Login
Help

CONSTRUCT

Submit your Data

  1. Construct 'CONS00001162'
  2. Construct 'CONS00000636'
  3. Construct 'CONS00001594'
  4. Construct 'CONS00000110'
  5. Construct 'CONS00001553'

Construct

ID

CONS00001553

Name

p.Cirobu.REG.KhC1.9619886-9623328>RFP

Min Promoter

Endogenous Promoter

Reporter

RFP

Comment

The 5kb upstream of Asic (KH:C1.215) TSS drives RFP expression in the sensory vesicle and visceral ganglion in the trunk and in bipolar tail neurons. This TSS drives the short splicing form of ASIC (ASICa) and is located in the fourth intron of the gene model.

This construct is testing Regulatory Region

REG00001501: Cirobu.REG.KhC1.9619886-9623328|Asic

Sequence

Show sequence

Length: 3,443

CCTATTCATACACCCGCTGACGAATTACCATATATGTAACTTAATTAATCAACATCATTC
ATCTGCTCACAGTTAGTTAGTAGCAAGACAACCACTGGAGGTTCCAATCCTTATTTTTCC
GCTTCACTTCAACTTTGTCGTCGTTTCAAGATGGCTTTAGAACTAATCAGGCGATTTTCA
GGCGAGAATTTTTTCTTGAAAACGAAATATTTGAGAGAATTTGCCCCAACTTAAAACAGA
ATCAAAATTCCACATGGTTCACGATAATGCATTAGTTAAAGTAGTAACTTAAAATAGGGG
GCTTAATAAGACTTTACATTGGAAATTTTCACCCAACGTATTACACAACGCATAAGAACA
TGGAAAACCGCACAGTCCACGATAGAATCCATTAATTAGAAAAGTTGCTTAAAATATCCG
AAGCGAGTTTACGTTTTCTTGTTTAACCATATGTCGGGCTCTACAAGGATGACGTTGTGA
CGTCACAGCGGATCTACGCAAAGCTCCGCGGTGCGCGAAATCTGGCGTTCATTAAATATT
CATTCGCTGCCTTCTAAGAATTATCCCCGCGAGTCAATGACGTGTTCGAAGTACAGATTC
TTGGTTCCTTCGATAATTTTGCCGAAACGACCTTCTCTCAAAATATCACCGGTTTCGAAA
GAATTATTTTACGTCAGCAGTTTAGAGCATTTATTAAAGTTTATCAATTTAGGTAAACGT
GCCCAAATTAATGTATAATGAATCGCCTACCTTAATGGTAACCAATTAGGAAAAATCCTG
AAAATACCGTCTGATTTAGCGCCTATTTTAAAAATTTTGTTTTATAAAATGTTAACGAAT
CGTTTGAAATTTAAAAAAACAATAAATTACGAAAACCGTTTAAATTACCCATGCTGCCTT
GTTCCGGAAGTGACGCAAAGCGACATCCGTCCATCTAAATTAATGCAGAATTCGTAAGTT
TGAAGTTCATCATCGATTTTAGATCATGCGTTGCGGTTATGTAAAGACATAGCGACGTGC
TAATGGAAAGAATGTACTTGTGGTGTTTTATGCGGGCTGGTAGAAATGTATTCGTTGATA
TCTATGAGAAAAATGTAACTTTACTAGACGTGAAATAATGTGGATATGTCGGTATATAGG
TCCGGGTAACTTGCGTTTTAACATCGCTCGGATTTCATATTACTGGAAAATATTATTTAT
TGCTTTTGCACTGTTACGTACCGTGTGTCTGGTCTATAACAAGCCCCCGTTTTATAACTC
GAAATTAAGCACGAGGTGTATCAATACCACATGTGTGTCTGGTGTATATAATCATAGTAT
ACTGAAGTCACTTCAGTATACTATGATAAAATGGCACCCAGAATGTCATAACTCGACATA
