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CONSTRUCT

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  1. Construct 'CONS00000111'
  2. Construct 'CONS00001128'

Construct

ID

CONS00001128

Name

Ci-Hox1(i2Dp2)/lacZ

Reporter

LacZ

Comment

A approx. 3,56kb region corresponding to the second intron of Hox1 gene of ciona intestinalis and with deletion of 127nt of the Ci-Hox1(i2)/lacZ construct. It was placed upstream a putative translation initiation site of Ci-Hox1 (located in the second exon) and upstream the 160bp 5' flanking region, and a lacZ reporter sequence.

This construct is testing Regulatory Region

:

Sequence

Show sequence

Length: 3,436

GTAAGTTGTAAAGTTTAACACAGACTTAACGATAGGACTACGCACGCTCCTATTAATTTT
CAGTTTTAAGCGAGCTCCGCCATTTTGTTACAGTTTAAGGTGACACGAGAAAGCAAGTGC
GAAGCTGTATTTCATATTAAAAACGATCATACTGCTATTCCCAAAAGAAACACGCAATTA
TCGTCACATAGATTTCGTTTTCTTGATTAAGGCTTAATTAGTAAGTAAATGAGCAATTAT
TTCGGAGATTTGGAAAGATCGATTACAAATCAACATTGTACATGGTATTCACGTTCGGTT
CACTCAAAACAACCGATCGTCAATTTATAGTATAGAAATAGTTTAAATAAAAAATTGTTA
CTTAAGTTTAATGTTCAAACATAAAACATTCCTTTAACAAATGTTTTGGACCACCCATCG
TCACATAACTAACTTCATTTATCATCGTCAAATGATATTTTGCCAGGGTCGCATTTATAT
ACCTTTCGCGATGTTTTATGGTAAAGTTCAGTTCGTTTTAGCCTTTTCATGACCCCAATG
TTCGCATTTTGGTCGACCGTTTCTCTCTATCAGATCCCGCGTGACATCATAATAGAGAAA
GTAGTGAAATAAAAGACAGATTGAGTAGTTACTTGCTTTATTTATTGGCGCATCGTAGGT
TCGCCTCATTGCGCGTATTTTACGAGGCGGGTAGTGACTATTATCATATTTTATCTAAGG
TATTTATACGCGTCATTATAGAAAATATTTTGAATTTATAAATTTAGGCCGTGACATGCT
TTAACAACTTTTTGTACGGTTAAAACTAATCGCAATATATAAAGTCCTAATAGTAGGGTT
GTGACACCTTTTCATTCGATTTTATCGTCACATTTAAACAAAAAATATTCAAAAAATATA
TAAAACCGTATCCTCATGAGACTACTATAGACCGGTGTTAATTGTTTTAAACACGATCCG
AAAATGTGGACATTATGTACCAAAGGTGTTCCGTCTTCTCCCATAGTACTTGATATCAAT
GCCTAATAAGGCTATGTGTCCACTATTTGTTTTTGCGTTTTTCGACTTTCTGTTTATAAA
ATACATTACAACATCACCAATACTATACCACCAAAAGGAACACGCTATTACGCTTAAAAA
TACAAGTTTCGTATAGAGTAGGTTACGATGAGATGGTCTATGTTTTCATTCTCTATTATA
ATCCCATTTAGTATTAAACAACGAATATTTGTGGGTTTATATAATCGTATCTTCGCGACC
TTGAAAGCGCGTGATTATTTGTTTAAAACACGGTTAGAAAAAAATATGGAATTTTATGTG
CAAATGGTACCCTACTATATTTATTGGCATTAAAATTGCGTGGTCAAAGGGAACGTTGTC
