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  1. Construct 'CONS00001124'

Construct

ID

CONS00001124

Name

Ci-Hox1(i2Dp3)/lacZ

Reporter

LacZ

Comment

Internal deletion of a part the second intron of Hox1 gene of ciona intestinalis, placed upstream a putative translation initiation site of Ci-Hox1 (located in the second exon) and upstream the 160bp 5' flanking region, and a lacZ reporter sequence.

This construct is testing Regulatory Region

:

Sequence

Show sequence

Length: 3,335

GTAAGTTGTAAAGTTTAACACAGACTTAACGATAGGACTACGCACGCTCCTATTAATTTT
CAGTTTTAAGCGAGCTCCGCCATTTTGTTACAGTTTAAGGTGACACGAGAAAGCAAGTGC
GAAGCTGTATTTCATATTAAAAACGATCATACTGCTATTCCCAAAAGAAACACGCAATTA
TCGTCACATAGATTTCGTTTTCTTGATTAAGGCTTAATTAGTAAGTAAATGAGCAATTAT
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TCGCCTCATTGCGCGTATTTTACGAGGCGGGTAGTGACTATTATCATATTTTATCTAAGG
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GTGACACCTTTTCATTCGATTTTATCGTCACATTTAAACAAAAAATATTCAAAAAATATA
TAAAACCGTATCCTCATGAGACTACTATAGACCGGTGTTAATTGTTTTAAACACGATCCG
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TGCAGCAGTCATTGTGCTTATCTTGGTTTAAAAGGTAATCGTTCCGCATAATTAGCATGT
TGCTTTAGTAAAGGAGATATGGTCACGTGGTGTGTCGATCACCGTTTTTCGACTTTCTGT
TTATAAAATACATTACAACATCACCAATACTATACCACCAAAAGGAACACGCTATTACGC
TTAAAAATACAAGTTTCGTATAGAGTAGGTTACGATGAGATGGTCTATGTTTTCATTCTC
TATTATAATCCCATTTAGTATTAAACAACGAATATTTGTGGGTTTATATAATCGTATCTT
CGCGACCTTGAAAGCGCGTGATTATTTGTTTAAAACACGGTTAGAAAAAAATATGGAATT
TTATGTGCAAATGGTACCCTACTATATTTATTGGCATTAAAATTGCGTGGCCGCTGCCCG
ACGCGAACGGCTATGCGTTACTTTCAGCTAAAGTACTCTTTTAACATGTATTGCTCTTTA
TTGCTGTTATTAGATTTATAAAACTTGTTTCCAAATAAGAATTATAGTGTGGTTATCTGT
GCAGCACAATGTGCTTATATACGACGCCAGGTTAGAACACCTTGAACTGGAGTATAGATG
CTAAATTTCTCGAATAAAAGCAATGCACATTGAAAACAGATTTTACCTAAAATATATAAA
ATTAAGCCGAGTATATTTGTACTAACGTTGCTATGTTGCGTCTTGTTCAAGCAACAAGAT
ATTGCCGCTTAATGCACTGGGAAACCGTGGAACATCAAGTACGGTAACCATTAAGACGAA
TAGCGCACAGCACGCGTATTTCTATTTATCATTAGCGTGTAATATTGGAGTTATAATTAC
GGAATGCAGATTACAATATCTGTTTTGCTCCCATGGCCTCGATCAATTGCATTGTGTCCT
CATTTGTCAACTGAAGCATTGCAATTGGCATTATTATTCCATTATCGAAACAAAAGCTGG
CGTTACGCGTGGTTGGTCCACGGAGACCAATCTCAGTCACGCGTTTGGGTGTCGCTTTTC
GTCACTTCGATTTTTAAACAAAATGTGAGATATCGTTCACCATCTGACAATTTTTATATT
GTAAACCAACATTGATCATTCGAAAAAATCTTTTATCGTTTTTTAACTTTTTCAAAAAGA
AGCGTTTCATAGCTTTAAATAAAATGAACTGGAATTAATTTAATATAAAAAATTGTATAA
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ATGCTACGAATTAATACTATCATTCCCTTATTACAACTCAAAAACCGATTAAAACACACG
AGGAGTTATTTAGCGATTCACACAACAGATGTAATTTTACCAGCTCGAAAACAAACAGGG
TGAGACGGGGCAGTTTAAAACCATTGTTAATTTTTTTCTGAAAATTAAGTTTAAACATTC
TTCTCCTTGCTCTCTAATGCTATAGTTTTTAGCAGGTTACCCAAACCTACATTATATTAT
TTTATGAAAATTGGTTTTGTTTAAACAATAATGAGTATTGTTCGAACATCAATTAATGAA
TACTATATTCTAGAAATGCATATGAACTTGCAAAAGCAGAAAATTGATAATAATTATCAA
TGAAGTTTACCTTTCTGCTACATTTGGATATTGCTACGTTATATTTCACACAAGCCACTT
TTCATATTTTACCTCCAACAAGTGCCCGTGACTAAATTTCCAATATACTTTTCATAAAAG
TTTTTAATTAACCTGTATAATATATTTCTTTCCATGCAGCTGTTAGTTTACCTATCTAAA
TTAACGAGCACTACTAGTTTATTTGCCACGTAAACATTATATATAAAACAAAATACAAAA
CTTCGGAGACCTACAAAAGTTCGGAAGCTTTTAATATGGTTTAGCGAGCATTTTTAAAGA
ACAAATACTTTAATATTACGATTTTTTCAGCCATCGAAAAAAAGCTTTCTTGAACACCGA
ATTGTTTTTAGTGAGGAAGAGTCATCGGCATTGCGCGCGCTTTATATAGATTTTAGATTG
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