AAGTAAGCATAAACTGTAACTATTATAACTTTAAATAACAAGAAAGTAAGGTATATTATT
TTGCCACAACAACAGTGTGTTTTTAACTAAACAAAAACGTTCCGTATATCGGTATAAACA
TAAAGATCTTACACCTATCATCACAGCTCTGCTGCGCGGTGCATCAAATGGGCACGAGCC
ATTTAGCAAATCGACAGGCTGTCGGCTTTCACATTTAAAAGTCGTGATGCGAACATAAGT
GTCTTCCCCAAGGCGCAATAAACAGCCCTGATTAATGAGCATTCAGTGAAGCATTTACGG
ATTCTTAATTAAAATGTAAAAGTAGGATTTAATGGACTTGTAATTTATGCTTAAAATAAT
GAAAGACACACAAAGAGATTTCTACAATTTTTTAGTATGGTTTTAGTCCTTTAAAATAGG
CTCACTTACTGTATGGTTGGAAGTTTTATAAAAAAAATTTATAGATTCTATAATTAAACA
TAACATATTTTTTATGTATCTTTTTGAACCTATTAAAAATGCAACGAAAATAAGGGGATT
TACAACAAATGACGTTTATTAAACGCATAATGTATACAAAATGTCTGGAAAACAAAATTT
ATTAAAAAGTAAAACTCAACATAAAATGAAATATATGAAGTAGTATTTTTTATAAAAACA
ATAATTTTAAAACCTCACCTTGACTCTATATCAGTGTAAGCCATATGTCACTCAAACCTA
TGCCTTAATTAAGGAATAATCAGTAATTATTTCTAAAAATAAAGACGTCTTGTTAACAAC
AATGACTTTTTAGTTCCATACCCGGGGTATGGCCGTACAATTCCCCTGACTATTTATACC
CCTATTATACTAGTTGACTGATGATCGATCGTTGTTCATATTCTATGCTACGCGTCGCGA
ATCCCCTTTGGGGGTTACTTCATTAACTAAAGGCGAAAGATTTCTCATGCAAGTCCAGAA
TTCGTTGGGTGTTCTAGAAATGGTCATACCGTTGTCCAACCCATTGTTGTATCATTGTGC
GGTCTCGCGCGTACGCGGCGGTCGCTTTTCGTTCTGGTGTTGGGTTCTAGAATAGTTTTC
GAGCATATGTATGTTAGGGCCAAAGGCTACGAAGACGTAACAGATAAAAACCAAGCAAAA
CAATTAGTCTAAACTACCATTATTCGTCTAATTTTAAATATAATTCAGAATGTTTGTTGC
AATACTAAAACAGAGTTTTAAAATGAGCAAATAATCAAAGTACAGAAAGTGGGAAGTTAT
TTTAGGAATATAATAAAGTTAGTTTAAAGTTTATTTATGAGAGTGGAAGTGTGCGGATAA
CTAAAACGTGTTCTAAAATAAAAAAATGCTAAAATTAATTAAGTGATCTTTTTTGTAGTA
GGTTGGGGTAAGATGGTCTATATTTTTATTCTCTTGGGATATTACGTGCCTAACGGTTTC
TATCTTACCCCATAGTACTAAACATAAATACGCTGTTGTACAAGTTAAAAAAGTTCTTCG
AGTAATAAAGCGATGTTAGCAGTAGTAACATTCAATAAATTGTTAAAAACTAAACCAAAA
AAATTGGTAACAAAGTTTTAAATAAAGTCGTTATTGTTCATTTTAGGTCTTTTTATTTCA
CAACTCATTCCATCTATCCAGGAATAACCGTTGTGTGTAATTTGTTCATCGAACCGGCGA
GGATAAAAAGAATATTTTCCGTCCTTCATTAGTTTTTCGTACGCTAGAAGAGAGTAATCA
ATACTGAGACAGCACCTCTGCCTTACGCTCTCTTTTCATATAGCAACTTTCACATGCAAA
GCAGAGTTTTAGCTCTACAGTATAAGATAACATAACAACGGTAGTTTCAAGAGTTTTTTA
AAGTCCTAAGGTATTATTCAGTTTGGCAAGTTTAGTTTTTGGTCTGTAATAAGGCAAAAG
TATGTGGAAATGCAATAATGTTAGATAATATTGCAGTTTTAATGTTTGCAGGCGAAAATA
GATAAAAAAGGAGTTGTAAAATATACAAAGTTCGCATTGGTTTAGGGGGTTTACCTGCTC
TGTGACACGTAACAGTGCATTTT