- Construct 'CONS00001579'
Construct
ID
CONS00001579
Name
p.Cirobu.REG.KhC5.2824518-2829361>H2B::CFP
Min Promoter
Endogenous Promoter
Reporter
Comment
The 4.8kb region upstream of Fgf8/17/18 (Khc5.5) drives CFP expression in A9.30 lineage including motor neurons. H2B tag was fused to mCherry to ensure nuclear localization.
Show sequence
Length: 4,844
GCATAGATTTAAGCCACCTCGTGAAGTGGGCGGGTTTAATTAAAACAAACAGAGCTCCAG
CAATCAGTGCAATCAAGACGTTTGTCGTAGGTTAAAATATTGCTGCTAAAGCCGCTTCTG
ATCAGATAAATTATGATAAAATCAAACCGCATTTGATAACATCTGCTCCGTATTGTTTTG
CCGGTAAGTATGGACATAGACATTAAAAAATGTGGAATAAATATGAAAAACGCGGTATAA
TGATGGACTATAGGTATATGCCTGGTTTGAACCGAAAATGCAAAGGTCACAGATCTAAAG
CTGTTGAACGCAAGGTGTTCAAGCGAAAATTTCTGTGAAACTGCTGTTTGGTATTTTTCC
GATGCTAATTCGGTGCGTTGAGAGAACCCCATGGAATGCTGTAATATGCTAGCGTTTGTT
GTTACAATAAACATACCTAAGTTTAAGCGTTATAAAAAGCAATACACCAAACGTACATGT
ACAGAAAAGTCGTGGTTTACCAATAATGAATAAGTTATGTGTATATATATAGCACCGGTA
TTCTATTCTTATCTCGCAACCTCAGTTTACTGGACTGAAAACAAATCGGGCTTGTCTCCC
TTTGTTCTGAGTCTTGTCCACAACAAAGCGTCAGATTGCGCTGGTTTAATGATCTCGAAT
TTCAGATCATCAGTTTTCAGTTTCCCAAATATTCCAACTATCCAGTACCGCTAGCACAGG
GTACACAAATAGGCTGTGTATCGGCTCTAGCGACTTGACCTCGTCGGTGTTTGTGCAAAT
TTATAATCCCGCCAGCCTAAACAGGGCAAGGGCCGCTGAGGCCGCATTGACATACAAGTA
CGCGGTGCTTGCAAAATATCAGTCCGCAATTTCTCGCAAAAAAACGTGACTGCACTCTCG
GGGTAGCGCATTGTTCCGGCGGCTCCTGCCTGCACGGCGTTTTCATGAATCACGCGGCTG
TCTAATCTACGATCAACGGCCTTAGCCAAAAACCCGGATCGGTAAAAGTTAACACTGTTG
CGAACTCAATACCTCGAAATTCTTGAGGTTACTGCGGTTACCCGGGCCGGATTATCCGTC
AAAAATAAGCGAAGTCGGGTTCAGTTTACGTTTCTCCTAACTATTCCCAACTAAAAATGA
CAATTAAAAAAGGTATCATGATATTGTGATTAGCATGTCATCCAGCAACGAGCTGTGTAT
ATGCAGGAGCATGTTTTCCGAAAGGATTACTATTAATTTTGAAGTTTGATTTCAGAAAAT
CGATTATGAGCAAACAAGTAATGTGCGGAAAAGATTCGTAATACCTTTTTACGAAGCAGT
GTAGCAGTTAAAACAGTAAATCATATTCTGTTACTAAAGCAGTCGATGTTTAAACGGCTG
GGTGTATCTCGCTTTCAAGAGTCGGCGTCGGTGTCCGGAAACCCCGCTTCTCCCAGAGGT
AGTGTTGTGAAAAATGCCGGCCCAGCTATTCTCATTGTTTAGCCTCCGATAATGGGAAAT
ACAACGCGTGTCTGAGATACCGCTTTCCCATTCCTCAAGTACGTTGTTCGCCTGCCTGCC
GTCCATTGACTGCTGGTTAATTACATCAACTTGTTTTATAGGAAACGCTTATCGCACACA
GAGAGCGTGACGCACAGAATCAGAGAGCACATGTAATATAAAGTTGTATGTAAACAAGGG
AGTTTTAGTCCTTAGTGAGCGCCATACGATTGCGATCGGATGTTTATCAGCCTCGGCTAG
TGCACAGTTTAAACGTTCTGATGTTAGTTGCCGAGCCCTCAGCAAGTATGTATACAGCTG
TTTATTTGGGCCTCTGTAGTTCTAGTGTTAAGGAAGGCAGACTCGACTGCACGCTACAAG
CGACAGCGCTTTTTCCATCAATCCAATCACATTTGTTGAGCCCCTTACGGGCACTTGAGG
TGACGGCGCTAATTTCTAAGCAGTTTCGATTGTGTGGGCAGCTTGGCCACAGAGCAAAGC
GCAGAAAACGCGGCGCTTCGCATTGCAGCAGCGCCGAACACTTTGCCAAGGTTGCAGTAT
ATGAATACAGTAGCGCCGCGAAAGACGGAGAGTTTTTAAAGCACAATAAGCGTGCCTGCG
GTCTGTACATACATACAGCAAAATTTTCGGCGTTGTGTAAAGTTGGTCGCGACAACAATA
GCCCTCTCGGTGTTTGGTGCTTGAAGCGGCCCTACAACAGCCCGCTATCATAGGCCGGGA
