Aniseed - Construct

Construct 'CONS00001543'

Construct

ID

CONS00001543

Name

p.Cirobu.REG.KhC5.2824518-2829361>NLS::LacZ

Min Promoter

Endogenous Promoter

Reporter

LacZ

Comment

The 4.8kb region upstream of Fgf8/17/18 (Khc5.5) drives LacZ expression in A9.30 lineage including motor neurons. NLS tag was fused to reporter protein to ensure nuclear localization.

This construct is testing Regulatory Region

REG00001502: Cirobu.REG.KhC5.2824518-2829361|Fgf8/17/18

Sequence

Show sequence

Length: 4,844

GCATAGATTTAAGCCACCTCGTGAAGTGGGCGGGTTTAATTAAAACAAACAGAGCTCCAG
CAATCAGTGCAATCAAGACGTTTGTCGTAGGTTAAAATATTGCTGCTAAAGCCGCTTCTG
ATCAGATAAATTATGATAAAATCAAACCGCATTTGATAACATCTGCTCCGTATTGTTTTG
CCGGTAAGTATGGACATAGACATTAAAAAATGTGGAATAAATATGAAAAACGCGGTATAA
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ATGCAGGAGCATGTTTTCCGAAAGGATTACTATTAATTTTGAAGTTTGATTTCAGAAAAT
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GGTGTATCTCGCTTTCAAGAGTCGGCGTCGGTGTCCGGAAACCCCGCTTCTCCCAGAGGT
AGTGTTGTGAAAAATGCCGGCCCAGCTATTCTCATTGTTTAGCCTCCGATAATGGGAAAT
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GTCCATTGACTGCTGGTTAATTACATCAACTTGTTTTATAGGAAACGCTTATCGCACACA
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AGTTTTAGTCCTTAGTGAGCGCCATACGATTGCGATCGGATGTTTATCAGCCTCGGCTAG
TGCACAGTTTAAACGTTCTGATGTTAGTTGCCGAGCCCTCAGCAAGTATGTATACAGCTG
TTTATTTGGGCCTCTGTAGTTCTAGTGTTAAGGAAGGCAGACTCGACTGCACGCTACAAG
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GCAGAAAACGCGGCGCTTCGCATTGCAGCAGCGCCGAACACTTTGCCAAGGTTGCAGTAT
ATGAATACAGTAGCGCCGCGAAAGACGGAGAGTTTTTAAAGCACAATAAGCGTGCCTGCG
GTCTGTACATACATACAGCAAAATTTTCGGCGTTGTGTAAAGTTGGTCGCGACAACAATA
GCCCTCTCGGTGTTTGGTGCTTGAAGCGGCCCTACAACAGCCCGCTATCATAGGCCGGGA
ATTAGGGCAAGTGGCGGCTTAGCGAGAATTTAATTTTCCTTGTTAAGCAAAATCGTGTGA
AGTGCTTCTGTCCCACGACTGTTCACTTCCTGCGACAACGTATAGTGAGATTGTACTTTT
GTAGCCAAGATACCAATATCAATAATAATATTCAGCTTTGCCCGCTAGGTTGGAGTAAAG
GGTAGATATTAGTTGAGAATAGTTGCGTAATATGATTAAGCTCGTGTACCGGCTTGCTTT
ATATATTTTTGCTAAACAAACAAGTGTAGCGATTAAAATCACTCAGGCCTAAGCCAAGGG
TAAAACCGGTTAATTCGGAGGTTTTAGAAACAGTTATTTTTTGCGGTTTCACTAAACTTA
GAATAAATACCCAAGAATATTATTATAGTTTATAATTTTTTGTTTAAGTTTTTTTTTTTA
AATATCCATTTTTTGGTGATTGTGATTGATTTGTAATAAGATATTTTTAACTTCGATATT
AATGTTTGCTTAAAATTACGAAATAGAGCCGTCTGCTGCGAAGGTTTGTAAAGTGAAACA
ATTAGTGGGCTACTGCAGTTCTACTTTCTGTACAAATATACGCTTTATCACGCTGTCACC
