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  1. Transcript 'Mooccu.CG.ELv1_2.S31...'

Transcript Model

Transcript Id

Mooccu.CG.ELv1_2.S314546.g13049.01.t

Possible name(s)

SLCO2A1; SLCO4C1; SLCO5A1

Location

S314546 [6,796 / 10,728]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 295

>Mooccu.CG.ELv1_2.S314546.g13049.01.p
MFLPKLIKTYFNLSGQEAAMYTGLATIPATIFGNLSSGIILKKCKMSVQRMLKLSFILCV
LGLVLYPPLFFMSCTDGIETDSSVVNASVTNLNISTECVTSCNCMEEFSPVCGDDGVTYT
SACAAGCQQYHRQNMTFVECLCVSSETKTAFGNTCPTAPCMQLYIFVALLFAANFVDFMS
YSPMIICSMRVVERCDRPLTLGIQTLVIRLLGSVPSPIIFGLLLDSACLMWQSNGDDGSC
WFYDKSILSRNLILFFVPVKLASVIFSFLALHFHNANALHEEEEVGRFMEDEKL*

Nucleotide sequence

Length: 2,033

>Mooccu.CG.ELv1_2.S314546.g13049.01.t
GGAAATTCTACTTCCTATTATAAGTTAACAACTTGTAACACGTTATAATCTACAAGTTAT
TACAAGATAACTAACTTTAGTAATACCATCGTAATAGATAGCATGTTGTATTAAGTTTTA
GCGAATATTTATTTGAAGATGACGATGCGTGGATTGATTTCTCCCATTGGATATGTTGTA
TATTTGTCTTTTGCCAACTTCTCATTAACATTCATTTTTGGTGGTGTGTTAAGTGTGTTC
ATTCCCTCAATCGAGCGGCGTTTTCAAGTATCCAGTAAAGAATCTGGGTCGATTGTCTCT
CTGTACGACATAGGAACATGTACTATGTGCCTTGTGCTTCCCTACCTTCTTAGAAACCTC
AACGTACCAAAAACACTTGCAGTAACATCACTTGGTATATCAATAAGTTGTGTCTTGTTT
GCACTGCCACATTTTATCACCGGATCTTATGAGTATTCGAACACCACGACAGATAATTTT
TGCCAACTGCAACCGCGAAACATTTCTGAGATTGACTTACCAGTGACACCACCCGGCAAA
ATAAATATAATTTTAATGATGTTGGCTCCAGTTATAGTAGGTATTGCAAACGTACCTTTC
ACCACAGTTGGACTCACATACATTGAAGACAATTTCAATAAACATACAGCATCACTCTGT
AATGCCATCGTCAATACCATGTACATAATGGGTATTAGTATGGGGTATGTGATTGGGGGT
CAATTTGTATCTTTATACGTTGATTTTGATACAGTCAATAATGTTGAACTCACAGTATAC
GATCCTCGATGGGTTGGAGCCTGGTGGATTCTTCCAATATCAACACCGTTATTCGTTACA
CTTTTCTGTACCATCCCGCTTGCCTTCTTTCCGAGAAGTTTTCGGCATAAGGACTCCAAA
AAACAAGAACCTATAAAACGTTCCAGAAAACGATCATATATTCTTGATGTTTGGCACATT
TTACAAAATAAAGTCGTGGTAACTTTGATGATCACAGAACGTTGGACATATTTTATTTAA
CCGGCATCGGAATGTTTCTTCCCAAACTCATTAAAACTTATTTTAACCTATCCGGACAGG
AGGCTGCAATGTATACAGGTTTAGCAACGATTCCTGCTACAATATTCGGAAATCTATCAT
CAGGTATAATCCTGAAGAAGTGCAAAATGAGTGTCCAACGAATGCTGAAGCTGTCTTTCA
TTCTATGTGTCCTTGGACTTGTGTTATACCCTCCATTATTCTTCATGAGCTGCACTGATG
GTATTGAAACGGACTCAAGTGTAGTAAACGCATCTGTGACAAATCTCAACATTTCTACTG
AATGTGTAACTTCGTGTAACTGCATGGAAGAGTTTTCACCAGTCTGTGGAGATGATGGTG
TGACATACACATCTGCATGTGCTGCAGGATGCCAACAATACCATCGACAAAATATGACGT
TTGTCGAATGTCTTTGCGTCTCATCTGAAACAAAAACAGCGTTTGGGAACACATGTCCTA
CCGCACCATGCATGCAACTCTACATCTTTGTAGCTCTTCTCTTTGCCGCTAACTTTGTAG
ACTTCATGTCGTACTCACCAATGATCATATGTAGCATGCGAGTTGTTGAACGATGCGATC
GCCCACTGACTCTCGGCATACAAACTCTTGTTATCAGGCTGCTTGGTTCCGTTCCAAGTC
CAATCATTTTCGGACTTTTACTCGACAGCGCATGTCTCATGTGGCAGAGTAATGGAGATG
ACGGATCATGTTGGTTCTACGACAAATCTATTTTATCACGAAATCTCATCCTCTTCTTCG
TTCCTGTGAAGCTTGCAAGTGTCATCTTTAGTTTCCTGGCTTTGCATTTCCACAACGCAA
ACGCACTGCATGAAGAAGAAGAGGTCGGGCGCTTTATGGAAGACGAAAAGTTGTGACTTT
GCTATTCTATCATAATACAGTCATAATTTTGTAAATATTTGTGAGCTTTGGCTAAGGATT
AATTAATTTCTCCGGAATACTAGTGTCATTATTAAGCATGATCCGCATCTCTG

InterProScan

PANTHER
OATP (IPR004156) - T[52-337] 5.5E-58
Pfam
OATP (IPR004156) - T[58-308] 2.5E-58
SUPERFAMILY
MFS_trans_sf (IPR036259) - T[58-152] 2.75E-19 - T[186-340] 2.75E-19
CDD
MFS_dom (IPR020846) - T[59-294] 1.46274E-9

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
SO4C1_HUMAN 30.719 % 135 1.39E-35
SO5A1_HUMAN 28.659 % 140 2.45E-37
SO2A1_HUMAN 30.233 % 134 1.78E-35