSNESLMKFTKDVEASIGFRDFGFVATVILAC
LSYLTPIAFVVLPKFLWPDNLNGCETSCQGLLISMSFKLLILLIGSWALFFRRPRANMPR
IFLFRSLVMGLVFIITMTYWLFYGVKILDLKESNYKNIVEYAETLTNCLLFIHYLAVVLL
EVKQLQTSFTVEVIRTTDGERRFYNLGELSIQRTAVWVLEQYYRDFPVYNPALLRIPTRS
ARMKQLTAGNFKVYDVDGPATDNQGKSRAMMAAVARRRDAGHNERYYEEAEYERRIRKRR
ARLVAATEDAFMHIRRANEDDTAGKKGKSNNETMSQEEAAQAIFPALARSMQKYLRTTRQ
HQHYQIDDILKHLSFCIKHDMTPKAFLERYLHPGPNITYDQHGRESTMWELVSDEPLVHT
IKDNTVIRLSQPDYSLVITIRKSPRIRLREEYIEPSSHRFVLRMQSETSV

Nucleotide sequence

Length: 4,189

>Moocul.CG.ELv1_2.S100033.g08830.01.t
AAATATTTTTCAAATGTAATTTATGCTTTTAGTTTTGTATTCAATACTCACCAGAACAGA
GTAGCCTAAACCCTAAAATAACTATTTCTAGATAATATGTGAGTTAACAAAATAAAAAAA
TGTCATTGGTATTGTCGTATAGCTTAATCATTCTCACCCACGTTCGTTATTGTCTGTTTT
GACGCTCCAGTAGCAATAAATGACCCACAAAGAAATGTAGCCATGATTTTGTTATATCGA
AAATACGTGATAGCAGTCAGAGTAGTTACATTAAGCTTGGCTATTATAGGTTAATGTGAC
AGTGTCAGCTTATATTTCAGCTTGTTGTAGATAAAGGTGTTATATGTATATAGGGTGGGT
CTATTTTAACAAAAGTATTATATATTTTCTTTCTCTATTTGGTAAATAATGCATGCGGGT
AACAGCGCTATGTATATTTAATGAAGCCCACGCGTTTTACTTCGCTGTGTAGTGTCAAAA
TTTGTTTATCTCAACTCAGATACAAAATATTATGCGGCCGTTTAAATTAAGCTTGAAAAG
TATAATATTTTTGTTCTGGTTACAGCGAATTTATTCCAGTATTTTTAGCGCCTATTGAGT
TATTGACCCATTGTTCCTTTGTTTTGATTGTAGTAACGTCACAGAGAGGGTTGGCGAAAA
ACTGCACCAGAAATTATTAAGCCAAAAAAACTAGTGCAGCGTTGCAGTGTTAAACTATTG
CTATGTATTCTGTATTGGCGTCATAGAATGTTGTGTTTCGGCTGGCAGTAGTCCGTGAAA
ATATATTACCAGCAATAAAATGGTTGAGGTATTTTTAATGTTAGTAATTGAAAATTGCGT
TATCAAAATGTGGGGTGGTGAATAGACTTCAATATTAGTATGGCCAATTAAATCAATTAT
GAAACGAGTTACTAAACAATAGATGAAGACCTGAAAATTGCAAAAGAATGGAAGGCGTGC
GATTATTAACCCAATTCTAATCTAAAAAGGAAGAGTTTATTTGCACGAACGTCTGGATTA
TTGAAGGGAAAGGGAATCATCCTGATTTGTGTTTAGTTGGAAGTTAATCAACGCTCAAGT
TAACAGGGATTTATAATACTTGAAACAGAACTAGTAGCACTTAAAACTGAACGCTCACAC
GATTTTAAATACAGAATAGTATCACGTTGCTAACCAAATAGTCGTTTATTCGTTTCTCTA
GAGGAATGAGTAAACCTATATTGTGTGATCTGTTGTATTATTCTAAAGTATAATGATGTT
TTTAACCTTATTTGTTTAGTATTTAGTGCCCTATCAGTATATTACAAGAGTTTTGTTGTA
TTGGCAGTAAACATCTTCAGTGTTTTAATTAATTTGGAAAAAACAACGAGCAATTATTTT
CTTATTTTTATAAAGGCTGAGATTTCGGCTCATGATTCCTTAGCGAGACTAAATAAATAA
ACCAAGTAACATAGCAGATATATTTTGCTCCAGGCAATTATGGTGTGGTGGTCGTTAAAT
TTACGAGAGGCAAGCTTTAAAATTATTTTTGTTACATTATGGAGTAAATATGTTGATCTT
AGTGTGAATATTGCCAAATGGAAAGTATTTTTCCAATTTGAAAACAGAAATGTAATATCA
GTCTTTTATCAGATGTAGAGTTTAAATTCAACTGACAATTTATTACTTATCGTCTTCTTC
AGATATAAAATGTGTATTAGTGTTCTATTACGTTACACATTAACCTTTATCAGCCAGTTT
GAAGGAGTTAGTAAATTTGTTTTAGAAAGAATACATGTGTGTAATGTTAAATGTATAGAG
TCGCTAGATCTTGTAATTGCTTTATCAATCAAACTTTAGGCTACTTAAAGTAAACACAAG
TTGTTATAGATGGGATAGGCTATTATTCGTATCAATGCCAGTTATTTATGAGTTTGATAG
TATGCGTTTTTGTTTGTGCTGTAATAGCAGTTAATGTTGCGTCTAATAGCTTTTCTTTGC