TTGACAGACGTTATTGTAGGAAAGTTTTTGTGCTGAACAATAGCCTTGTAATTAGTTGCG
GGGGGGCCTCTCGGTTCAAGGCCGAATAGATACGACCTCTGATCAGCGGGTCGAAAACGA
ACGTAACAATAGGGAATTATTTCGTGCTGTGACGTCGGCCGAGTGGGGCTGGGAACCATT
TCTAAAACATTCCTGGCATAATGATACGATGTAAGCGCAATATTTCACAAACGAAACAAG
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AATACCTCTGTCGCTTTGACACCTTCCAATTGTCGATAACATAACCCGCAACTTGATATT
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GCAGTTTTATTTTTATCTTCGTATAAATTTACAGCGGAATTCATTGAATGCTAAACTGTT
GTATAAAGAAGTGTGCGGAAAGACGGGCCCTGTTGGGACATACTATCAAACTATTCTGAT
CGTGTTTTAAACAATTAACAACGGTATATGGGATTCGCGAGAAAACGGTCTTATAATTTT
TGAATATTCTTTGTTTACTACCGAATAGGACAAGAAAATAGAATGAATAGGTGTCCCATC
TTTCCCCACCCTATACTATATATGAACCACACGTACTCCAAACACACTTAACAGCGTGAC
ATATTTCGCTATTGCGCCAGTTTAAAACACTTTTATCTTGAGTTCAATAGGCATACGTGT
CATAGTTACTACACACGTTGTAACTTTTCCCGTATCGGAAGTTTTTTTTAAAAATTAGGA
CTCTCCTATGACGAATTATATTAATTGCTCCCCTGGCGCGGTTTATTTTGTCTTTTCCCA
CTTATTTTCCTTTGCCCACGTTTTATACAGTTACCTTTAATTTGCTACGCGTTTGCTCGA
CGGGCGGCATGAGCGTTTTGGGGATTATGACGTAACAAAACGGTTTTTAATCTCTTCCTC
TATGTTACGACATAATAGCACCTGTGGAAAAACACAAACCTGTTTTGTTGGGAAGCTGTA
TGGTTGTAAAGGGATGTGTGTTTCGTTTTGTTGGTCTCTGCTAAATACACGAGTGCAATT
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TTACCCTCGTTCGTGCTTGGAATTCTGCAAATTGTTGTTGTGTGGGTTAGAACAATCCAA
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TAAGCTGTAGCCAGCACAAGTTCGATATGTGTTCATCAAAAATCGGCGGACTTTTTCTCA
CCGTCGCTTTTTTCCCGCGGCTCCAGCAACGCGTTTGTTAAAAGCGCGTTGCCTACCGTT
ATTTACATTAAACGATGCCGATCGCTGGGCGGTTCGTTATTTTTACTCGTCTGGTAATGG
ACAAAATAACAACCCAGTCGTGTGCTTAGATTTTAGCGGTATGGAGCGCCACGCGCCGAC
CCTCGGGAAGGACATGCTGCACAGCGGGAAACCGAGCTTTAGGATCCGGCAGATAATTTT
ATTCGGAGTCGATGTTAGAATTGTTATAAGTTGTTCAGGATAATAGCAAAGTGAAAGCAG
AAATAAATTTAAACTTTATGCTTTGTATATTTATTCAGTAAGTAGTTAAATAATGTCAAT
TCGGATTTAATGCATTGCGAGTATAAATAGTAAATCCGAATATCAAAGTGATTTCTAAGG
GACATTATTCTTCTCTTGGATTACATACGAAAATGCGACCCTCC

Reference(s)

Stolfi et al. (2011). Neuronal subtype specification in the spinal cord of a protovertebrate. Development 138(5):995-1004

Lowe et al. (2018). Developmental system drift in motor ganglion patterning between distantly related tunicates. Evodevo 9():18

Stolfi et al. (2011). Neural tube patterning by Ephrin, FGF and Notch signaling relays. Development 138(24):5429-39

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