ATTAGGGCAAGTGGCGGCTTAGCGAGAATTTAATTTTCCTTGTTAAGCAAAATCGTGTGA
AGTGCTTCTGTCCCACGACTGTTCACTTCCTGCGACAACGTATAGTGAGATTGTACTTTT
GTAGCCAAGATACCAATATCAATAATAATATTCAGCTTTGCCCGCTAGGTTGGAGTAAAG
GGTAGATATTAGTTGAGAATAGTTGCGTAATATGATTAAGCTCGTGTACCGGCTTGCTTT
ATATATTTTTGCTAAACAAACAAGTGTAGCGATTAAAATCACTCAGGCCTAAGCCAAGGG
TAAAACCGGTTAATTCGGAGGTTTTAGAAACAGTTATTTTTTGCGGTTTCACTAAACTTA
GAATAAATACCCAAGAATATTATTATAGTTTATAATTTTTTGTTTAAGTTTTTTTTTTTA
AATATCCATTTTTTGGTGATTGTGATTGATTTGTAATAAGATATTTTTAACTTCGATATT
AATGTTTGCTTAAAATTACGAAATAGAGCCGTCTGCTGCGAAGGTTTGTAAAGTGAAACA
ATTAGTGGGCTACTGCAGTTCTACTTTCTGTACAAATATACGCTTTATCACGCTGTCACC
TTGACAGACGTTATTGTAGGAAAGTTTTTGTGCTGAACAATAGCCTTGTAATTAGTTGCG
GGGGGGCCTCTCGGTTCAAGGCCGAATAGATACGACCTCTGATCAGCGGGTCGAAAACGA
ACGTAACAATAGGGAATTATTTCGTGCTGTGACGTCGGCCGAGTGGGGCTGGGAACCATT
TCTAAAACATTCCTGGCATAATGATACGATGTAAGCGCAATATTTCACAAACGAAACAAG
TTTACGTGACTGTAACTGCATAAGCGTTGCTTTGTCACTGGAGGCGCCAACCGCACGATA
AGATATTTCAGCGACGGTCGCAATGAAAACGGACACCCTATTACATGTATGACGGCCGTT
AATACCTCTGTCGCTTTGACACCTTCCAATTGTCGATAACATAACCCGCAACTTGATATT
CTGTGAATATTATGACACCCGGCGCCTTTTGCCTGAATTGTGTAATCGTGCCGCAATATT
CGAAATTGTCCTGGGTTTATTTTTAAAGGCAGACGTCAGAGAAATTGTAATTCTTTACAT
CAGATCTGATAAACCGCTCGATTTCACGGATGTGTTGAACAAGCGCCGTTTCAAACTGTC
GCAGTTTTATTTTTATCTTCGTATAAATTTACAGCGGAATTCATTGAATGCTAAACTGTT
GTATAAAGAAGTGTGCGGAAAGACGGGCCCTGTTGGGACATACTATCAAACTATTCTGAT
CGTGTTTTAAACAATTAACAACGGTATATGGGATTCGCGAGAAAACGGTCTTATAATTTT
TGAATATTCTTTGTTTACTACCGAATAGGACAAGAAAATAGAATGAATAGGTGTCCCATC
TTTCCCCACCCTATACTATATATGAACCACACGTACTCCAAACACACTTAACAGCGTGAC
ATATTTCGCTATTGCGCCAGTTTAAAACACTTTTATCTTGAGTTCAATAGGCATACGTGT
CATAGTTACTACACACGTTGTAACTTTTCCCGTATCGGAAGTTTTTTTTAAAAATTAGGA
CTCTCCTATGACGAATTATATTAATTGCTCCCCTGGCGCGGTTTATTTTGTCTTTTCCCA
CTTATTTTCCTTTGCCCACGTTTTATACAGTTACCTTTAATTTGCTACGCGTTTGCTCGA
CGGGCGGCATGAGCGTTTTGGGGATTATGACGTAACAAAACGGTTTTTAATCTCTTCCTC
TATGTTACGACATAATAGCACCTGTGGAAAAACACAAACCTGTTTTGTTGGGAAGCTGTA
TGGTTGTAAAGGGATGTGTGTTTCGTTTTGTTGGTCTCTGCTAAATACACGAGTGCAATT
TCAGTCAATTACGAATACCAACGTATGAAAAGAATGCGCAGATTTTGCTAATTGGTTTGT
TTACCCTCGTTCGTGCTTGGAATTCTGCAAATTGTTGTTGTGTGGGTTAGAACAATCCAA
TCACCCTGAAAGTTTTTTTAAATGCAGAAGAAAACCATTAATTTTGTGCCCAAAACACCG
TAAGCTGTAGCCAGCACAAGTTCGATATGTGTTCATCAAAAATCGGCGGACTTTTTCTCA
CCGTCGCTTTTTTCCCGCGGCTCCAGCAACGCGTTTGTTAAAAGCGCGTTGCCTACCGTT
ATTTACATTAAACGATGCCGATCGCTGGGCGGTTCGTTATTTTTACTCGTCTGGTAATGG
ACAAAATAACAACCCAGTCGTGTGCTTAGATTTTAGCGGTATGGAGCGCCACGCGCCGAC
CCTCGGGAAGGACATGCTGCACAGCGGGAAACCGAGCTTTAGGATCCGGCAGATAATTTT
ATTCGGAGTCGATGTTAGAATTGTTATAAGTTGTTCAGGATAATAGCAAAGTGAAAGCAG
AAATAAATTTAAACTTTATGCTTTGTATATTTATTCAGTAAGTAGTTAAATAATGTCAAT
TCGGATTTAATGCATTGCGAGTATAAATAGTAAATCCGAATATCAAAGTGATTTCTAAGG
GACATTATTCTTCTCTTGGATTACATACGAAAATGCGACCCTCC
