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Transcript Model
Transcript Id
Mooccu.CG.ELv1_2.S458657.g22783.01.t
Possible name(s)
MYD88; TLR4
Gene model
Location
S458657 [5,151 / 8,902]
Amino acid sequence
Length: 395
>Mooccu.CG.ELv1_2.S458657.g22783.01.p
MFRRNQRHPTESSDASEVVRAECDSTTRDNIEDELFKLTDVSSTSSRSPPSYETSCNVAG
YSPAQPVTPMPMGNRPPQPLLPMVQREPPYFDMPLRVLSTATLIELSNRMDVEEPLIKHW
QFFASEVGLRSFEVSKIKQAMANQMKAVIEMWISTADPTIRKFYDILVNELGRVDVWTDV
KGMIEKDSQRHIKREEYGWDKIFHPNPQTTGTGPTSLKDEEENAMVEIKYEDGNESSLHV
APGVRSGLEQIKNEKVELQESYDVFLIYDMADGDFVKELLNRLKNEDFKVCIPQRDLPGG
STEYDTNLHFMFDRSRKVVIVKSDELFASNLWKWHMNMLIGSDPVAKQRKIIPVKYKDIS
TQNILEHLCCCDRTTVLEEEWFWTKLFNSIKHGS*
Nucleotide sequence
Length: 2,172
>Mooccu.CG.ELv1_2.S458657.g22783.01.t
GGATATCATTAATTAAAAGTAATAGTATCAAAAAAACAGAATCAAACTAGACAATTGGTT
TAAAgtttgtacttttcaagttttgttttctgaaaatcgccgatgtttcgtcgtaatcaa
agacatccaactgaatcttctgatgccagcgaagttgtaagagcagaatgtgacagcaca
acaagagacaatattgAAGATGAGTTGTTCAAACTAACTGATGTGTCATCCACTTCTTCC
CGAAGTCCGCCGTCTTATGAAACATCATGCAATGTTGCAGGCTATAGTCCTGCACAGCCC
GTCACGCCTATGCCTATGGGCAATCGCCCACCACAACCTCTCTTGCCAATGGTCCAACGA
GAACCACCCTACTTCGACATGCCTCTACGAGTATTGAGCACAGCCACTCTTATCGAGTTA
TCCAACAGAATGGATGTTGAAGAACCGTTAATTAAACACTGGCAGTTTTTTGCATCAGAA
GTTGGTCTTCGCAGTTTTGAGGTTTCAAAGATCAAGCAAGCGATGGCAAACCAAATGAAG
GCTGTTATCGAGATGTGGATTAGCACAGCCGATCCAACAATAAGAAAGTTTTATGATATT
TTAGTTAATGAACTTGGGAGGGTAGACGTTTGGACCGATGTAAAAGGAATGATTGAAAAA
GACTCGCAACGCCATATTAAAAGAGAAGAATATGGTTGGGATAAAATATTTCATCCAAAT
CCCCAAACGACAGGGACAGGTCCAACATCATTGAAGGATGAGGAAGAAAATGCAATGGTT
GAAATTAAATATGAAGACGGAAACGAATCTTCACTGCATGTTGCTCCTGGTGTTCGTTCC
GGCCTCGAACAAATCAAAAACGAAAAAGTTGAATTGCAAGAATCGTATGACGTGTTTCTC
ATATATGACATGGCTGATGGAGATTTTGTCAAGGAATTGCTTAATCGGTTGAAAAATGAG
GAttttaaaGTGTGCATTCCTCAGAGAGATCTTCCAGGTGGCAGCACAGAATACGACACA
AATCTACATTTTATGTTTGACAGATCTCGAAAAGTTGTAATTGTCAAATCTGATGAACTG
TTTGCAAGTAATCTATGGAAGTGGCATATGAACATGCTTATTGGGAGTGACCCAGTGGCC
AAACAGCGTAAAATTATTCCGGTTAAATATAAAGATATTTCGACGCAAAACATTCTGGAA
CATCTTTGCTGTTGTGACAGAACTACGGTGTTGGAGGAAGAATGGTTTTGGACTAAACTT
TTTAACAGTATTAAGCATGGTTCTTAATTATTAATTTGTAAATTAATCAAATTAATTAAC
AAAGTATCAGCAAATTCAACAATGATGAACATATTATAATGTTCTATTATTTTCGTTTAA
ATGTATTGAACTCAACGATCCAGTGGCTTGCAGTTCCCTTGCTTTTTGTCTTCTTTTGTC
TGCCTCTACTAAATATTGCAAAAACTTTTATTGTATTTGTATGTATATACCCAATAGCAA
TTATACTGTACATGTAGCCAATCAAGTCAGCACTTATTTTTTTTTTATATTGCTTTTCAA
ATTATGGTGTGGTATACCCTAGACTTAAGCTAGATTCCCACTGAGCGATGATTTTATGCG
ACGCGAGGCAGAAGATTAGTAAATCACGATCGATTTAGTGGAATTTGTTTAAACTTTTTC
GCGATTCGCTAATTGTGCACAGTGGGAATCCACCTTTGCGGTTATACCACCTAGAAGTAT
AACACATTATTACTGTTGTTTTCTGTTTTTATGTCGCTTTTCTTCTTATGCATTTTATTG
GATTCTTATACTTTTAATCCAATTTTAAAATTTTTATTCATTTTACAATTGCATCTATAT
ATTATGAGTGTATATCATTCTTGTATGTAAATTTCAAAATACTTGTAAGTTTCCATATGC
TCTCAATCTCACCTTTGTATTATTTTAGTCAGGTAATTAAAGTTTTCCCACTCCGGTATT
TTTTCTCGGGTTTTATGAGTTCCGTTTTTTGTGTAACTTAATTCTGATATGCGGTGGTAG
CCGCCAGAAGACAACACGTCCCTTGCTGCCACCATGTGGAGTTTTTTTTATTATAATTTT
ATCTCTTCTGCATTATTGTGGTTATTTTAATGGATGCAATAAACGTAACTATCTAGTACC
GGTATCTATCTG
| SUPERFAMILY |
DEATH-like_dom_sf (IPR011029) - T[116-227] 5.65E-6 |
| ProSiteProfiles |
Death_domain (IPR000488) - T[154-201] 8.969 |
| SUPERFAMILY |
Toll_tir_struct_dom_sf (IPR035897) - T[292-425] 4.05E-19 |
| ProSiteProfiles |
TIR_dom (IPR000157) - T[294-391] 12.988 |
| Gene3D |
Toll_tir_struct_dom_sf (IPR035897) - T[295-425] 5.1E-21 |
| Pfam |
TIR_dom (IPR000157) - T[298-402] 2.1E-6 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| MYD88_HUMAN | 22.848 % | 98.2 | 3.73E-23 |