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  1. Region 'REG00000500' > 
  2. Transcript 'Mooccu.CG.ELv1_2.S55...'

Transcript Model

Transcript Id

Mooccu.CG.ELv1_2.S554688.g33449.03.t

Possible name(s)

KCNQ1; KCNQ3; KCNQ4

Gene model

Mooccu.CG.ELv1_2.S554688.g33449

Location

S554688 [19,976 / 24,547]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 296

>Mooccu.CG.ELv1_2.S554688.g33449.03.p
MLHMDRQAGTWRLLGSVVYMHRQELITTLYIGFLALIFSSYFVYLAEKPSNVEVNITITN
TTKLNRTDSDFHSFADALWWGVITVTTIGYGDFVPKTWLGKLIASGFSIFAISFFALPAG
ILGSGFALKVQLKQRQKQMNRQIPAAARVIQAGWRCHCVHKNINSTATWKIYKLPKRMNQ
IEDEMMKNHKNNTILSDAPNASAMIKEGTSEGRKTRKSSMNSWKEVIDEVTRASKFKSKS
KYKYPAAYVNVVRCTRILIFQLRKRQFQVTIIKLNFARLYRLFTHLIRQAENRTM*

Nucleotide sequence

Length: 2,547

>Mooccu.CG.ELv1_2.S554688.g33449.03.t
ATTGTCGTTGTGAGCTTCTTTGGTATTGAGTATCTTGTACGGTTGTGGTCAGCAGGATGT
GTCAGCAAGTTCAAAGGATTCAGAGGACGAATTCGATTTGCACGAAAACCAATTTGTTTA
ATAGGTACATCAAGAACCAACATGATCAAACACGATATTCACGTTGTTATGTTTAGATTT
GTTCGTGGTTGTGGCCTCAACAATCGTTCTTCTGGTCGGAAGAAACGGAAATGTTTTTGC
AACATCCGCGATAAGGTGGTTCAGTTATAATTACCATAGAAATCTGATTTCTATGTGGTA
TATAGGTAATGACGTCATATAATATTTAATTCTTTTGTTTTCAGAGGAATTCGATTTCTT
CAAATTCTTCGGATGCTTCACATGGATCGACAAGCTGGCACGTGGCGTTTACTGGGCAGT
GTTGTGTACATGCATCGACAGGAGCTCATCACGACACTTTACATTGGTTTTCTGGCGTTG
ATCTTCTCCTCTTACTTTGTGTATTTGGCCGAAAAACCATCCAATGTTGAAGTTAACATC
ACAATCACAAACACAACCAAATTAAATCGAACGGATTCGGATTTTCATAGTTTTGCAGAT
GCACTTTGGTGGGGAGTGATCACAGTGACAACGATTGGCTATGGAGATTTCGTCCCAAAG
ACGTGGCTCGGCAAACTAATTGCATCTGGATTTTCTATTTTTGCGATTTCATTCTTTGCA
TTACCAGCTGGTATTCTTGGTTCAGGATTTGCTCTTAAAGTGCAGTTGAAGCAACGACAG
AAACAAATGAATCGACAAATACCTGCAGCAGCTCGTGTCATTCAGGCTGGGTGGAGGTGC
CATTGTGTCCACAAGAACATAAACAGCACTGCCACATGGAAAATATACAAATTGCCAAAA
CGTATGAATCAAATAGAAGATGAAATGATGAAAAATCACAAGAACAACACAATATTGAGT
GATGCTCCAAATGCATCCGCTATGATCAAAGAGGGAACTTCCGAAGGAAGGAAAACGCGT
AAAAGTTCAATGAACAGTTGGAAGGAAGTAATCGATGAAGTTACTCGAGCAAGCAAATTT
AAATCAAAATCTAAATACAAATATCCAGCGGCATACGTCAACGTGGTCCGTTGCACCAGG
ATATTAATATTTCAATTGAGAAAACGGCAGTTTCAGGTAACTATTATTAAATTAAATTTC
GCGCGGCTTTACCGCCTTTTTACACACTTGATTAGGCAAGCAGAAAACCGTACGATGTGA
ATGACGTCATAACACAATTTACACACGGTCACATTAACATGACAGTGCGAATCAAGGAAA
TGCAGAGACGATTGGATCAGACACTCGGAAAACCTGCCACTTTTTACGACGATGGAAATG
GAAGCAAACTGGCAACAACAGGCGAAAGGCTTCGAAGTTTAGAAGCGAAAGTGGATAGCA
TCGATTTGAAACTTGACGAAATATTAACACAAATTTTGCTTTTAAAACGCGAGAATGTTG
ATCGATAATTATTACGAAACAATCCATTAAGAATATTGTTATTGTTCCTTTAACTGTTCG
TCAACAATGTACTATTAATATGACATCTACTGAACCTAATAATATGCACTTTAAATATTA
GAGCTGAATTTTAAAAACTTTATTTTAAAGCAATGCTATAAAATGCCATTTATTTTGTAT
ATATAAATATTTATGCATAAAACAATAATATAAAAAAAAAATTAAAAGTTAAATAAGAAT
AGAAGAAGGCATAATATATAAAGTTAATCATATTCTAAAAGAACAATTCATTTTCCTTTA
TTACTACTTCTCAGACATGCTTGTGGAATATTTAATTTCTTTCTTAATTTTTCAGCTCTT
CCATAACACGAGAGGGCGGAATGGTGCTCTTTTAAACTTTCCCAACATGTTCCGAGATTG
TTCAATACTTCCACCACGTGGAAGCCATAGTCCTTTTCATTCTCGTGATGGGAGTACAGG
TTTTCAGCCATCTTCAACGCCTTTTCCAAAACTGTGATAGCTCTGTGGTAGTTTTCATCG
CCAGCCCATGCCATAGCAAGCAGCATAAGTGATGAAAGGGTTAATTCGTTGTCATGTTCT
TTAAAGCATATCTTTCTCATATGCAGTGATATTTCGAAACATATAACAGCTTTAAAATAC
AGTTTTTCGTCAATGCAGATTTTGCCAAGTCTGTCAATGGCTTCAGCACTATCAGTTCGT
GGGTTGTTTAATTGCATTTGAGCTTCCTTCATTGCGTCATTAAATGCTTCTTCGTGTACG
TAATTTAGTCTTTCCAATACACAGATAGCAGCTCTCTCCAGCTTTTCAATCAAAATTTTG
TTGTTGTAAAGATTCACGCTTAAATCTGGGATTCTCTTCTTGGACTTGTAATAAACCCAT
CTTTTCCAGTTCGTGGTGGTTTTGTCGGAGTTCAACTGATCTCCACTTCCGGTGATAAGA
TTTCCAGTTGACTTGACGACAACACTTTGAGGAATTGCATACTTTGCTTTTAACTTTTCG
ACTGGAAGCATATTTACAAACAATATT

InterProScan

PANTHER
VG_K_chnl (IPR028325) - T[1-41] 2.3E-116 - T[108-366] 2.3E-116
Pfam
Ion_trans_dom (IPR005821) - T[2-251] 1.4E-12
PRINTS
K_chnl_volt-dep_KCNQ (IPR003937) - T[6-25] 7.7E-22 - T[26-45] 7.7E-22 - T[135-154] 7.7E-22

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
KCNQ1_HUMAN 68.539 % 242 3.48E-75
KCNQ4_HUMAN 56.069 % 195 1.75E-57
KCNQ5_HUMAN 55.233 % 197 3.57E-57