GTTTCAATGGTCCCTTTATCCGTCATGTGAATGATATCGAAACGCCGCGGGGTAGATGCT
GGGTTCATGAACTCTCTGTCCTTTCGCTCACACTATATCTTTGCGGCGTTGGGCGTATCG
ATACCACGGTAAATATGTACACATCGTCGTGTCCTTGTCTACCAGTCATCCGTAAAATCG
ACCCAAAACCACAAAAAATTCTACGGGTTTTCCGCTGCCCGACGCGAACGGCTATGCGTT
ACTTTCAGCTAAAGTACTCTTTTAACATGTATTGCTCTTTATTGCTGTTATTAGATTTAT
AAAACTTGTTTCCAAATAAGAATTATAGTGTGGTTATCTGTGCAGCACAATGTGCTTATA
TACGACGCCAGGTTAGAACACCTTGAACTGGAGTATAGATGCTAAATTTCTCGAATAAAA
GCAATGCACATTGAAAACAGATTTTACCTAAAATATATAAAATTAAGCCGAGTATATTTG
TACTAACGTTGCTATGTTGCGTCTTGTTCAAGCAACAAGATATTGCCGCTTAATGCACTG
GGAAACCGTGGAACATCAAGTACGGTAACCATTAAGACGAATAGCGCACAGCACGCGTAT
TTCTATTTATCATTAGCGTGTAATATTGGAGTTATAATTACGGAATGCAGATTACAATAT
CTGTTTTGCTCCCATGGCCTCGATCAATTGCATTGTGTCCTCATTTGTCAACTGAAGCAT
TGCAATTGGCATTATTATTCCATTATCGAAACAAAAGCTGGCGTTACGCGTGGTTGGTCC
ACGGAGACCAATCTCAGTCACGCGTTTGGGTGTCGCTTTTCGTCACTTCGATTTTTAAAC
AAAATGTGAGATATCGTTCACCATCTGACAATTTTTATATTGTAAACCAACATTGATCAT
TCGAAAAAATCTTTTATCGTTTTTTAACTTTTTCAAAAAGAAGCGTTTCATAGCTTTAAA
TAAAATGAACTGGAATTAATTTAATATAAAAAATTGTATAAATACATCTGTCCAGCTTTA
ACAGTTTATTCATGCATTAACAAAATGGTGTGAAAGATGTGACATTTAAGGACATATTTC
CCAATATTTAAAAAAATAAAATAGATGATGGTTTTCGGGTGATGCTACGAATTAATACTA
TCATTCCCTTATTACAACTCAAAAACCGATTAAAACACACGAGGAGTTATTTAGCGATTC
ACACAACAGATGTAATTTTACCAGCTCGAAAACAAACAGGGTGAGACGGGGCAGTTTAAA
ACCATTGTTAATTTTTTTCTGAAAATTAAGTTTAAACATTCTTCTCCTTGCTCTCTAATG
CTATAGTTTTTAGCAGGTTACCCAAACCTACATTATATTATTTTATGAAAATTGGTTTTG
TTTAAACAATAATGAGTATTGTTCGAACATCAATTAATGAATACTATATTCTAGAAATGC
ATATGAACTTGCAAAAGCAGAAAATTGATAATAATTATCAATGAAGTTTACCTTTCTGCT
ACATTTGGATATTGCTACGTTATATTTCACACAAGCCACTTTTCATATTTTACCTCCAAC
AAGTGCCCGTGACTAAATTTCCAATATACTTTTCATAAAAGTTTTTAATTAACCTGTATA
ATATATTTCTTTCCATGCAGCTGTTAGTTTACCTATCTAAATTAACGAGCACTACTAGTT
TATTTGCCACGTAAACATTATATATAAAACAAAATACAAAACTTCGGAGACCTACAAAAG
TTCGGAAGCTTTTAATATGGTTTAGCGAGCATTTTTAAAGAACAAATACTTTAATATTAC
GATTTTTTCAGCCATCGAAAAAAAGCTTTCTTGAACACCGAATTGTTTTTAGTGAGGAAG
AGTCATCGGCATTGCGCGCGCTTTATATAGATTTTAGATTGTATTGTAGAATAATCCTGT
AAAATTATTTGTGTTAACCCGTAAAACATGAGTACCGGGAAAAGGTTTCCCATCTTACCT
CACCGTACTATATAATAGGTTCGTAATTAGTAAATATTAACCTACATACACTAACAATGT
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