Login
Help

TRANSCRIPT CARD

Submit your Data

  1. Transcript 'Phfumi.CG.MTP2014.S6...'

Transcript Model

Transcript Id

Phfumi.CG.MTP2014.S675.g02532.02.t

Possible name(s)

EFR3A; EFR3B

Location

S675 [8,977 / 11,338]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 786

>Phfumi.CG.MTP2014.S675.g02532.02.p
MASCSCCPAFRPRYKRLVDNIFPSVQSEGLVRSEMEKLTYYAVSAPEKLDRIGDYLARRL
TRDIARKRDKSVFVAMEALNQLLLACHAQQINLFVESFLKMVATLLESDNYDFQALGTNS
FEKFSKIEEDTASYHRRYDFFVSKFSAMCHSNEDNLAARRKIQLHGVHGLRGVIRKTVSD
ELQVNIWEKQHMDKIIPSLLYSMQNSQEQNPADTDMVPASDVEQPSTLAEESLRELLSRA
AFSNVPAAIYPALAHMDNHELWAPDNSFAIKSFKIIMYSIQGQYSHVIVKLLLDHIDTHN
SNDQPIRASILEVLCAIVPIPASTAIGPSVIDVFNRLSQHLRISAESTNQKTFQTALVET
TGVLSSVVPDYQKLEAMSFYINRALEAISDHDLREATSADLNYSSLLLQCIQQISKTYKI
NTLSSLSSSLLEPLLKVTLNVGPNDRLIAQNVLLVLLDKNNNRTKLKLVNSESDIDQLGL
VSSTASKQDSEFLDHRLHSIFLWLYECFTLEDNTTDNFQALYKLVSVLCLSVMSPDVILE
LCRIILAAQNSVIENNGESFQLDSSQLTTQLLSSTAACVLVLAHLSAVPEFQHYANQVML
ERNSVAPQIMPNFTPGRKRLNTPLFDSTSLSKIVFSSALISDSLRGRGGFNVEKLSQPLA
SYQIDTVSADGHRGPVDIESINIEFPISREAPSLAAVGVKPVEAITYQYFKQLFNKPPIS
RKEQIEKNNKVAEHIKSVPFEQLMAERPPDPCVIARNWVNQVMEAEDFTEEDDGLEALHF
PSLYAY