CAGATACATTAAATCGAAAGATGCTCATAAGTGATTAACCTTCAGTATAAGACAGACGAT
ATTCGTTAATACGTTTCCTTTGTACGAATATCTCTCAGCTGCCAGGATTATCGAGTCTAC
ATCGACCGCTATTGTCTAGAAACTGCAGGATTATATTATTCCCTTACAAGAATGGAGCAA
GATAACGAATCGAATTACTCGGACTTCTCACTGGCAACGAATAGATCTGAACAACACCGA
CATGGGGGTCGAAGGAGCCACAGATCCGGCGGAGGATCACGCAGACACAAAAGTCGAGGT
GAAAAAACCGTGACGATCCGTACACCGACCATGGATAACAATGGCAGCAGGCATGACAAT
CGGACCGGCGACAGTGAGGATGACAACTGGGGTGAAACCAACACGTTTATATCTGGTACA
ACTGATGTCACCAACTTCAGCAATGAATCTTTAATGAAATTTACAAAGGATGTTGAAGCC
TCGATTGGTTTTAGGGACTTTGGATTTGTAGCCACGGTTATTCTGGCTTGTCTTTCATAC
CTTACCCCAATTGCATTTGTTGTACTTCCAAAATTTCTATGGCCAGATAACCTCAACGGT
TGCGAGACGTCATGTCAGGGGTTACTGATAAGCATGTCTTTCAAACTTTTAATTTTATTA
ATCGGTTCTTGGGCGTTGTTTTTCCGAAGACCAAGAGCCAATATGCCTCGCATATTTTTA
TTTAGGTCGTTAGTCATGGGTTTGGTGTTTATCATAACCATGACATACTGGTTATTTTAT
GGCGTGAAAATTTTGGATCTGAAAGAAAGCAACTATAAGAACATTGTCGAGTATGCGGAA
ACATTAACAAACTGTTTGTTATTTATTCATTATTTGGCTGTGGTTTTACTCGAAGTGAAA
CAATTACAAACTTCCTTCACGGTAGAAGTTATTCGAACTACCGACGGTGAAAGAAGATTT
TACAACCTTGGGGAGTTGAGCATCCAACGAACTGCCGTTTGGGTTTTGGAACAGTATTAC
AGAGATTTCCCTGTTTACAATCCAGCACTTCTACGAATTCCAACTCGTAGCGCTCGCATG
AAGCAACTCACAGCTGGAAATTTTAAAGTCTATGATGTTGATGGTCCAGCAACCGACAAT
CAAGGCAAAAGTCGTGCCATGATGGCAGCAGTTGCAAGAAGACGTGATGCCGGTCATAAT
GAACGTTACTATGAAGAAGCAGAATATGAAAGAAGAATTCGAAAACGGCGAGCAAGGTTG
GTGGCTGCCACTGAAGACGCATTCATGCATATCAGAAGAGCTAACGAAGATGACACTGCG
GGTAAAAAAGGAAAATCAAATAATGAAACTATGAGCCAAGAAGAAGCTGCCCAGGCGATT
TTCCCTGCATTGGCACGTTCCATGCAGAAATACCTTCGAACGACTCGACAACATCAACAT
TACCAAATAGATGACATTCTCAAACATTTGTCATTTTGTATCAAACACGATATGACTCCG
AAAGCATTTCTCGAAAGATACCTCCATCCTGGACCAAATATCACATATGATCAGCATGGA
CGGGAAAGCACTATGTGGGAGTTGGTTAGTGATGAACCCTTAGTGCACACAATAAAAGAT
AACACCGTGATAAGGTTAAGTCAGCCTGATTACTCACTTGTAATAACAATAAGAAAATCT
CCGCGCATCCGTTTGCGTGAAGAATACATCGAACCATCATCCCATAGATTTGTTTTAAGA
ATGCAAAGCGAAACATCTGTTTAGAAAACAAGTTCCCTGTATTACAACAAAAGATGAAAG
GCCTACAATGTATTTTGCACAAAAGAGGTGGTTGCAAAATGCTTGTTTCACTATTCCGCC
TTTGCACGATGAATATGAAATGGACAAACAGCACAAAGAATGTTACAGATTCGAAACTGT
GACTAACTTTTGTGCGTAGATTTATTTTATTTTTCAATGCATTGTGATGAACTTTTTATC
TATTACCAAGTTTGTTTGAAAGAAATCATAAAAAGGGCCACCGGATAATCAATTTCTTTT
CGAGCATATCTGGCACATTGTTGTGCAAAAAATTTGGAAATTGTAATATATTTTTACATT
TTTTAATTATTTCTTTTATTTGAACTTTTTACAAATTTCATGAAATTGTGTAAAGAGTTC
TAGTGCTTTATGGACCAACTAATAAAGTTTTTTATTCTTAAAATTTGCG

InterProScan

PIRSF
VANGL (IPR009539) - T[3-530] 5.1E-200
PANTHER
VANGL (IPR009539) - T[4-530] 1.7E-209
Pfam
VANGL (IPR009539) - T[27-530] 9.6E-218

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
VANG1_HUMAN 53.242 % 518 0
VANG2_HUMAN 51.589 % 436 7.98E-149