Nucleotide sequence

Length: 2,361

>Phfumi.CG.MTP2014.S675.g02532.02.t
ATGGCGAGTTGCTCCTGTTGCCCGGCATTTCGCCCAAGATACAAGCGTCTTGTGGACAAT
ATCTTTCCCTCAGTGCAATCAGAAGGTTTGGTTCGCAGTGAAATGGAAAAGTTGACCTAC
TATGCTGTCTCTGCACCAGAGAAGTTGGACAGAATTGGTGATTACCTGGCAAGGAGATTA
ACAAGAGATATTGCACGGAAAAGAGACAAGTCTGTATTTGTGGCAATGGAAGCCCTTAAT
CAACTACTTTTAGCATGTCATGCTCAGCAGATAAACTTGTTTGTAGAAAGCTTTTTGAAA
ATGGTTGCAACACTGTTAGAATCTGATAACTATGATTTTCAAGCACTTGGAACAAACTCA
TTTGAAAAGTTTTCCAAAATAGAGGAAGACACTGCTTCATATCACAGGAGGTACGATTTT
TTTGTTTCTAAATTTAGTGCAATGTGTCACAGCAATGAAGACAACCTTGCAGCTCGGAGA
AAAATACAACTCCATGGTGTTCATGGATTGAGAGGAGTAATACGCAAAACGGTCAGTGAT
GAGCTGCAGGTCAACATATGGGAGAAACAGCATATGGACAAGATTATTCCATCACTGCTG
TACAGCATGCAAAACAGTCAAGAACAGAATCCTGCAGACACTGACATGGTTCCAGCTTCT
GATGTTGAGCAACCTTCAACACTTGCTGAAGAATCACTGCGTGAGTTACTGTCAAGAGCA
GCTTTTTCCAATGTCCCAGCTGCTATTTACCCTGCATTAGCTCACATGGATAATCATGAG
CTTTGGGCACCTGACAATTCCTTTGCTATTAAGTCTTTTAAAATTATCATGTACTCCATA
CAAGGTCAATACAGTCATGTAATTGTCAAACTGCTGCTGGATCACATTGACACACACAAC
AGTAATGACCAGCCAATTAGAGCAAGCATACTTGAAGTTTTGTGTGCAATTGTCCCGATT
CCAGCATCCACAGCTATTGGACCATCAGTAATTGATGTGTTTAACAGACTATCACAGCAT
TTGAGAATTTCAGCAGAATCTACTAATCAAAAAACCTTTCAAACTGCTTTGGTTGAAACA
ACTGGTGTTCTGTCCAGCGTAGTCCCAGACTACCAAAAACTAGAGGCAATGTCATTTTAT
ATCAACAGAGCACTTGAAGCAATATCTGATCACGATTTACGGGAAGCAACATCAGCTGAC
TTAAACTATTCCAGTTTGTTGTTGCAGTGCATTCAACAAATTTCAAAGACCTACAAAATA
AATACTTTATCTTCATTATCATCCAGTTTGTTAGAACCTCTTCTAAAGGTCACTCTAAAT
GTTGGTCCAAATGACAGGTTAATTGCACAAAATGTGTTGCTGGTTTTGTTGGACAAAAAC
AACAACAGAACAAAACTGAAGTTGGTGAACTCGGAGTCTGACATTGACCAACTTGGTTTG
GTGTCGTCAACTGCAAGCAAGCAAGACAGTGAGTTTTTGGATCATAGATTGCACAGTATT
TTCTTGTGGCTCTATGAATGCTTTACTCTTGAGGATAATACCACTGACAATTTTCAAGCT
TTGTACAAACTAGTATCTGTGCTGTGCTTGTCAGTAATGTCACCTGATGTCATTTTAGAG
TTGTGCCGCATCATTTTGGCTGCTCAAAATTCGGTGATAGAGAACAATGGGGAAAGCTTT
CAATTAGACAGCAGCCAGCTAACAACTCAACTTCTGTCTTCGACAGCTGCATGTGTTTTG
GTGCTAGCACATTTGTCAGCTGTGCCAGAATTTCAGCACTACGCCAACCAAGTGATGCTG
GAGAGGAACTCTGTTGCACCTCAAATCATGCCAAATTTCACACCAGGCCGCAAAAGGTTG
AATACTCCATTGTTCGATTCCACTTCTTTGTCAAAGATTGTTTTTTCCAGTGCATTGATA
TCTGATTCTCTGAGAGGCAGAGGTGGTTTTAATGTAGAAAAATTGAGTCAGCCATTGGCT
AGCTATCAGATAGACACTGTAAGTGCAGATGGCCATCGTGGGCCAGTTGATATTGAATCG
ATCAATATTGAATTCCCAATTAGTAGAGAAGCCCCATCATTGGCAGCAGTCGGTGTTAAA
CCTGTTGAAGCTATCACCTACCAATATTTCAAGCAGCTTTTCAACAAACCACCTATTTCA
AGGAAAGAGCAAATAGAAAAAAATAACAAAGTCGCTGAACATATCAAAAGTGTGCCATTT
GAGCAGTTAATGGCTGAAAGGCCACCGGATCCCTGTGTTATAGCGAGGAACTGGGTAAAT
CAGGTAATGGAGGCTGAGGATTTTACAGAAGAAGATGATGGCTTAGAAGCATTGCATTTT
CCGTCACTATACGCTTACTGA

InterProScan

SUPERFAMILY
ARM-type_fold (IPR016024) - T[16-561] 5.76E-8

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
EFR3A_HUMAN 39.511 % 531 3.49E-178
EFR3B_HUMAN 39.74 % 523 4.51E-175